RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441908.6

PQLC3-204, Transcript of PQ loop repeat containing 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PQLC3, Length 1,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC3-204ENST00000441908 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.41■■■■■ 6.94
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PQLC3-204ENST00000441908 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.36■■■■■ 5.33
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PQLC3-204ENST00000441908 SCRIBQ14160 1630 aa47.36■■■■■ 5.17
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PQLC3-204ENST00000441908 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.56■■■■■ 4.88
PQLC3-204ENST00000441908 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.36■■■■■ 4.85
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PQLC3-204ENST00000441908 SMARCA2P51531 1590 aa44.75■■■■■ 4.75
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PQLC3-204ENST00000441908 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.68■■■■■ 4.74
PQLC3-204ENST00000441908 NCAPD3P42695 1498 aa44.64■■■■■ 4.74
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PQLC3-204ENST00000441908 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.09■■■■■ 4.49
PQLC3-204ENST00000441908 PRDM2Q13029 1718 aa43.04■■■■■ 4.48
PQLC3-204ENST00000441908 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.97■■■■■ 4.47
PQLC3-204ENST00000441908 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.86■■■■■ 4.45
PQLC3-204ENST00000441908 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
PQLC3-204ENST00000441908 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.65■■■■■ 4.42
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PQLC3-204ENST00000441908 ABCC8Q09428 1581 aa42.36■■■■■ 4.37
PQLC3-204ENST00000441908 CUX2O14529 1486 aa42.35■■■■■ 4.37
PQLC3-204ENST00000441908 TOPBP1Q92547 1522 aa42.35■■■■■ 4.37
PQLC3-204ENST00000441908 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.32■■■■■ 4.37
PQLC3-204ENST00000441908 CUX1P39880 1505 aa42.27■■■■■ 4.36
PQLC3-204ENST00000441908 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.18■■■■■ 4.34
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PQLC3-204ENST00000441908 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
PQLC3-204ENST00000441908 TRIM41Q8WV44 630 aa41.64■■■■■ 4.26
PQLC3-204ENST00000441908 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.62■■■■■ 4.25
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PQLC3-204ENST00000441908 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.5■■■■■ 4.23
PQLC3-204ENST00000441908 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.41■■■■■ 4.22
PQLC3-204ENST00000441908 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.39■■■■■ 4.22
PQLC3-204ENST00000441908 PBRM1Q86U86 1689 aa41.33■■■■■ 4.21
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PQLC3-204ENST00000441908 KIF27Q86VH2 1401 aa41.22■■■■■ 4.19
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PQLC3-204ENST00000441908 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.19■■■■■ 4.18
PQLC3-204ENST00000441908 FBLN2P98095 1184 aa41.09■■■■■ 4.17
PQLC3-204ENST00000441908 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.08■■■■■ 4.17
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PQLC3-204ENST00000441908 SYNJ2O15056 1496 aa40.94■■■■■ 4.14
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PQLC3-204ENST00000441908 OSCARQ8IYS5 282 aa40.79■■■■■ 4.12
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PQLC3-204ENST00000441908 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.71■■■■■ 4.11
PQLC3-204ENST00000441908 CEP170Q5SW79 1584 aa40.6■■■■■ 4.09
PQLC3-204ENST00000441908 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.59■■■■■ 4.09
PQLC3-204ENST00000441908 PRXQ9BXM0 1461 aa40.56■■■■■ 4.08
PQLC3-204ENST00000441908 NUP160Q12769 1436 aa40.52■■■■■ 4.08
PQLC3-204ENST00000441908 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.5■■■■■ 4.07
PQLC3-204ENST00000441908 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.48■■■■■ 4.07
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PQLC3-204ENST00000441908 KIF21BO75037 1637 aa40.34■■■■■ 4.05
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