Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTENP60484 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTENP60484 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTENP60484 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTENP60484 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTENP60484 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTENP60484 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTENP60484 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTENP60484 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTENP60484 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTENP60484 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTENP60484 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTENP60484 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTENP60484 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTENP60484 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTENP60484 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTENP60484 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTENP60484 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTENP60484 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTENP60484 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTENP60484 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTENP60484 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTENP60484 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTENP60484 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTENP60484 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTENP60484 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTENP60484 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTENP60484 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTENP60484 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTENP60484 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTENP60484 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTENP60484 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTENP60484 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTENP60484 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTENP60484 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTENP60484 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTENP60484 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTENP60484 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTENP60484 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTENP60484 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTENP60484 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTENP60484 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTENP60484 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTENP60484 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTENP60484 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTENP60484 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTENP60484 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTENP60484 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTENP60484 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTENP60484 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTENP60484 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTENP60484 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTENP60484 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTENP60484 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTENP60484 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTENP60484 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTENP60484 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTENP60484 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTENP60484 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTENP60484 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTENP60484 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTENP60484 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTENP60484 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTENP60484 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTENP60484 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTENP60484 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTENP60484 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTENP60484 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTENP60484 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTENP60484 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTENP60484 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTENP60484 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTENP60484 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTENP60484 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTENP60484 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTENP60484 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTENP60484 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTENP60484 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTENP60484 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTENP60484 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTENP60484 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTENP60484 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTENP60484 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTENP60484 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTENP60484 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTENP60484 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTENP60484 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTENP60484 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTENP60484 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTENP60484 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTENP60484 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTENP60484 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTENP60484 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTENP60484 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTENP60484 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTENP60484 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTENP60484 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTENP60484 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTENP60484 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTENP60484 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms