RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.75■■■■■ 4.27
CCDC78-201ENST00000293889 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.01■■■■□ 3.51
CCDC78-201ENST00000293889 ABCC9O60706 1549 aa35.91■■■■□ 3.34
CCDC78-201ENST00000293889 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
CCDC78-201ENST00000293889 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.71■■■■□ 3.15
CCDC78-201ENST00000293889 NACADO15069 1562 aa34.68■■■■□ 3.14
CCDC78-201ENST00000293889 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.65■■■■□ 3.14
CCDC78-201ENST00000293889 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.55■■■■□ 3.12
CCDC78-201ENST00000293889 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.54■■■■□ 3.12
CCDC78-201ENST00000293889 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.01■■■■□ 3.04
CCDC78-201ENST00000293889 SCRIBQ14160 1630 aa33.81■■■■□ 3
CCDC78-201ENST00000293889 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.67■■■□□ 2.98
CCDC78-201ENST00000293889 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.6■■■□□ 2.97
CCDC78-201ENST00000293889 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.48■■■□□ 2.95
CCDC78-201ENST00000293889 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
CCDC78-201ENST00000293889 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.71■■■□□ 2.83
CCDC78-201ENST00000293889 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.53■■■□□ 2.8
CCDC78-201ENST00000293889 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.52■■■□□ 2.8
CCDC78-201ENST00000293889 SMARCA4P51532 1647 aa32.36■■■□□ 2.77
CCDC78-201ENST00000293889 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.77
CCDC78-201ENST00000293889 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.22■■■□□ 2.75
CCDC78-201ENST00000293889 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.07■■■□□ 2.72
CCDC78-201ENST00000293889 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
CCDC78-201ENST00000293889 SMARCA2P51531 1590 aa32.04■■■□□ 2.72
CCDC78-201ENST00000293889 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.03■■■□□ 2.72
CCDC78-201ENST00000293889 NCAPD3P42695 1498 aa31.99■■■□□ 2.71
CCDC78-201ENST00000293889 WIZO95785 1651 aa31.91■■■□□ 2.7
CCDC78-201ENST00000293889 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
CCDC78-201ENST00000293889 HMGXB3Q12766 1538 aa31.88■■■□□ 2.69
CCDC78-201ENST00000293889 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
CCDC78-201ENST00000293889 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
CCDC78-201ENST00000293889 NESP48681 1621 aa31.2■■■□□ 2.59
CCDC78-201ENST00000293889 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.18■■■□□ 2.58
CCDC78-201ENST00000293889 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.12■■■□□ 2.57
CCDC78-201ENST00000293889 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.07■■■□□ 2.56
CCDC78-201ENST00000293889 CFTRP13569 1480 aa30.97■■■□□ 2.55
CCDC78-201ENST00000293889 ERCC6Q03468 1493 aa30.89■■■□□ 2.53
CCDC78-201ENST00000293889 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.88■■■□□ 2.53
CCDC78-201ENST00000293889 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.85■■■□□ 2.53
CCDC78-201ENST00000293889 PRDM2Q13029 1718 aa30.85■■■□□ 2.53
CCDC78-201ENST00000293889 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.74■■■□□ 2.51
CCDC78-201ENST00000293889 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
CCDC78-201ENST00000293889 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.66■■■□□ 2.5
CCDC78-201ENST00000293889 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.55■■■□□ 2.48
CCDC78-201ENST00000293889 WDR62O43379 1518 aa30.46■■■□□ 2.47
CCDC78-201ENST00000293889 CUX2O14529 1486 aa30.45■■■□□ 2.46
CCDC78-201ENST00000293889 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CCDC78-201ENST00000293889 TOPBP1Q92547 1522 aa30.29■■■□□ 2.44
CCDC78-201ENST00000293889 ABCC8Q09428 1581 aa30.28■■■□□ 2.44
CCDC78-201ENST00000293889 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.28■■■□□ 2.44
CCDC78-201ENST00000293889 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.22■■■□□ 2.43
CCDC78-201ENST00000293889 CUX1P39880 1505 aa30.2■■■□□ 2.43
CCDC78-201ENST00000293889 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.19■■■□□ 2.42
CCDC78-201ENST00000293889 SYNJ1O43426 1573 aa30.09■■■□□ 2.41
CCDC78-201ENST00000293889 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CCDC78-201ENST00000293889 TRIM41Q8WV44 630 aa30.06■■■□□ 2.4
CCDC78-201ENST00000293889 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.03■■■□□ 2.4
CCDC78-201ENST00000293889 TOP2BQ02880 1626 aa30.02■■■□□ 2.4
CCDC78-201ENST00000293889 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.02■■■□□ 2.4
CCDC78-201ENST00000293889 IFT140Q96RY7 1462 aa29.98■■■□□ 2.39
CCDC78-201ENST00000293889 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CCDC78-201ENST00000293889 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.94■■■□□ 2.38
CCDC78-201ENST00000293889 SOGA1O94964 1423 aa29.9■■■□□ 2.38
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.37
CCDC78-201ENST00000293889 WDR97A6NE52 1622 aa29.83■■■□□ 2.37
CCDC78-201ENST00000293889 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
CCDC78-201ENST00000293889 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.74■■■□□ 2.35
CCDC78-201ENST00000293889 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.73■■■□□ 2.35
CCDC78-201ENST00000293889 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
CCDC78-201ENST00000293889 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.64■■■□□ 2.33
CCDC78-201ENST00000293889 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.58■■■□□ 2.33
CCDC78-201ENST00000293889 PBRM1Q86U86 1689 aa29.58■■■□□ 2.33
CCDC78-201ENST00000293889 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.53■■■□□ 2.32
CCDC78-201ENST00000293889 GRIN2BQ13224 1484 aa29.52■■■□□ 2.32
CCDC78-201ENST00000293889 KIF27Q86VH2 1401 aa29.49■■■□□ 2.31
CCDC78-201ENST00000293889 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
CCDC78-201ENST00000293889 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.46■■■□□ 2.31
CCDC78-201ENST00000293889 EEA1Q15075 1411 aa29.41■■■□□ 2.3
CCDC78-201ENST00000293889 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
CCDC78-201ENST00000293889 CHD1O14646 1710 aa29.4■■■□□ 2.3
CCDC78-201ENST00000293889 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.38■■■□□ 2.29
CCDC78-201ENST00000293889 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.33■■■□□ 2.29
CCDC78-201ENST00000293889 ADAMTS12P58397 1594 aa29.32■■■□□ 2.28
CCDC78-201ENST00000293889 IGF1RP08069 1367 aa29.31■■■□□ 2.28
CCDC78-201ENST00000293889 SYNJ2O15056 1496 aa29.3■■■□□ 2.28
CCDC78-201ENST00000293889 FBLN2P98095 1184 aa29.27■■■□□ 2.28
CCDC78-201ENST00000293889 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CCDC78-201ENST00000293889 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.23■■■□□ 2.27
CCDC78-201ENST00000293889 OSCARQ8IYS5 282 aa29.22■■■□□ 2.27
CCDC78-201ENST00000293889 CUL7Q14999 1698 aa29.19■■■□□ 2.26
CCDC78-201ENST00000293889 GRIN2AQ12879 1464 aa29.16■■■□□ 2.26
CCDC78-201ENST00000293889 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.16■■■□□ 2.26
CCDC78-201ENST00000293889 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.15■■■□□ 2.26
CCDC78-201ENST00000293889 PRXQ9BXM0 1461 aa29.14■■■□□ 2.25
CCDC78-201ENST00000293889 KIF21BO75037 1637 aa29.06■■■□□ 2.24
CCDC78-201ENST00000293889 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.06■■■□□ 2.24
CCDC78-201ENST00000293889 CEP170Q5SW79 1584 aa29.05■■■□□ 2.24
CCDC78-201ENST00000293889 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.03■■■□□ 2.24
CCDC78-201ENST00000293889 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.03■■■□□ 2.24
CCDC78-201ENST00000293889 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms