RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544626.2

ANKRD35-202, Transcript of ankyrin repeat domain 35, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ANKRD35, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35-202ENST00000544626 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.35■■■■□ 3.09
ANKRD35-202ENST00000544626 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.12■■■□□ 2.41
ANKRD35-202ENST00000544626 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD35-202ENST00000544626 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
ANKRD35-202ENST00000544626 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
ANKRD35-202ENST00000544626 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.87■■■□□ 2.21
ANKRD35-202ENST00000544626 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.01■■■□□ 2.07
ANKRD35-202ENST00000544626 ABCC9O60706 1549 aa28■■■□□ 2.07
ANKRD35-202ENST00000544626 SCRIBQ14160 1630 aa27.76■■■□□ 2.03
ANKRD35-202ENST00000544626 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.76■■■□□ 2.03
ANKRD35-202ENST00000544626 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.72■■■□□ 2.03
ANKRD35-202ENST00000544626 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.56■■■□□ 2
ANKRD35-202ENST00000544626 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.54■■■□□ 2
ANKRD35-202ENST00000544626 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
ANKRD35-202ENST00000544626 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
ANKRD35-202ENST00000544626 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.24■■□□□ 1.95
ANKRD35-202ENST00000544626 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.18■■□□□ 1.94
ANKRD35-202ENST00000544626 TRIM41Q8WV44 630 aa27.14■■□□□ 1.93
ANKRD35-202ENST00000544626 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
ANKRD35-202ENST00000544626 NACADO15069 1562 aa26.98■■□□□ 1.91
ANKRD35-202ENST00000544626 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.97■■□□□ 1.91
ANKRD35-202ENST00000544626 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.9■■□□□ 1.9
ANKRD35-202ENST00000544626 WIZO95785 1651 aa26.72■■□□□ 1.87
ANKRD35-202ENST00000544626 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ANKRD35-202ENST00000544626 HRCP23327 699 aa26.61■■□□□ 1.85
ANKRD35-202ENST00000544626 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
ANKRD35-202ENST00000544626 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
ANKRD35-202ENST00000544626 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
ANKRD35-202ENST00000544626 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.24■■□□□ 1.79
ANKRD35-202ENST00000544626 ABCC8Q09428 1581 aa26.23■■□□□ 1.79
ANKRD35-202ENST00000544626 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.21■■□□□ 1.79
ANKRD35-202ENST00000544626 SMARCA4P51532 1647 aa26.18■■□□□ 1.78
ANKRD35-202ENST00000544626 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
ANKRD35-202ENST00000544626 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
ANKRD35-202ENST00000544626 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
ANKRD35-202ENST00000544626 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.04■■□□□ 1.76
ANKRD35-202ENST00000544626 SOGA1O94964 1423 aa25.99■■□□□ 1.75
ANKRD35-202ENST00000544626 SMARCA2P51531 1590 aa25.97■■□□□ 1.75
ANKRD35-202ENST00000544626 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.9■■□□□ 1.74
ANKRD35-202ENST00000544626 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.82■■□□□ 1.72
ANKRD35-202ENST00000544626 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
ANKRD35-202ENST00000544626 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
ANKRD35-202ENST00000544626 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
ANKRD35-202ENST00000544626 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.72■■□□□ 1.71
ANKRD35-202ENST00000544626 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
ANKRD35-202ENST00000544626 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
ANKRD35-202ENST00000544626 CEP162Q5TB80 1403 aa25.61■■□□□ 1.69
ANKRD35-202ENST00000544626 SYNJ1O43426 1573 aa25.46■■□□□ 1.67
ANKRD35-202ENST00000544626 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
ANKRD35-202ENST00000544626 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
ANKRD35-202ENST00000544626 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.41■■□□□ 1.66
ANKRD35-202ENST00000544626 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.35■■□□□ 1.65
ANKRD35-202ENST00000544626 GOLGA3Q08378 1498 aa25.33■■□□□ 1.65
ANKRD35-202ENST00000544626 APLP2Q06481 763 aa25.3■■□□□ 1.64
ANKRD35-202ENST00000544626 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.26■■□□□ 1.63
ANKRD35-202ENST00000544626 EEA1Q15075 1411 aa25.26■■□□□ 1.63
ANKRD35-202ENST00000544626 CLIP1P30622 1438 aa25.23■■□□□ 1.63
ANKRD35-202ENST00000544626 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD35-202ENST00000544626 NCAPD3P42695 1498 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD35-202ENST00000544626 ITGAEP38570 1179 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD35-202ENST00000544626 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
ANKRD35-202ENST00000544626 P3H3Q8IVL6 736 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD35-202ENST00000544626 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25■■□□□ 1.59
ANKRD35-202ENST00000544626 CUX1P39880 1505 aa24.99■■□□□ 1.59
ANKRD35-202ENST00000544626 TOP2BQ02880 1626 aa24.96■■□□□ 1.59
ANKRD35-202ENST00000544626 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
ANKRD35-202ENST00000544626 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.9■■□□□ 1.58
ANKRD35-202ENST00000544626 HMGXB3Q12766 1538 aa24.9■■□□□ 1.58
ANKRD35-202ENST00000544626 CFTRP13569 1480 aa24.89■■□□□ 1.58
ANKRD35-202ENST00000544626 KIF27Q86VH2 1401 aa24.89■■□□□ 1.57
ANKRD35-202ENST00000544626 KIF21BO75037 1637 aa24.88■■□□□ 1.57
ANKRD35-202ENST00000544626 CUX2O14529 1486 aa24.86■■□□□ 1.57
ANKRD35-202ENST00000544626 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.85■■□□□ 1.57
ANKRD35-202ENST00000544626 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.81■■□□□ 1.56
ANKRD35-202ENST00000544626 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
ANKRD35-202ENST00000544626 NESP48681 1621 aa24.8■■□□□ 1.56
ANKRD35-202ENST00000544626 PRXQ9BXM0 1461 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD35-202ENST00000544626 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD35-202ENST00000544626 ARAP1Q96P48 1450 aa24.72■■□□□ 1.55
ANKRD35-202ENST00000544626 IGF1RP08069 1367 aa24.7■■□□□ 1.54
ANKRD35-202ENST00000544626 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.69■■□□□ 1.54
ANKRD35-202ENST00000544626 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.68■■□□□ 1.54
ANKRD35-202ENST00000544626 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
ANKRD35-202ENST00000544626 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.66■■□□□ 1.54
ANKRD35-202ENST00000544626 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.64■■□□□ 1.53
ANKRD35-202ENST00000544626 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
ANKRD35-202ENST00000544626 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
ANKRD35-202ENST00000544626 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.55■■□□□ 1.52
ANKRD35-202ENST00000544626 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ANKRD35-202ENST00000544626 ARID3CA6NKF2 412 aa24.53■■□□□ 1.52
ANKRD35-202ENST00000544626 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.52■■□□□ 1.52
ANKRD35-202ENST00000544626 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
ANKRD35-202ENST00000544626 NEUROD1Q13562 356 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD35-202ENST00000544626 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD35-202ENST00000544626 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
ANKRD35-202ENST00000544626 MIER1Q8N108 512 aa24.38■■□□□ 1.49
ANKRD35-202ENST00000544626 TOPBP1Q92547 1522 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD35-202ENST00000544626 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.35■■□□□ 1.49
ANKRD35-202ENST00000544626 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
ANKRD35-202ENST00000544626 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms