Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXTL2Q9UBQ6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXTL2Q9UBQ6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms