RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.3■■■■□ 3.88
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.08■■■■□ 3.21
EFTUD2-215ENST00000589825 ABCC9O60706 1549 aa34.62■■■■□ 3.13
EFTUD2-215ENST00000589825 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.19■■■□□ 2.9
EFTUD2-215ENST00000589825 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.13■■■□□ 2.89
EFTUD2-215ENST00000589825 NACADO15069 1562 aa33.06■■■□□ 2.88
EFTUD2-215ENST00000589825 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.72■■■□□ 2.83
EFTUD2-215ENST00000589825 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
EFTUD2-215ENST00000589825 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.48■■■□□ 2.79
EFTUD2-215ENST00000589825 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.37■■■□□ 2.77
EFTUD2-215ENST00000589825 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.32■■■□□ 2.76
EFTUD2-215ENST00000589825 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.09■■■□□ 2.73
EFTUD2-215ENST00000589825 SCRIBQ14160 1630 aa32■■■□□ 2.71
EFTUD2-215ENST00000589825 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.95■■■□□ 2.71
EFTUD2-215ENST00000589825 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.79■■■□□ 2.68
EFTUD2-215ENST00000589825 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
EFTUD2-215ENST00000589825 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.28■■■□□ 2.6
EFTUD2-215ENST00000589825 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.14■■■□□ 2.57
EFTUD2-215ENST00000589825 SMARCA4P51532 1647 aa30.56■■■□□ 2.48
EFTUD2-215ENST00000589825 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
EFTUD2-215ENST00000589825 NCAPD3P42695 1498 aa30.48■■■□□ 2.47
EFTUD2-215ENST00000589825 SMARCA2P51531 1590 aa30.45■■■□□ 2.47
EFTUD2-215ENST00000589825 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.45■■■□□ 2.47
EFTUD2-215ENST00000589825 HMGXB3Q12766 1538 aa30.31■■■□□ 2.44
EFTUD2-215ENST00000589825 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.27■■■□□ 2.44
EFTUD2-215ENST00000589825 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
EFTUD2-215ENST00000589825 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.23■■■□□ 2.43
EFTUD2-215ENST00000589825 WIZO95785 1651 aa29.95■■■□□ 2.39
EFTUD2-215ENST00000589825 ERCC6Q03468 1493 aa29.93■■■□□ 2.38
EFTUD2-215ENST00000589825 NESP48681 1621 aa29.83■■■□□ 2.37
EFTUD2-215ENST00000589825 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
EFTUD2-215ENST00000589825 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.76■■■□□ 2.35
EFTUD2-215ENST00000589825 CUX2O14529 1486 aa29.65■■■□□ 2.34
EFTUD2-215ENST00000589825 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
EFTUD2-215ENST00000589825 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.61■■■□□ 2.33
EFTUD2-215ENST00000589825 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.61■■■□□ 2.33
EFTUD2-215ENST00000589825 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.5■■■□□ 2.31
EFTUD2-215ENST00000589825 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
EFTUD2-215ENST00000589825 CFTRP13569 1480 aa29.35■■■□□ 2.29
EFTUD2-215ENST00000589825 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.29■■■□□ 2.28
EFTUD2-215ENST00000589825 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.28■■■□□ 2.28
EFTUD2-215ENST00000589825 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.28■■■□□ 2.28
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.27■■■□□ 2.28
EFTUD2-215ENST00000589825 WDR62O43379 1518 aa29.16■■■□□ 2.26
EFTUD2-215ENST00000589825 PRDM2Q13029 1718 aa29.14■■■□□ 2.25
EFTUD2-215ENST00000589825 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.07■■■□□ 2.24
EFTUD2-215ENST00000589825 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
EFTUD2-215ENST00000589825 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
EFTUD2-215ENST00000589825 ABCC8Q09428 1581 aa28.79■■■□□ 2.2
EFTUD2-215ENST00000589825 TOPBP1Q92547 1522 aa28.76■■■□□ 2.19
EFTUD2-215ENST00000589825 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.71■■■□□ 2.19
EFTUD2-215ENST00000589825 IFT140Q96RY7 1462 aa28.67■■■□□ 2.18
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
EFTUD2-215ENST00000589825 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
EFTUD2-215ENST00000589825 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
EFTUD2-215ENST00000589825 OSCARQ8IYS5 282 aa28.43■■■□□ 2.14
EFTUD2-215ENST00000589825 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
EFTUD2-215ENST00000589825 SOGA1O94964 1423 aa28.42■■■□□ 2.14
EFTUD2-215ENST00000589825 CUX1P39880 1505 aa28.41■■■□□ 2.14
EFTUD2-215ENST00000589825 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.4■■■□□ 2.14
EFTUD2-215ENST00000589825 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.38■■■□□ 2.13
EFTUD2-215ENST00000589825 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.36■■■□□ 2.132e-11■■□□□ 13.5
EFTUD2-215ENST00000589825 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
EFTUD2-215ENST00000589825 WDR97A6NE52 1622 aa28.24■■■□□ 2.11
EFTUD2-215ENST00000589825 FBLN2P98095 1184 aa28.2■■■□□ 2.1
EFTUD2-215ENST00000589825 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
EFTUD2-215ENST00000589825 CHD1O14646 1710 aa28.13■■■□□ 2.09
EFTUD2-215ENST00000589825 TOP2BQ02880 1626 aa28.12■■■□□ 2.09
EFTUD2-215ENST00000589825 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.11■■■□□ 2.09
EFTUD2-215ENST00000589825 GRIN2BQ13224 1484 aa28.11■■■□□ 2.09
EFTUD2-215ENST00000589825 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.09■■■□□ 2.09
EFTUD2-215ENST00000589825 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.09■■■□□ 2.09
EFTUD2-215ENST00000589825 TRIM41Q8WV44 630 aa28.08■■■□□ 2.09
EFTUD2-215ENST00000589825 SYNJ1O43426 1573 aa28.07■■■□□ 2.08
EFTUD2-215ENST00000589825 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.07■■■□□ 2.08
EFTUD2-215ENST00000589825 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
EFTUD2-215ENST00000589825 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
EFTUD2-215ENST00000589825 PBRM1Q86U86 1689 aa28.03■■■□□ 2.08
EFTUD2-215ENST00000589825 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.99■■■□□ 2.07
EFTUD2-215ENST00000589825 SYNJ2O15056 1496 aa27.95■■■□□ 2.06
EFTUD2-215ENST00000589825 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.93■■■□□ 2.06
EFTUD2-215ENST00000589825 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.93■■■□□ 2.06
EFTUD2-215ENST00000589825 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.93■■■□□ 2.06
EFTUD2-215ENST00000589825 ARHGEF11O15085 1522 aa27.9■■■□□ 2.06
EFTUD2-215ENST00000589825 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.77■■■□□ 2.04
EFTUD2-215ENST00000589825 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.77■■■□□ 2.04
EFTUD2-215ENST00000589825 ADAMTS12P58397 1594 aa27.75■■■□□ 2.03
EFTUD2-215ENST00000589825 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.74■■■□□ 2.03
EFTUD2-215ENST00000589825 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.73■■■□□ 2.03
EFTUD2-215ENST00000589825 GRIN2AQ12879 1464 aa27.72■■■□□ 2.03
EFTUD2-215ENST00000589825 KIF27Q86VH2 1401 aa27.64■■■□□ 2.02
EFTUD2-215ENST00000589825 ARAP1Q96P48 1450 aa27.63■■■□□ 2.01
EFTUD2-215ENST00000589825 NUP160Q12769 1436 aa27.58■■■□□ 2
EFTUD2-215ENST00000589825 CEP170Q5SW79 1584 aa27.57■■■□□ 2
EFTUD2-215ENST00000589825 IGF1RP08069 1367 aa27.5■■□□□ 1.99
EFTUD2-215ENST00000589825 CUL7Q14999 1698 aa27.49■■□□□ 1.99
EFTUD2-215ENST00000589825 SHROOM2Q13796 1616 aa27.4■■□□□ 1.98
EFTUD2-215ENST00000589825 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.38■■□□□ 1.97
EFTUD2-215ENST00000589825 JPH4Q96JJ6 628 aa27.38■■□□□ 1.97
EFTUD2-215ENST00000589825 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms