Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.753e-6■■■■□ 26.1
TRA2AQ13595 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.853e-6■■■■□ 26.1
TRA2AQ13595 MYH10-206ENST00000465458 799 ntTSL 215.11■□□□□ 0.019e-8■■■■□ 26
TRA2AQ13595 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.093e-7■■■■□ 26
TRA2AQ13595 KIF20B-204ENST00000478929 4900 ntTSL 1 (best)1.21□□□□□ -2.223e-7■■■■□ 26
TRA2AQ13595 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.383e-7■■■■□ 26
TRA2AQ13595 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.552e-7■■■■□ 26
TRA2AQ13595 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.762e-7■■■■□ 26
TRA2AQ13595 SOS1-205ENST00000461545 441 ntTSL 32.16□□□□□ -2.064e-8■■■■□ 26
TRA2AQ13595 PNISR-207ENST00000478777 2422 ntTSL 28.01□□□□□ -1.131e-9■■■■□ 26
TRA2AQ13595 PNISR-206ENST00000476159 537 ntTSL 36.09□□□□□ -1.431e-9■■■■□ 26
TRA2AQ13595 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.581e-9■■■■□ 26
TRA2AQ13595 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.771e-9■■■■□ 26
TRA2AQ13595 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.639e-13■■■■□ 25.9
TRA2AQ13595 AKAP9-213ENST00000491695 1389 ntTSL 1 (best)7.64□□□□□ -1.194e-8■■■■□ 25.9
TRA2AQ13595 HM13-219ENST00000487964 902 ntTSL 515.95■□□□□ 0.146e-7■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.086e-7■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.026e-7■■■■□ 25.8
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TRA2AQ13595 HM13-213ENST00000469126 756 ntTSL 514.76□□□□□ -0.056e-7■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 HM13-208ENST00000464508 855 ntTSL 214.7□□□□□ -0.066e-7■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.226e-7■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 GTF3C3-206ENST00000448539 796 ntTSL 313.66□□□□□ -0.226e-7■■■■□ 25.8
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TRA2AQ13595 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.336e-7■■■■□ 25.8
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TRA2AQ13595 HM13-204ENST00000398174 3792 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.826e-7■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.156e-7■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 KPNA6-204ENST00000471599 3941 ntTSL 27.8□□□□□ -1.163e-8■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.273e-8■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 KPNA6-203ENST00000469790 879 ntTSL 26.9□□□□□ -1.33e-8■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.496e-7■■■■□ 25.8
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TRA2AQ13595 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC3.97□□□□□ -1.776e-7■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 GTF3C3-207ENST00000451088 488 ntTSL 33.89□□□□□ -1.796e-7■■■■□ 25.8
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TRA2AQ13595 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.997e-6■■■■□ 25.8
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TRA2AQ13595 RPS24-208ENST00000475468 623 ntTSL 519.17■□□□□ 0.667e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.547e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 SAFB-204ENST00000586934 995 ntTSL 518.38■□□□□ 0.532e-7■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.447e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 TPM3-220ENST00000509601 543 ntTSL 417.7■□□□□ 0.424e-13■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 PSMD12-207ENST00000584008 1752 ntTSL 1 (best)17.29■□□□□ 0.367e-6■■■■□ 25.8
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TRA2AQ13595 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.342e-7■■■■□ 25.8
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TRA2AQ13595 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-7■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 TPM3-216ENST00000473036 746 ntTSL 212.71□□□□□ -0.374e-13■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 ZNF3-209ENST00000441298 574 ntTSL 412.57□□□□□ -0.47e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.417e-6■■■■□ 25.8
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TRA2AQ13595 ZNF3-210ENST00000449785 735 ntTSL 312.28□□□□□ -0.447e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 ZNF3-204ENST00000412947 595 ntTSL 1 (best)12.28□□□□□ -0.447e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.454e-13■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 PSME2-215ENST00000560788 785 ntTSL 212.2□□□□□ -0.467e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.467e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 PSME2-214ENST00000560592 760 ntTSL 212.2□□□□□ -0.467e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 AL390728.4-202ENST00000606173 430 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.517e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.527e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.527e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.532e-7■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.597e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 TPM3-202ENST00000302206 741 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.632e-12■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 BIRC2-213ENST00000613397 4066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.77e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 ZNF3-208ENST00000428683 999 ntTSL 210.17□□□□□ -0.787e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 TPM3-223ENST00000611659 3149 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.814e-13■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 TPM3-207ENST00000341372 2007 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.814e-13■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 BIRC2-204ENST00000527910 4073 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.827e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 ZNF3-205ENST00000413658 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.837e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 BIRC2-201ENST00000227758 3743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.847e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 DNAJA2-201ENST00000317089 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.857e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 TPM3-210ENST00000368530 1523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.864e-13■■■■□ 25.8
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