RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532316.1

PKNOX2-AS1-201, Transcript of PKNOX2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PKNOX2-AS1, Length 586 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.58■■■■■ 6.97
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.39■■■■■ 5.98
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ABCC9O60706 1549 aa51.77■■■■■ 5.88
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.63■■■■■ 5.54
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NACADO15069 1562 aa49.43■■■■■ 5.5
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.16■■■■■ 5.46
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.99■■■■■ 5.43
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.67■■■■■ 5.38
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.52■■■■■ 5.36
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.32■■■■■ 5.33
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.25■■■■■ 5.31
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.04■■■■■ 5.28
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.01■■■■■ 5.28
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.7■■■■■ 5.23
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SCRIBQ14160 1630 aa47.66■■■■■ 5.22
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.88■■■■■ 5.1
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.82■■■■■ 5.09
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.64■■■■■ 5.06
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NCAPD3P42695 1498 aa45.61■■■■■ 4.89
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SMARCA4P51532 1647 aa45.57■■■■■ 4.89
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.5■■■■■ 4.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.5■■■■■ 4.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SMARCA2P51531 1590 aa45.47■■■■■ 4.87
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HMGXB3Q12766 1538 aa45.33■■■■■ 4.85
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.18■■■■■ 4.82
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.08■■■■■ 4.81
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ERCC6Q03468 1493 aa44.76■■■■■ 4.76
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NESP48681 1621 aa44.58■■■■■ 4.73
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CUX2O14529 1486 aa44.54■■■■■ 4.72
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 WIZO95785 1651 aa44.53■■■■■ 4.72
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.51■■■■■ 4.72
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.69
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.26■■■■■ 4.68
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.24■■■■■ 4.67
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.04■■■■■ 4.64
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.85■■■■■ 4.61
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CFTRP13569 1480 aa43.84■■■■■ 4.61
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.8■■■■■ 4.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.74■■■■■ 4.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.71■■■■■ 4.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 WDR62O43379 1518 aa43.66■■■■■ 4.58
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.57■■■■■ 4.56
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PRDM2Q13029 1718 aa43.4■■■■■ 4.54
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ABCC8Q09428 1581 aa43■■■■■ 4.47
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TOPBP1Q92547 1522 aa42.92■■■■■ 4.46
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IFT140Q96RY7 1462 aa42.87■■■■■ 4.45
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.85■■■■■ 4.45
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 OSCARQ8IYS5 282 aa42.57■■■■■ 4.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SOGA1O94964 1423 aa42.36■■■■■ 4.37
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CUX1P39880 1505 aa42.34■■■■■ 4.37
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.32■■■■■ 4.37
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.32■■■■■ 4.37
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.3■■■■■ 4.36
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 WDR97A6NE52 1622 aa42.24■■■■■ 4.35
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TRIM41Q8WV44 630 aa42.08■■■■■ 4.33
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CHD1O14646 1710 aa41.99■■■■■ 4.31
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FBLN2P98095 1184 aa41.97■■■■■ 4.31
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GRIN2BQ13224 1484 aa41.97■■■■■ 4.31
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.94■■■■■ 4.3
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.92■■■■■ 4.3
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.9■■■■■ 4.3
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.87■■■■■ 4.29
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.87■■■■■ 4.29
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.87■■■■■ 4.29
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TOP2BQ02880 1626 aa41.86■■■■■ 4.29
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.85■■■■■ 4.29
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.84■■■■■ 4.29
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ARHGEF11O15085 1522 aa41.83■■■■■ 4.29
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SYNJ2O15056 1496 aa41.77■■■■■ 4.28
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.77■■■■■ 4.28
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SYNJ1O43426 1573 aa41.75■■■■■ 4.27
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PBRM1Q86U86 1689 aa41.74■■■■■ 4.27
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.59■■■■■ 4.25
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.47■■■■■ 4.23
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.44■■■■■ 4.22
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ARAP1Q96P48 1450 aa41.43■■■■■ 4.22
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ADAMTS12P58397 1594 aa41.42■■■■■ 4.22
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GRIN2AQ12879 1464 aa41.4■■■■■ 4.22
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.38■■■■■ 4.22
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NUP160Q12769 1436 aa41.25■■■■■ 4.19
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CEP170Q5SW79 1584 aa41.16■■■■■ 4.18
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KIF27Q86VH2 1401 aa41.1■■■■■ 4.17
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SHROOM2Q13796 1616 aa40.98■■■■■ 4.15
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IGF1RP08069 1367 aa40.96■■■■■ 4.15
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CUL7Q14999 1698 aa40.92■■■■■ 4.14
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.87■■■■■ 4.13
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.83■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83 ms