RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316803.7

CABP1-202, Transcript of calcium binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CABP1, Length 1,658 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1-202ENST00000316803 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.92■■■■■ 6.86
CABP1-202ENST00000316803 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.08■■■■■ 5.77
CABP1-202ENST00000316803 ABCC9O60706 1549 aa48.91■■■■■ 5.42
CABP1-202ENST00000316803 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.48■■■■■ 5.35
CABP1-202ENST00000316803 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.99■■■■■ 5.27
CABP1-202ENST00000316803 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.93■■■■■ 5.26
CABP1-202ENST00000316803 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.81■■■■■ 5.24
CABP1-202ENST00000316803 NACADO15069 1562 aa47.75■■■■■ 5.23
CABP1-202ENST00000316803 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.55■■■■■ 5.2
CABP1-202ENST00000316803 SCRIBQ14160 1630 aa46.67■■■■■ 5.06
CABP1-202ENST00000316803 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.5■■■■■ 5.03
CABP1-202ENST00000316803 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.37■■■■■ 5.01
CABP1-202ENST00000316803 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.04■■■■■ 4.96
CABP1-202ENST00000316803 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.85■■■■■ 4.93
CABP1-202ENST00000316803 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.97■■■■■ 4.79
CABP1-202ENST00000316803 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.85■■■■■ 4.77
CABP1-202ENST00000316803 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
CABP1-202ENST00000316803 SMARCA4P51532 1647 aa44.74■■■■■ 4.75
CABP1-202ENST00000316803 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.64■■■■■ 4.74
CABP1-202ENST00000316803 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.51■■■■■ 4.72
CABP1-202ENST00000316803 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.31■■■■■ 4.68
CABP1-202ENST00000316803 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.29■■■■■ 4.68
CABP1-202ENST00000316803 SMARCA2P51531 1590 aa44.24■■■■■ 4.67
CABP1-202ENST00000316803 WIZO95785 1651 aa44.24■■■■■ 4.67
CABP1-202ENST00000316803 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.2■■■■■ 4.67
CABP1-202ENST00000316803 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
CABP1-202ENST00000316803 NCAPD3P42695 1498 aa44.01■■■■■ 4.64
CABP1-202ENST00000316803 HMGXB3Q12766 1538 aa43.94■■■■■ 4.62
CABP1-202ENST00000316803 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
CABP1-202ENST00000316803 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.85■■■■■ 4.61
CABP1-202ENST00000316803 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
CABP1-202ENST00000316803 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.29■■■■■ 4.52
CABP1-202ENST00000316803 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.79■■■■■ 4.44
CABP1-202ENST00000316803 CFTRP13569 1480 aa42.77■■■■■ 4.44
CABP1-202ENST00000316803 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.73■■■■■ 4.43
CABP1-202ENST00000316803 NESP48681 1621 aa42.63■■■■■ 4.41
CABP1-202ENST00000316803 PRDM2Q13029 1718 aa42.61■■■■■ 4.41
CABP1-202ENST00000316803 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.39■■■■■ 4.38
CABP1-202ENST00000316803 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.31■■■■■ 4.36
CABP1-202ENST00000316803 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.2■■■■■ 4.35
CABP1-202ENST00000316803 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.18■■■■■ 4.34
CABP1-202ENST00000316803 ERCC6Q03468 1493 aa42.11■■■■■ 4.33
CABP1-202ENST00000316803 ABCC8Q09428 1581 aa42.04■■■■■ 4.32
CABP1-202ENST00000316803 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.97■■■■■ 4.31
CABP1-202ENST00000316803 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.89■■■■■ 4.3
CABP1-202ENST00000316803 CUX1P39880 1505 aa41.83■■■■■ 4.29
CABP1-202ENST00000316803 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.83■■■■■ 4.29
CABP1-202ENST00000316803 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.82■■■■■ 4.29
CABP1-202ENST00000316803 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
CABP1-202ENST00000316803 SYNJ1O43426 1573 aa41.81■■■■■ 4.28
CABP1-202ENST00000316803 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
CABP1-202ENST00000316803 TOP2BQ02880 1626 aa41.78■■■■■ 4.28
CABP1-202ENST00000316803 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.77■■■■■ 4.28
CABP1-202ENST00000316803 TOPBP1Q92547 1522 aa41.75■■■■■ 4.27
CABP1-202ENST00000316803 WDR62O43379 1518 aa41.72■■■■■ 4.27
CABP1-202ENST00000316803 TRIM41Q8WV44 630 aa41.69■■■■■ 4.26
CABP1-202ENST00000316803 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.53■■■■■ 4.24
CABP1-202ENST00000316803 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
CABP1-202ENST00000316803 CUX2O14529 1486 aa41.31■■■■■ 4.2
CABP1-202ENST00000316803 SOGA1O94964 1423 aa41.31■■■■■ 4.2
CABP1-202ENST00000316803 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.26■■■■■ 4.19
CABP1-202ENST00000316803 IFT140Q96RY7 1462 aa41.24■■■■■ 4.19
CABP1-202ENST00000316803 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
CABP1-202ENST00000316803 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.18■■■■■ 4.18
CABP1-202ENST00000316803 WDR97A6NE52 1622 aa41.16■■■■■ 4.18
CABP1-202ENST00000316803 KIF27Q86VH2 1401 aa41.01■■■■■ 4.16
CABP1-202ENST00000316803 EEA1Q15075 1411 aa40.95■■■■■ 4.15
CABP1-202ENST00000316803 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.94■■■■■ 4.14
CABP1-202ENST00000316803 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
CABP1-202ENST00000316803 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
CABP1-202ENST00000316803 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.91■■■■■ 4.14
CABP1-202ENST00000316803 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.87■■■■■ 4.13
CABP1-202ENST00000316803 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
CABP1-202ENST00000316803 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.83■■■■■ 4.13
CABP1-202ENST00000316803 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
CABP1-202ENST00000316803 PBRM1Q86U86 1689 aa40.76■■■■■ 4.11
CABP1-202ENST00000316803 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.73■■■■■ 4.11
CABP1-202ENST00000316803 GRIN2BQ13224 1484 aa40.72■■■■■ 4.11
CABP1-202ENST00000316803 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.69■■■■■ 4.1
CABP1-202ENST00000316803 IGF1RP08069 1367 aa40.67■■■■■ 4.1
CABP1-202ENST00000316803 CUL7Q14999 1698 aa40.59■■■■■ 4.09
CABP1-202ENST00000316803 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.52■■■■■ 4.08
CABP1-202ENST00000316803 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
CABP1-202ENST00000316803 ADAMTS12P58397 1594 aa40.48■■■■■ 4.07
CABP1-202ENST00000316803 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.47■■■■■ 4.07
CABP1-202ENST00000316803 PRXQ9BXM0 1461 aa40.47■■■■■ 4.07
CABP1-202ENST00000316803 KIF21BO75037 1637 aa40.45■■■■■ 4.07
CABP1-202ENST00000316803 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.44■■■■■ 4.06
CABP1-202ENST00000316803 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.37■■■■■ 4.05
CABP1-202ENST00000316803 SYNJ2O15056 1496 aa40.34■■■■■ 4.05
CABP1-202ENST00000316803 GOLGA3Q08378 1498 aa40.29■■■■■ 4.04
CABP1-202ENST00000316803 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
CABP1-202ENST00000316803 GRIN2AQ12879 1464 aa40.2■■■■■ 4.03
CABP1-202ENST00000316803 CHD1O14646 1710 aa40.17■■■■■ 4.02
CABP1-202ENST00000316803 FBLN2P98095 1184 aa40.15■■■■■ 4.02
CABP1-202ENST00000316803 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.15■■■■■ 4.02
CABP1-202ENST00000316803 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.09■■■■■ 4.01
CABP1-202ENST00000316803 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
CABP1-202ENST00000316803 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.99■■■■□ 3.99
CABP1-202ENST00000316803 NUP160Q12769 1436 aa39.97■■■■□ 3.99
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