RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367368.2

LRP11-202, Transcript of LDL receptor related protein 11, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LRP11, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP11-202ENST00000367368 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.95■■■■■ 6.87
LRP11-202ENST00000367368 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.71■■■■■ 5.87
LRP11-202ENST00000367368 ABCC9O60706 1549 aa51.65■■■■■ 5.86
LRP11-202ENST00000367368 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.19■■■■■ 5.46
LRP11-202ENST00000367368 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.05■■■■■ 5.44
LRP11-202ENST00000367368 NACADO15069 1562 aa48.91■■■■■ 5.42
LRP11-202ENST00000367368 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.29■■■■■ 5.32
LRP11-202ENST00000367368 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.23■■■■■ 5.31
LRP11-202ENST00000367368 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.17■■■■■ 5.3
LRP11-202ENST00000367368 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.09■■■■■ 5.29
LRP11-202ENST00000367368 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.89■■■■■ 5.26
LRP11-202ENST00000367368 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.81■■■■■ 5.24
LRP11-202ENST00000367368 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.7■■■■■ 5.23
LRP11-202ENST00000367368 SCRIBQ14160 1630 aa47.32■■■■■ 5.17
LRP11-202ENST00000367368 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.08■■■■■ 5.13
LRP11-202ENST00000367368 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.56■■■■■ 5.04
LRP11-202ENST00000367368 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
LRP11-202ENST00000367368 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.47■■■■■ 5.03
LRP11-202ENST00000367368 NCAPD3P42695 1498 aa45.19■■■■■ 4.82
LRP11-202ENST00000367368 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.13■■■■■ 4.82
LRP11-202ENST00000367368 SMARCA4P51532 1647 aa45.1■■■■■ 4.81
LRP11-202ENST00000367368 SMARCA2P51531 1590 aa44.98■■■■■ 4.79
LRP11-202ENST00000367368 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.95■■■■■ 4.79
LRP11-202ENST00000367368 HMGXB3Q12766 1538 aa44.84■■■■■ 4.77
LRP11-202ENST00000367368 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
LRP11-202ENST00000367368 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.69■■■■■ 4.74
LRP11-202ENST00000367368 ERCC6Q03468 1493 aa44.6■■■■■ 4.73
LRP11-202ENST00000367368 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.6■■■■■ 4.73
LRP11-202ENST00000367368 NESP48681 1621 aa44.43■■■■■ 4.7
LRP11-202ENST00000367368 CUX2O14529 1486 aa44.3■■■■■ 4.68
LRP11-202ENST00000367368 WIZO95785 1651 aa44.11■■■■■ 4.65
LRP11-202ENST00000367368 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.08■■■■■ 4.65
LRP11-202ENST00000367368 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.98■■■■■ 4.63
LRP11-202ENST00000367368 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.92■■■■■ 4.62
LRP11-202ENST00000367368 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
LRP11-202ENST00000367368 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.9■■■■■ 4.62
LRP11-202ENST00000367368 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.8■■■■■ 4.6
LRP11-202ENST00000367368 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.72■■■■■ 4.59
LRP11-202ENST00000367368 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.6■■■■■ 4.57
LRP11-202ENST00000367368 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.5■■■■■ 4.55
LRP11-202ENST00000367368 CFTRP13569 1480 aa43.41■■■■■ 4.54
LRP11-202ENST00000367368 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.4■■■■■ 4.54
LRP11-202ENST00000367368 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.39■■■■■ 4.54
LRP11-202ENST00000367368 WDR62O43379 1518 aa43.32■■■■■ 4.52
LRP11-202ENST00000367368 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.15■■■■■ 4.5
LRP11-202ENST00000367368 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
LRP11-202ENST00000367368 PRDM2Q13029 1718 aa42.77■■■■■ 4.44
LRP11-202ENST00000367368 TOPBP1Q92547 1522 aa42.57■■■■■ 4.41
LRP11-202ENST00000367368 IFT140Q96RY7 1462 aa42.52■■■■■ 4.4
LRP11-202ENST00000367368 ABCC8Q09428 1581 aa42.48■■■■■ 4.39
LRP11-202ENST00000367368 OSCARQ8IYS5 282 aa42.45■■■■■ 4.39
LRP11-202ENST00000367368 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
LRP11-202ENST00000367368 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.42■■■■■ 4.38
LRP11-202ENST00000367368 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
LRP11-202ENST00000367368 TRIM41Q8WV44 630 aa42.33■■■■■ 4.37
LRP11-202ENST00000367368 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
LRP11-202ENST00000367368 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
LRP11-202ENST00000367368 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.12■■■■■ 4.33
LRP11-202ENST00000367368 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
LRP11-202ENST00000367368 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.06■■■■■ 4.32
LRP11-202ENST00000367368 SOGA1O94964 1423 aa42.04■■■■■ 4.32
LRP11-202ENST00000367368 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.98■■■■■ 4.31
LRP11-202ENST00000367368 CUX1P39880 1505 aa41.96■■■■■ 4.31
LRP11-202ENST00000367368 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
LRP11-202ENST00000367368 FBLN2P98095 1184 aa41.91■■■■■ 4.3
LRP11-202ENST00000367368 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.72■■■■■ 4.27
LRP11-202ENST00000367368 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.72■■■■■ 4.27
LRP11-202ENST00000367368 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.72■■■■■ 4.27
LRP11-202ENST00000367368 CHD1O14646 1710 aa41.69■■■■■ 4.27
LRP11-202ENST00000367368 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.69■■■■■ 4.26
LRP11-202ENST00000367368 ARHGEF11O15085 1522 aa41.67■■■■■ 4.26
LRP11-202ENST00000367368 WDR97A6NE52 1622 aa41.65■■■■■ 4.26
LRP11-202ENST00000367368 GRIN2BQ13224 1484 aa41.6■■■■■ 4.25
LRP11-202ENST00000367368 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
LRP11-202ENST00000367368 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
LRP11-202ENST00000367368 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.51■■■■■ 4.24
LRP11-202ENST00000367368 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.48■■■■■ 4.23
LRP11-202ENST00000367368 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.48■■■■■ 4.23
LRP11-202ENST00000367368 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.44■■■■■ 4.23
LRP11-202ENST00000367368 SYNJ2O15056 1496 aa41.41■■■■■ 4.22
LRP11-202ENST00000367368 SYNJ1O43426 1573 aa41.33■■■■■ 4.21
LRP11-202ENST00000367368 TOP2BQ02880 1626 aa41.32■■■■■ 4.2
LRP11-202ENST00000367368 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.32■■■■■ 4.2
LRP11-202ENST00000367368 PBRM1Q86U86 1689 aa41.32■■■■■ 4.2
LRP11-202ENST00000367368 ARAP1Q96P48 1450 aa41.3■■■■■ 4.2
LRP11-202ENST00000367368 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.28■■■■■ 4.2
LRP11-202ENST00000367368 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.27■■■■■ 4.2
LRP11-202ENST00000367368 GRIN2AQ12879 1464 aa41.05■■■■■ 4.16
LRP11-202ENST00000367368 ADAMTS12P58397 1594 aa41.03■■■■■ 4.16
LRP11-202ENST00000367368 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41■■■■■ 4.15
LRP11-202ENST00000367368 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
LRP11-202ENST00000367368 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.94■■■■■ 4.14
LRP11-202ENST00000367368 NUP160Q12769 1436 aa40.89■■■■■ 4.14
LRP11-202ENST00000367368 CEP170Q5SW79 1584 aa40.86■■■■■ 4.13
LRP11-202ENST00000367368 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.72■■■■■ 4.11
LRP11-202ENST00000367368 KIF27Q86VH2 1401 aa40.64■■■■■ 4.1
LRP11-202ENST00000367368 IGF1RP08069 1367 aa40.58■■■■■ 4.09
LRP11-202ENST00000367368 JPH4Q96JJ6 628 aa40.57■■■■■ 4.09
LRP11-202ENST00000367368 SHROOM2Q13796 1616 aa40.56■■■■■ 4.08
LRP11-202ENST00000367368 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
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