RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.13■■■■■ 4.17
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LTV1-201ENST00000367576 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
LTV1-201ENST00000367576 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.17■■■■□ 3.06
LTV1-201ENST00000367576 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.93■■■■□ 3.02
LTV1-201ENST00000367576 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.64■■■□□ 2.98
LTV1-201ENST00000367576 NACADO15069 1562 aa33.62■■■□□ 2.97
LTV1-201ENST00000367576 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.46■■■□□ 2.95
LTV1-201ENST00000367576 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.43■■■□□ 2.94
LTV1-201ENST00000367576 SCRIBQ14160 1630 aa33.19■■■□□ 2.9
LTV1-201ENST00000367576 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.8■■■□□ 2.84
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LTV1-201ENST00000367576 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.04■■■□□ 2.72
LTV1-201ENST00000367576 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
LTV1-201ENST00000367576 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.8■■■□□ 2.68
LTV1-201ENST00000367576 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
LTV1-201ENST00000367576 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
LTV1-201ENST00000367576 SMARCA4P51532 1647 aa31.73■■■□□ 2.67
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LTV1-201ENST00000367576 WIZO95785 1651 aa31.54■■■□□ 2.64
LTV1-201ENST00000367576 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.28■■■□□ 2.6
LTV1-201ENST00000367576 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.27■■■□□ 2.6
LTV1-201ENST00000367576 SMARCA2P51531 1590 aa31.24■■■□□ 2.59
LTV1-201ENST00000367576 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.17■■■□□ 2.58
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LTV1-201ENST00000367576 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
LTV1-201ENST00000367576 NCAPD3P42695 1498 aa31.02■■■□□ 2.56
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LTV1-201ENST00000367576 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.84■■■□□ 2.53
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LTV1-201ENST00000367576 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.29■■■□□ 2.44
LTV1-201ENST00000367576 CFTRP13569 1480 aa30.25■■■□□ 2.43
LTV1-201ENST00000367576 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.22■■■□□ 2.43
LTV1-201ENST00000367576 NESP48681 1621 aa30.18■■■□□ 2.42
LTV1-201ENST00000367576 ABCC8Q09428 1581 aa30.14■■■□□ 2.42
LTV1-201ENST00000367576 PRDM2Q13029 1718 aa30.09■■■□□ 2.41
LTV1-201ENST00000367576 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.06■■■□□ 2.4
LTV1-201ENST00000367576 TRIM41Q8WV44 630 aa29.98■■■□□ 2.39
LTV1-201ENST00000367576 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.94■■■□□ 2.38
LTV1-201ENST00000367576 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.92■■■□□ 2.38
LTV1-201ENST00000367576 SYNJ1O43426 1573 aa29.86■■■□□ 2.37
LTV1-201ENST00000367576 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.83■■■□□ 2.37
LTV1-201ENST00000367576 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.8■■■□□ 2.36
LTV1-201ENST00000367576 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.79■■■□□ 2.36
LTV1-201ENST00000367576 CUX1P39880 1505 aa29.77■■■□□ 2.36
LTV1-201ENST00000367576 TOP2BQ02880 1626 aa29.72■■■□□ 2.35
LTV1-201ENST00000367576 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.7■■■□□ 2.34
LTV1-201ENST00000367576 ERCC6Q03468 1493 aa29.61■■■□□ 2.33
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LTV1-201ENST00000367576 TOPBP1Q92547 1522 aa29.57■■■□□ 2.32
LTV1-201ENST00000367576 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.52■■■□□ 2.32
LTV1-201ENST00000367576 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
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LTV1-201ENST00000367576 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.33■■■□□ 2.29
LTV1-201ENST00000367576 CUX2O14529 1486 aa29.24■■■□□ 2.27
LTV1-201ENST00000367576 EEA1Q15075 1411 aa29.23■■■□□ 2.27
LTV1-201ENST00000367576 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.19■■■□□ 2.26
LTV1-201ENST00000367576 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.18■■■□□ 2.26
LTV1-201ENST00000367576 KIF27Q86VH2 1401 aa29.18■■■□□ 2.26
LTV1-201ENST00000367576 WDR97A6NE52 1622 aa29.16■■■□□ 2.26
LTV1-201ENST00000367576 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.15■■■□□ 2.26
LTV1-201ENST00000367576 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
LTV1-201ENST00000367576 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.14■■■□□ 2.26
LTV1-201ENST00000367576 IFT140Q96RY7 1462 aa29.07■■■□□ 2.24
LTV1-201ENST00000367576 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
LTV1-201ENST00000367576 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.01■■■□□ 2.24
LTV1-201ENST00000367576 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
LTV1-201ENST00000367576 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.96■■■□□ 2.23
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LTV1-201ENST00000367576 KIF21BO75037 1637 aa28.93■■■□□ 2.22
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LTV1-201ENST00000367576 GOLGA3Q08378 1498 aa28.88■■■□□ 2.21
LTV1-201ENST00000367576 PRXQ9BXM0 1461 aa28.88■■■□□ 2.21
LTV1-201ENST00000367576 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.87■■■□□ 2.21
LTV1-201ENST00000367576 PBRM1Q86U86 1689 aa28.86■■■□□ 2.21
LTV1-201ENST00000367576 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.83■■■□□ 2.21
LTV1-201ENST00000367576 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.82■■■□□ 2.2
LTV1-201ENST00000367576 GRIN2BQ13224 1484 aa28.79■■■□□ 2.2
LTV1-201ENST00000367576 CUL7Q14999 1698 aa28.79■■■□□ 2.2
LTV1-201ENST00000367576 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
LTV1-201ENST00000367576 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.69■■■□□ 2.18
LTV1-201ENST00000367576 ADAMTS12P58397 1594 aa28.69■■■□□ 2.18
LTV1-201ENST00000367576 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.67■■■□□ 2.18
LTV1-201ENST00000367576 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.62■■■□□ 2.17
LTV1-201ENST00000367576 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
LTV1-201ENST00000367576 CEP162Q5TB80 1403 aa28.55■■■□□ 2.16
LTV1-201ENST00000367576 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
LTV1-201ENST00000367576 SYNJ2O15056 1496 aa28.47■■■□□ 2.15
LTV1-201ENST00000367576 FBLN2P98095 1184 aa28.46■■■□□ 2.15
LTV1-201ENST00000367576 GRIN2AQ12879 1464 aa28.44■■■□□ 2.14
LTV1-201ENST00000367576 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.44■■■□□ 2.14
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