RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421612.6

ZSCAN18-202, Transcript of zinc finger and SCAN domain containing 18, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ZSCAN18, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN18-202ENST00000421612 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.89■■■■■ 6.86
ZSCAN18-202ENST00000421612 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.06■■■■■ 5.76
ZSCAN18-202ENST00000421612 ABCC9O60706 1549 aa49.61■■■■■ 5.53
ZSCAN18-202ENST00000421612 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.35■■■■■ 5.33
ZSCAN18-202ENST00000421612 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.3■■■■■ 5.32
ZSCAN18-202ENST00000421612 NACADO15069 1562 aa47.91■■■■■ 5.26
ZSCAN18-202ENST00000421612 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.86■■■■■ 5.25
ZSCAN18-202ENST00000421612 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.8■■■■■ 5.24
ZSCAN18-202ENST00000421612 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.8■■■■■ 5.24
ZSCAN18-202ENST00000421612 SCRIBQ14160 1630 aa46.77■■■■■ 5.08
ZSCAN18-202ENST00000421612 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.67■■■■■ 5.06
ZSCAN18-202ENST00000421612 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.44■■■■■ 5.02
ZSCAN18-202ENST00000421612 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.33■■■■■ 5.01
ZSCAN18-202ENST00000421612 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.31■■■■■ 5
ZSCAN18-202ENST00000421612 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.63■■■■■ 4.9
ZSCAN18-202ENST00000421612 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.08■■■■■ 4.81
ZSCAN18-202ENST00000421612 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.81
ZSCAN18-202ENST00000421612 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.86■■■■■ 4.77
ZSCAN18-202ENST00000421612 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.81■■■■■ 4.76
ZSCAN18-202ENST00000421612 SMARCA4P51532 1647 aa44.75■■■■■ 4.75
ZSCAN18-202ENST00000421612 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.66■■■■■ 4.74
ZSCAN18-202ENST00000421612 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
ZSCAN18-202ENST00000421612 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.38■■■■■ 4.69
ZSCAN18-202ENST00000421612 SMARCA2P51531 1590 aa44.32■■■■■ 4.69
ZSCAN18-202ENST00000421612 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.27■■■■■ 4.68
ZSCAN18-202ENST00000421612 NCAPD3P42695 1498 aa44.23■■■■■ 4.67
ZSCAN18-202ENST00000421612 WIZO95785 1651 aa44.19■■■■■ 4.66
ZSCAN18-202ENST00000421612 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
ZSCAN18-202ENST00000421612 HMGXB3Q12766 1538 aa44.03■■■■■ 4.64
ZSCAN18-202ENST00000421612 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
ZSCAN18-202ENST00000421612 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
ZSCAN18-202ENST00000421612 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.29■■■■■ 4.52
ZSCAN18-202ENST00000421612 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.03■■■■■ 4.48
ZSCAN18-202ENST00000421612 NESP48681 1621 aa43.01■■■■■ 4.48
ZSCAN18-202ENST00000421612 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.92■■■■■ 4.46
ZSCAN18-202ENST00000421612 CFTRP13569 1480 aa42.88■■■■■ 4.46
ZSCAN18-202ENST00000421612 ERCC6Q03468 1493 aa42.76■■■■■ 4.44
ZSCAN18-202ENST00000421612 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.68■■■■■ 4.42
ZSCAN18-202ENST00000421612 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.52■■■■■ 4.4
ZSCAN18-202ENST00000421612 PRDM2Q13029 1718 aa42.47■■■■■ 4.39
ZSCAN18-202ENST00000421612 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.44■■■■■ 4.38
ZSCAN18-202ENST00000421612 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.38■■■■■ 4.38
ZSCAN18-202ENST00000421612 CUX2O14529 1486 aa42.31■■■■■ 4.36
ZSCAN18-202ENST00000421612 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
ZSCAN18-202ENST00000421612 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.17■■■■■ 4.34
ZSCAN18-202ENST00000421612 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
ZSCAN18-202ENST00000421612 WDR62O43379 1518 aa41.97■■■■■ 4.31
ZSCAN18-202ENST00000421612 ABCC8Q09428 1581 aa41.92■■■■■ 4.3
ZSCAN18-202ENST00000421612 TOPBP1Q92547 1522 aa41.9■■■■■ 4.3
ZSCAN18-202ENST00000421612 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.88■■■■■ 4.29
ZSCAN18-202ENST00000421612 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.86■■■■■ 4.29
ZSCAN18-202ENST00000421612 CUX1P39880 1505 aa41.84■■■■■ 4.29
ZSCAN18-202ENST00000421612 SYNJ1O43426 1573 aa41.68■■■■■ 4.26
ZSCAN18-202ENST00000421612 TOP2BQ02880 1626 aa41.63■■■■■ 4.25
ZSCAN18-202ENST00000421612 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.6■■■■■ 4.25
ZSCAN18-202ENST00000421612 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
ZSCAN18-202ENST00000421612 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.58■■■■■ 4.25
ZSCAN18-202ENST00000421612 SOGA1O94964 1423 aa41.48■■■■■ 4.23
ZSCAN18-202ENST00000421612 IFT140Q96RY7 1462 aa41.46■■■■■ 4.23
ZSCAN18-202ENST00000421612 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.45■■■■■ 4.23
ZSCAN18-202ENST00000421612 TRIM41Q8WV44 630 aa41.43■■■■■ 4.22
ZSCAN18-202ENST00000421612 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.37■■■■■ 4.21
ZSCAN18-202ENST00000421612 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
ZSCAN18-202ENST00000421612 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
ZSCAN18-202ENST00000421612 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.21■■■■■ 4.19
ZSCAN18-202ENST00000421612 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
ZSCAN18-202ENST00000421612 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.14■■■■■ 4.183e-10■■■■■ 47.1
ZSCAN18-202ENST00000421612 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.14■■■■■ 4.18
ZSCAN18-202ENST00000421612 WDR97A6NE52 1622 aa41.12■■■■■ 4.17
ZSCAN18-202ENST00000421612 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
ZSCAN18-202ENST00000421612 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.99■■■■■ 4.15
ZSCAN18-202ENST00000421612 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.94■■■■■ 4.14
ZSCAN18-202ENST00000421612 KIF27Q86VH2 1401 aa40.93■■■■■ 4.14
ZSCAN18-202ENST00000421612 GRIN2BQ13224 1484 aa40.88■■■■■ 4.13
ZSCAN18-202ENST00000421612 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.8■■■■■ 4.12
ZSCAN18-202ENST00000421612 PBRM1Q86U86 1689 aa40.77■■■■■ 4.12
ZSCAN18-202ENST00000421612 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.74■■■■■ 4.11
ZSCAN18-202ENST00000421612 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.71■■■■■ 4.11
ZSCAN18-202ENST00000421612 IGF1RP08069 1367 aa40.7■■■■■ 4.11
ZSCAN18-202ENST00000421612 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
ZSCAN18-202ENST00000421612 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
ZSCAN18-202ENST00000421612 FBLN2P98095 1184 aa40.59■■■■■ 4.09
ZSCAN18-202ENST00000421612 EEA1Q15075 1411 aa40.57■■■■■ 4.08
ZSCAN18-202ENST00000421612 OSCARQ8IYS5 282 aa40.55■■■■■ 4.08
ZSCAN18-202ENST00000421612 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
ZSCAN18-202ENST00000421612 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.53■■■■■ 4.08
ZSCAN18-202ENST00000421612 SYNJ2O15056 1496 aa40.52■■■■■ 4.08
ZSCAN18-202ENST00000421612 ADAMTS12P58397 1594 aa40.52■■■■■ 4.08
ZSCAN18-202ENST00000421612 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.51■■■■■ 4.08
ZSCAN18-202ENST00000421612 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.49■■■■■ 4.07
ZSCAN18-202ENST00000421612 CUL7Q14999 1698 aa40.45■■■■■ 4.07
ZSCAN18-202ENST00000421612 CHD1O14646 1710 aa40.4■■■■■ 4.06
ZSCAN18-202ENST00000421612 GRIN2AQ12879 1464 aa40.34■■■■■ 4.05
ZSCAN18-202ENST00000421612 PRXQ9BXM0 1461 aa40.3■■■■■ 4.04
ZSCAN18-202ENST00000421612 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.28■■■■■ 4.04
ZSCAN18-202ENST00000421612 NUP160Q12769 1436 aa40.12■■■■■ 4.01
ZSCAN18-202ENST00000421612 CEP170Q5SW79 1584 aa40.1■■■■■ 4.01
ZSCAN18-202ENST00000421612 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.09■■■■■ 4.01
ZSCAN18-202ENST00000421612 KIF21BO75037 1637 aa40.06■■■■■ 4
ZSCAN18-202ENST00000421612 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.97■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.5 ms