Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CASP8AP2Q9UKL3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CASP8AP2Q9UKL3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASP8AP2Q9UKL3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP8AP2Q9UKL3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP8AP2Q9UKL3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms