RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219066.5

NTHL1-201, Transcript of nth like DNA glycosylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NTHL1, Length 1,067 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1-201ENST00000219066 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.59■■■■■ 6.97
NTHL1-201ENST00000219066 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.32■■■■■ 5.97
NTHL1-201ENST00000219066 ABCC9O60706 1549 aa51.75■■■■■ 5.88
NTHL1-201ENST00000219066 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.5■■■■■ 5.52
NTHL1-201ENST00000219066 NACADO15069 1562 aa49.29■■■■■ 5.48
NTHL1-201ENST00000219066 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.97■■■■■ 5.43
NTHL1-201ENST00000219066 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.84■■■■■ 5.41
NTHL1-201ENST00000219066 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.82■■■■■ 5.41
NTHL1-201ENST00000219066 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.51■■■■■ 5.36
NTHL1-201ENST00000219066 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.45■■■■■ 5.35
NTHL1-201ENST00000219066 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.21■■■■■ 5.31
NTHL1-201ENST00000219066 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.11■■■■■ 5.29
NTHL1-201ENST00000219066 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.07■■■■■ 5.29
NTHL1-201ENST00000219066 SCRIBQ14160 1630 aa47.69■■■■■ 5.22
NTHL1-201ENST00000219066 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.49■■■■■ 5.19
NTHL1-201ENST00000219066 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.86■■■■■ 5.09
NTHL1-201ENST00000219066 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.81■■■■■ 5.08
NTHL1-201ENST00000219066 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.57■■■■■ 5.04
NTHL1-201ENST00000219066 SMARCA4P51532 1647 aa45.56■■■■■ 4.88
NTHL1-201ENST00000219066 NCAPD3P42695 1498 aa45.49■■■■■ 4.87
NTHL1-201ENST00000219066 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
NTHL1-201ENST00000219066 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.45■■■■■ 4.87
NTHL1-201ENST00000219066 SMARCA2P51531 1590 aa45.33■■■■■ 4.85
NTHL1-201ENST00000219066 HMGXB3Q12766 1538 aa45.25■■■■■ 4.83
NTHL1-201ENST00000219066 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.14■■■■■ 4.82
NTHL1-201ENST00000219066 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.14■■■■■ 4.82
NTHL1-201ENST00000219066 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.02■■■■■ 4.8
NTHL1-201ENST00000219066 WIZO95785 1651 aa44.69■■■■■ 4.74
NTHL1-201ENST00000219066 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.64■■■■■ 4.74
NTHL1-201ENST00000219066 NESP48681 1621 aa44.64■■■■■ 4.74
NTHL1-201ENST00000219066 ERCC6Q03468 1493 aa44.61■■■■■ 4.73
NTHL1-201ENST00000219066 CUX2O14529 1486 aa44.4■■■■■ 4.7
NTHL1-201ENST00000219066 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.39■■■■■ 4.7
NTHL1-201ENST00000219066 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
NTHL1-201ENST00000219066 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
NTHL1-201ENST00000219066 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.11■■■■■ 4.65
NTHL1-201ENST00000219066 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.1■■■■■ 4.65
NTHL1-201ENST00000219066 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.07■■■■■ 4.64
NTHL1-201ENST00000219066 CFTRP13569 1480 aa43.76■■■■■ 4.6
NTHL1-201ENST00000219066 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.71■■■■■ 4.59
NTHL1-201ENST00000219066 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.7■■■■■ 4.59
NTHL1-201ENST00000219066 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.67■■■■■ 4.58
NTHL1-201ENST00000219066 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.64■■■■■ 4.58
NTHL1-201ENST00000219066 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.64■■■■■ 4.58
NTHL1-201ENST00000219066 WDR62O43379 1518 aa43.63■■■■■ 4.57
NTHL1-201ENST00000219066 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
NTHL1-201ENST00000219066 PRDM2Q13029 1718 aa43.4■■■■■ 4.54
NTHL1-201ENST00000219066 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
NTHL1-201ENST00000219066 TOPBP1Q92547 1522 aa42.88■■■■■ 4.46
NTHL1-201ENST00000219066 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.78■■■■■ 4.44
NTHL1-201ENST00000219066 ABCC8Q09428 1581 aa42.76■■■■■ 4.44
NTHL1-201ENST00000219066 IFT140Q96RY7 1462 aa42.74■■■■■ 4.43
NTHL1-201ENST00000219066 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.66■■■■■ 4.42
NTHL1-201ENST00000219066 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
NTHL1-201ENST00000219066 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
NTHL1-201ENST00000219066 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
NTHL1-201ENST00000219066 CUX1P39880 1505 aa42.36■■■■■ 4.37
NTHL1-201ENST00000219066 OSCARQ8IYS5 282 aa42.34■■■■■ 4.37
NTHL1-201ENST00000219066 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.3■■■■■ 4.36
NTHL1-201ENST00000219066 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.29■■■■■ 4.36
NTHL1-201ENST00000219066 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.29■■■■■ 4.36
NTHL1-201ENST00000219066 SOGA1O94964 1423 aa42.23■■■■■ 4.35
NTHL1-201ENST00000219066 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.13■■■■■ 4.34
NTHL1-201ENST00000219066 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
NTHL1-201ENST00000219066 WDR97A6NE52 1622 aa42.09■■■■■ 4.33
NTHL1-201ENST00000219066 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.06■■■■■ 4.32
NTHL1-201ENST00000219066 TOP2BQ02880 1626 aa42.04■■■■■ 4.32
NTHL1-201ENST00000219066 CHD1O14646 1710 aa42.03■■■■■ 4.32
NTHL1-201ENST00000219066 SYNJ1O43426 1573 aa42.02■■■■■ 4.32
NTHL1-201ENST00000219066 TRIM41Q8WV44 630 aa41.98■■■■■ 4.31
NTHL1-201ENST00000219066 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.91■■■■■ 4.3
NTHL1-201ENST00000219066 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.87■■■■■ 4.29
NTHL1-201ENST00000219066 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.87■■■■■ 4.29
NTHL1-201ENST00000219066 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.87■■■■■ 4.29
NTHL1-201ENST00000219066 GRIN2BQ13224 1484 aa41.85■■■■■ 4.29
NTHL1-201ENST00000219066 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.85■■■■■ 4.29
NTHL1-201ENST00000219066 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
NTHL1-201ENST00000219066 FBLN2P98095 1184 aa41.8■■■■■ 4.28
NTHL1-201ENST00000219066 ARHGEF11O15085 1522 aa41.79■■■■■ 4.28
NTHL1-201ENST00000219066 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.78■■■■■ 4.28
NTHL1-201ENST00000219066 PBRM1Q86U86 1689 aa41.77■■■■■ 4.28
NTHL1-201ENST00000219066 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.76■■■■■ 4.28
NTHL1-201ENST00000219066 SYNJ2O15056 1496 aa41.66■■■■■ 4.26
NTHL1-201ENST00000219066 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.59■■■■■ 4.25
NTHL1-201ENST00000219066 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
NTHL1-201ENST00000219066 ARAP1Q96P48 1450 aa41.43■■■■■ 4.22
NTHL1-201ENST00000219066 ADAMTS12P58397 1594 aa41.42■■■■■ 4.22
NTHL1-201ENST00000219066 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.34■■■■■ 4.21
NTHL1-201ENST00000219066 GRIN2AQ12879 1464 aa41.33■■■■■ 4.21
NTHL1-201ENST00000219066 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.32■■■■■ 4.21
NTHL1-201ENST00000219066 KIF27Q86VH2 1401 aa41.27■■■■■ 4.2
NTHL1-201ENST00000219066 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.25■■■■■ 4.19
NTHL1-201ENST00000219066 CEP170Q5SW79 1584 aa41.2■■■■■ 4.19
NTHL1-201ENST00000219066 NUP160Q12769 1436 aa41.18■■■■■ 4.18
NTHL1-201ENST00000219066 IGF1RP08069 1367 aa41.01■■■■■ 4.16
NTHL1-201ENST00000219066 CUL7Q14999 1698 aa41.01■■■■■ 4.16
NTHL1-201ENST00000219066 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.99■■■■■ 4.15
NTHL1-201ENST00000219066 SHROOM2Q13796 1616 aa40.97■■■■■ 4.15
NTHL1-201ENST00000219066 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.84■■■■■ 4.13
NTHL1-201ENST00000219066 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.81■■■■■ 4.12
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