RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000279387.11

PPP4C-201, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4C, Length 1,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-201ENST00000279387 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.94■■■■■ 7.03
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PPP4C-201ENST00000279387 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.49■■■■■ 5.51
PPP4C-201ENST00000279387 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.36■■■■■ 5.49
PPP4C-201ENST00000279387 NACADO15069 1562 aa49.24■■■■■ 5.47
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PPP4C-201ENST00000279387 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.8■■■■■ 5.4
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PPP4C-201ENST00000279387 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.17■■■■■ 5.14
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PPP4C-201ENST00000279387 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.54■■■■■ 5.04
PPP4C-201ENST00000279387 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.21■■■■■ 4.99
PPP4C-201ENST00000279387 SMARCA4P51532 1647 aa45.79■■■■■ 4.92
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PPP4C-201ENST00000279387 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.51■■■■■ 4.88
PPP4C-201ENST00000279387 NCAPD3P42695 1498 aa45.43■■■■■ 4.86
PPP4C-201ENST00000279387 SMARCA2P51531 1590 aa45.41■■■■■ 4.86
PPP4C-201ENST00000279387 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.23■■■■■ 4.83
PPP4C-201ENST00000279387 HMGXB3Q12766 1538 aa45.21■■■■■ 4.83
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PPP4C-201ENST00000279387 WIZO95785 1651 aa45.07■■■■■ 4.81
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PPP4C-201ENST00000279387 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.28■■■■■ 4.68
PPP4C-201ENST00000279387 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.15■■■■■ 4.66
PPP4C-201ENST00000279387 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.04■■■■■ 4.64
PPP4C-201ENST00000279387 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.99■■■■■ 4.63
PPP4C-201ENST00000279387 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.97■■■■■ 4.63
PPP4C-201ENST00000279387 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
PPP4C-201ENST00000279387 CFTRP13569 1480 aa43.86■■■■■ 4.61
PPP4C-201ENST00000279387 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
PPP4C-201ENST00000279387 CUX2O14529 1486 aa43.77■■■■■ 4.6
PPP4C-201ENST00000279387 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.71■■■■■ 4.59
PPP4C-201ENST00000279387 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.64■■■■■ 4.58
PPP4C-201ENST00000279387 PRDM2Q13029 1718 aa43.6■■■■■ 4.57
PPP4C-201ENST00000279387 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.57■■■■■ 4.57
PPP4C-201ENST00000279387 WDR62O43379 1518 aa43.42■■■■■ 4.54
PPP4C-201ENST00000279387 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
PPP4C-201ENST00000279387 TOPBP1Q92547 1522 aa43.01■■■■■ 4.48
PPP4C-201ENST00000279387 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.92■■■■■ 4.46
PPP4C-201ENST00000279387 ABCC8Q09428 1581 aa42.84■■■■■ 4.45
PPP4C-201ENST00000279387 CUX1P39880 1505 aa42.68■■■■■ 4.42
PPP4C-201ENST00000279387 IFT140Q96RY7 1462 aa42.68■■■■■ 4.42
PPP4C-201ENST00000279387 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.42
PPP4C-201ENST00000279387 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.42
PPP4C-201ENST00000279387 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.58■■■■■ 4.41
PPP4C-201ENST00000279387 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.55■■■■■ 4.4
PPP4C-201ENST00000279387 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.54■■■■■ 4.4
PPP4C-201ENST00000279387 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.53■■■■■ 4.4
PPP4C-201ENST00000279387 SOGA1O94964 1423 aa42.45■■■■■ 4.39
PPP4C-201ENST00000279387 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
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PPP4C-201ENST00000279387 SYNJ1O43426 1573 aa42.32■■■■■ 4.37
PPP4C-201ENST00000279387 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
PPP4C-201ENST00000279387 TOP2BQ02880 1626 aa42.25■■■■■ 4.35
PPP4C-201ENST00000279387 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.25■■■■■ 4.35
PPP4C-201ENST00000279387 WDR97A6NE52 1622 aa42.18■■■■■ 4.34
PPP4C-201ENST00000279387 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.05■■■■■ 4.32
PPP4C-201ENST00000279387 OSCARQ8IYS5 282 aa42.01■■■■■ 4.32
PPP4C-201ENST00000279387 CHD1O14646 1710 aa41.97■■■■■ 4.31
PPP4C-201ENST00000279387 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.96■■■■■ 4.31
PPP4C-201ENST00000279387 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.95■■■■■ 4.31
PPP4C-201ENST00000279387 PBRM1Q86U86 1689 aa41.95■■■■■ 4.31
PPP4C-201ENST00000279387 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.94■■■■■ 4.3
PPP4C-201ENST00000279387 FBLN2P98095 1184 aa41.94■■■■■ 4.3
PPP4C-201ENST00000279387 GRIN2BQ13224 1484 aa41.92■■■■■ 4.3
PPP4C-201ENST00000279387 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
PPP4C-201ENST00000279387 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
PPP4C-201ENST00000279387 SYNJ2O15056 1496 aa41.66■■■■■ 4.26
PPP4C-201ENST00000279387 ADAMTS12P58397 1594 aa41.55■■■■■ 4.24
PPP4C-201ENST00000279387 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.52■■■■■ 4.24
PPP4C-201ENST00000279387 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.44■■■■■ 4.22
PPP4C-201ENST00000279387 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.44■■■■■ 4.22
PPP4C-201ENST00000279387 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.44■■■■■ 4.22
PPP4C-201ENST00000279387 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.42■■■■■ 4.22
PPP4C-201ENST00000279387 KIF27Q86VH2 1401 aa41.42■■■■■ 4.22
PPP4C-201ENST00000279387 GRIN2AQ12879 1464 aa41.41■■■■■ 4.22
PPP4C-201ENST00000279387 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.4■■■■■ 4.22
PPP4C-201ENST00000279387 ARHGEF11O15085 1522 aa41.38■■■■■ 4.22
PPP4C-201ENST00000279387 TRIM41Q8WV44 630 aa41.35■■■■■ 4.21
PPP4C-201ENST00000279387 IGF1RP08069 1367 aa41.29■■■■■ 4.2
PPP4C-201ENST00000279387 CEP170Q5SW79 1584 aa41.27■■■■■ 4.2
PPP4C-201ENST00000279387 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.21■■■■■ 4.19
PPP4C-201ENST00000279387 NUP160Q12769 1436 aa41.18■■■■■ 4.18
PPP4C-201ENST00000279387 CUL7Q14999 1698 aa41.17■■■■■ 4.18
PPP4C-201ENST00000279387 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.07■■■■■ 4.16
PPP4C-201ENST00000279387 ARAP1Q96P48 1450 aa41.07■■■■■ 4.16
PPP4C-201ENST00000279387 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.05■■■■■ 4.16
PPP4C-201ENST00000279387 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.97■■■■■ 4.15
PPP4C-201ENST00000279387 SHROOM2Q13796 1616 aa40.91■■■■■ 4.14
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