Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 ADD1-218ENST00000513762 3581 ntTSL 312.31□□□□□ -0.444e-7■■■■□ 21.8
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G3BP1Q13283 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.017e-7■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 UMPS-203ENST00000462091 2001 ntTSL 1 (best)14.51□□□□□ -0.097e-7■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 UMPS-205ENST00000474588 1789 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.217e-7■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 UMPS-206ENST00000479719 2340 ntTSL 1 (best)13.35□□□□□ -0.277e-7■■■■□ 21.8
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G3BP1Q13283 UMPS-204ENST00000467167 2242 ntTSL 1 (best)10.48□□□□□ -0.737e-7■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 SEC16A-201ENST00000277537 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.05□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 PRPF8-203ENST00000571958 380 ntTSL 312.32□□□□□ -0.441e-7■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 EFTUD2-215ENST00000589825 600 ntTSL 219.94■□□□□ 0.783e-8■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 GLDC-203ENST00000463305 652 ntTSL 317.34■□□□□ 0.372e-8■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 GLDC-207ENST00000638654 626 ntTSL 311.11□□□□□ -0.632e-8■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 ACACA-234ENST00000614482 2177 ntTSL 214.81□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 VPS35-209ENST00000568642 447 ntTSL 33.54□□□□□ -1.845e-7■■■■□ 21.7
G3BP1Q13283 FTSJ3-201ENST00000427159 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.573e-6■■■■□ 21.7
G3BP1Q13283 SRRT-206ENST00000460194 575 ntTSL 216.25■□□□□ 0.195e-7■■■■□ 21.7
G3BP1Q13283 HNRNPM-207ENST00000597081 1004 ntTSL 525.28■■□□□ 1.647e-7■■■■□ 21.7
G3BP1Q13283 MAP4-203ENST00000383736 2282 ntTSL 58.18□□□□□ -1.13e-7■■■■□ 21.7
G3BP1Q13283 PHGDH-215ENST00000641371 725 nt11.97□□□□□ -0.491e-7■■■■□ 21.7
G3BP1Q13283 SHMT2-225ENST00000556798 525 ntTSL 221.68■■□□□ 1.065e-7■■■■□ 21.7
G3BP1Q13283 SHMT2-233ENST00000557529 1369 ntTSL 215.37■□□□□ 0.055e-7■■■■□ 21.7
G3BP1Q13283 PTMS-203ENST00000538057 976 ntTSL 223.74■■□□□ 1.394e-7■■■■□ 21.7
G3BP1Q13283 ANXA5-204ENST00000509016 556 ntTSL 410.72□□□□□ -0.694e-7■■■■□ 21.7
G3BP1Q13283 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.133e-8■■■■□ 21.6
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G3BP1Q13283 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.011e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 PTPRK-221ENST00000532331 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.181e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 PTPRK-205ENST00000368213 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.761e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 EIF4A3-203ENST00000570837 534 ntTSL 312.14□□□□□ -0.476e-12■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 TUBA1B-205ENST00000549870 565 ntTSL 414.77□□□□□ -0.055e-13■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 TUBA1B-203ENST00000547476 584 ntTSL 414.2□□□□□ -0.145e-13■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 TUBA1B-208ENST00000552984 574 ntTSL 414.19□□□□□ -0.145e-13■■■■□ 21.6
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G3BP1Q13283 IDH1-209ENST00000484575 1044 ntTSL 25.71□□□□□ -1.56e-8■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.533e-6■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 NUP93-220ENST00000569842 2834 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.043e-6■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 NUP93-210ENST00000564887 2875 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.663e-6■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.083e-6■■■■□ 21.6
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G3BP1Q13283 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.566e-8■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 DPP3-204ENST00000526667 832 ntTSL 522.19■■□□□ 1.145e-6■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.066e-8■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 NSDHL-202ENST00000432467 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.35■□□□□ 0.696e-8■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.525e-6■■■■□ 21.6
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G3BP1Q13283 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.265e-6■■■■□ 21.6
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G3BP1Q13283 GPN1-202ENST00000407583 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.785e-6■■■■□ 21.6
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G3BP1Q13283 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.342e-11■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.372e-11■■■■□ 21.6
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G3BP1Q13283 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.871e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 OS9-212ENST00000550202 787 ntTSL 218.17■□□□□ 0.51e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.41e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.351e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.341e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.271e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.211e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.121e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.011e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 OS9-202ENST00000315970 2691 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.031e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 OS9-209ENST00000547079 583 ntTSL 314.04□□□□□ -0.161e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 OS9-210ENST00000549307 3870 ntTSL 211.31□□□□□ -0.61e-7■■■■□ 21.6
G3BP1Q13283 COPG1-207ENST00000513410 545 ntTSL 216.62■□□□□ 0.253e-9■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 PSMD1-202ENST00000373635 3230 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.031e-6■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 PSMD1-201ENST00000308696 3326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.141e-6■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 PSMD1-203ENST00000409643 2901 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.261e-6■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.541e-6■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.393e-7■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 SRRT-213ENST00000611405 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.093e-7■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.113e-7■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.113e-7■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 FLNB-203ENST00000419752 2002 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.091e-18■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.212e-7■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.112e-7■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 CCT8-204ENST00000470450 1872 ntTSL 1 (best)12.14□□□□□ -0.472e-7■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 CCT8-212ENST00000626972 1862 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.682e-7■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.224e-8■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.94e-8■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.775e-7■■■■□ 21.5
G3BP1Q13283 CCT7-210ENST00000473786 811 ntTSL 512.01□□□□□ -0.492e-11■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 ETNK1-204ENST00000539974 441 ntTSL 24.42□□□□□ -1.72e-7■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 EFTUD2-208ENST00000587914 562 ntTSL 48.7□□□□□ -1.022e-7■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 PMPCA-211ENST00000620895 583 ntTSL 322.71■■□□□ 1.235e-7■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 PMPCA-205ENST00000462616 3341 ntTSL 215.59■□□□□ 0.095e-7■■■■□ 21.4
G3BP1Q13283 PRPF8-210ENST00000574217 310 ntTSL 28.29□□□□□ -1.088e-9■■■■□ 21.4
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