RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561292.1

PRTG-204, Transcript of protogenin, human

TSL 3 BASIC

Gene PRTG, Length 833 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRTG-204	ENST00000561292	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		58.26	■■■■■ 6.92
PRTG-204	ENST00000561292	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		52.06	■■■■■ 5.92
PRTG-204	ENST00000561292	ABCC9	O60706	1549 aa		51.61	■■■■■ 5.85
PRTG-204	ENST00000561292	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		49.33	■■■■■ 5.49
PRTG-204	ENST00000561292	NACAD	O15069	1562 aa		49.11	■■■■■ 5.45
PRTG-204	ENST00000561292	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		48.94	■■■■■ 5.43
PRTG-204	ENST00000561292	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		48.61	■■■■■ 5.37
PRTG-204	ENST00000561292	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.39	■■■■■ 5.34
PRTG-204	ENST00000561292	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		48.21	■■■■■ 5.31
PRTG-204	ENST00000561292	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		48.16	■■■■■ 5.3
PRTG-204	ENST00000561292	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	48.12	■■■■■ 5.29
PRTG-204	ENST00000561292	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		48.01	■■■■■ 5.28
PRTG-204	ENST00000561292	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		47.89	■■■■■ 5.26
PRTG-204	ENST00000561292	SCRIB	Q14160	1630 aa		47.46	■■■■■ 5.19
PRTG-204	ENST00000561292	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		47.29	■■■■■ 5.16
PRTG-204	ENST00000561292	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	46.67	■■■■■ 5.06
PRTG-204	ENST00000561292	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		46.65	■■■■■ 5.06
PRTG-204	ENST00000561292	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		46.44	■■■■■ 5.03
PRTG-204	ENST00000561292	NCAPD3	P42695	1498 aa		45.35	■■■■■ 4.85
PRTG-204	ENST00000561292	SMARCA4	P51532	1647 aa		45.34	■■■■■ 4.85
PRTG-204	ENST00000561292	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.28	■■■■■ 4.84
PRTG-204	ENST00000561292	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.18	■■■■■ 4.82
PRTG-204	ENST00000561292	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.16	■■■■■ 4.82
PRTG-204	ENST00000561292	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.05	■■■■■ 4.8
PRTG-204	ENST00000561292	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		44.9	■■■■■ 4.78
PRTG-204	ENST00000561292	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		44.9	■■■■■ 4.78
PRTG-204	ENST00000561292	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	44.85	■■■■■ 4.77
PRTG-204	ENST00000561292	ERCC6	Q03468	1493 aa		44.52	■■■■■ 4.72
PRTG-204	ENST00000561292	NES	P48681	1621 aa		44.47	■■■■■ 4.71
PRTG-204	ENST00000561292	WIZ	O95785	1651 aa		44.37	■■■■■ 4.69
PRTG-204	ENST00000561292	CUX2	O14529	1486 aa		44.29	■■■■■ 4.68
PRTG-204	ENST00000561292	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		44.24	■■■■■ 4.67
PRTG-204	ENST00000561292	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.14	■■■■■ 4.66
PRTG-204	ENST00000561292	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		43.99	■■■■■ 4.63
PRTG-204	ENST00000561292	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		43.97	■■■■■ 4.63
PRTG-204	ENST00000561292	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	43.93	■■■■■ 4.62
PRTG-204	ENST00000561292	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		43.91	■■■■■ 4.62
PRTG-204	ENST00000561292	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	43.85	■■■■■ 4.61
PRTG-204	ENST00000561292	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		43.73	■■■■■ 4.59
PRTG-204	ENST00000561292	CFTR	P13569	1480 aa		43.59	■■■■■ 4.57
PRTG-204	ENST00000561292	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		43.56	■■■■■ 4.56
PRTG-204	ENST00000561292	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		43.48	■■■■■ 4.55
PRTG-204	ENST00000561292	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		43.48	■■■■■ 4.55
PRTG-204	ENST00000561292	WDR62	O43379	1518 aa		43.44	■■■■■ 4.54
PRTG-204	ENST00000561292	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.35	■■■■■ 4.53
PRTG-204	ENST00000561292	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.17	■■■■■ 4.5
PRTG-204	ENST00000561292	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.1	■■■■■ 4.49
PRTG-204	ENST00000561292	TOPBP1	Q92547	1522 aa		42.71	■■■■■ 4.43
PRTG-204	ENST00000561292	ABCC8	Q09428	1581 aa		42.65	■■■■■ 4.42
PRTG-204	ENST00000561292	IFT140	Q96RY7	1462 aa		42.6	■■■■■ 4.41
PRTG-204	ENST00000561292	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		42.6	■■■■■ 4.41
PRTG-204	ENST00000561292	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	42.51	■■■■■ 4.4
PRTG-204	ENST00000561292	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	42.49	■■■■■ 4.39
PRTG-204	ENST00000561292	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		42.34	■■■■■ 4.37
PRTG-204	ENST00000561292	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.31	■■■■■ 4.36
PRTG-204	ENST00000561292	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.3	■■■■■ 4.36
PRTG-204	ENST00000561292	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
PRTG-204	ENST00000561292	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	42.17	■■■■■ 4.34
PRTG-204	ENST00000561292	CUX1	P39880	1505 aa		42.15	■■■■■ 4.34
PRTG-204	ENST00000561292	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.15	■■■■■ 4.34
PRTG-204	ENST00000561292	SOGA1	O94964	1423 aa		42.12	■■■■■ 4.33
PRTG-204	ENST00000561292	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.11	■■■■■ 4.33
PRTG-204	ENST00000561292	TRIM41	Q8WV44	630 aa		42	■■■■■ 4.31
PRTG-204	ENST00000561292	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	41.98	■■■■■ 4.31
PRTG-204	ENST00000561292	WDR97	A6NE52	1622 aa		41.9	■■■■■ 4.3
PRTG-204	ENST00000561292	CHD1	O14646	1710 aa		41.86	■■■■■ 4.29
PRTG-204	ENST00000561292	FBLN2	P98095	1184 aa		41.77	■■■■■ 4.28
PRTG-204	ENST00000561292	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		41.74	■■■■■ 4.27
PRTG-204	ENST00000561292	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		41.74	■■■■■ 4.27
PRTG-204	ENST00000561292	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		41.74	■■■■■ 4.27
PRTG-204	ENST00000561292	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		41.74	■■■■■ 4.27
PRTG-204	ENST00000561292	GRIN2B	Q13224	1484 aa		41.7	■■■■■ 4.27
PRTG-204	ENST00000561292	ARHGEF11	O15085	1522 aa		41.67	■■■■■ 4.26
PRTG-204	ENST00000561292	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		41.67	■■■■■ 4.26
PRTG-204	ENST00000561292	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	41.66	■■■■■ 4.26
PRTG-204	ENST00000561292	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	41.62	■■■■■ 4.25
PRTG-204	ENST00000561292	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		41.62	■■■■■ 4.25
PRTG-204	ENST00000561292	TOP2B	Q02880	1626 aa		41.6	■■■■■ 4.25
PRTG-204	ENST00000561292	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.6	■■■■■ 4.25
PRTG-204	ENST00000561292	PBRM1	Q86U86	1689 aa		41.56	■■■■■ 4.24
PRTG-204	ENST00000561292	SYNJ1	O43426	1573 aa		41.56	■■■■■ 4.24
PRTG-204	ENST00000561292	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		41.55	■■■■■ 4.24
PRTG-204	ENST00000561292	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	41.55	■■■■■ 4.24
PRTG-204	ENST00000561292	SYNJ2	O15056	1496 aa		41.51	■■■■■ 4.24
PRTG-204	ENST00000561292	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		41.41	■■■■■ 4.22
PRTG-204	ENST00000561292	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		41.32	■■■■■ 4.21
PRTG-204	ENST00000561292	ARAP1	Q96P48	1450 aa		41.29	■■■■■ 4.2
PRTG-204	ENST00000561292	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.2	■■■■■ 4.19
PRTG-204	ENST00000561292	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.17	■■■■■ 4.18
PRTG-204	ENST00000561292	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.15	■■■■■ 4.18
PRTG-204	ENST00000561292	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.11	■■■■■ 4.17
PRTG-204	ENST00000561292	NUP160	Q12769	1436 aa		41.02	■■■■■ 4.16
PRTG-204	ENST00000561292	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41	■■■■■ 4.15
PRTG-204	ENST00000561292	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		40.8	■■■■■ 4.12
PRTG-204	ENST00000561292	KIF27	Q86VH2	1401 aa		40.8	■■■■■ 4.12
PRTG-204	ENST00000561292	SHROOM2	Q13796	1616 aa		40.78	■■■■■ 4.12
PRTG-204	ENST00000561292	IGF1R	P08069	1367 aa		40.74	■■■■■ 4.11
PRTG-204	ENST00000561292	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	40.7	■■■■■ 4.11
PRTG-204	ENST00000561292	CUL7	Q14999	1698 aa		40.63	■■■■■ 4.1
PRTG-204	ENST00000561292	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		40.62	■■■■■ 4.09

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