RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433076.6

RPP21-222, Transcript of ribonuclease P/MRP subunit p21, human

TSL 2 BASIC

Gene RPP21, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPP21-222	ENST00000433076	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.53	■■■■■ 6.64
RPP21-222	ENST00000433076	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.54	■■■■■ 5.68
RPP21-222	ENST00000433076	ABCC9	O60706	1549 aa		50.23	■■■■■ 5.63
RPP21-222	ENST00000433076	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.97	■■■■■ 5.27
RPP21-222	ENST00000433076	NACAD	O15069	1562 aa		47.74	■■■■■ 5.23
RPP21-222	ENST00000433076	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.59	■■■■■ 5.21
RPP21-222	ENST00000433076	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.22	■■■■■ 5.15
RPP21-222	ENST00000433076	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	46.94	■■■■■ 5.1
RPP21-222	ENST00000433076	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.84	■■■■■ 5.09
RPP21-222	ENST00000433076	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.79	■■■■■ 5.08
RPP21-222	ENST00000433076	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.78	■■■■■ 5.08
RPP21-222	ENST00000433076	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.74	■■■■■ 5.07
RPP21-222	ENST00000433076	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.53	■■■■■ 5.04
RPP21-222	ENST00000433076	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.09	■■■■■ 4.97
RPP21-222	ENST00000433076	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		46.01	■■■■■ 4.96
RPP21-222	ENST00000433076	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.38	■■■■■ 4.86
RPP21-222	ENST00000433076	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.37	■■■■■ 4.85
RPP21-222	ENST00000433076	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.23	■■■■■ 4.83
RPP21-222	ENST00000433076	NCAPD3	P42695	1498 aa		44.08	■■■■■ 4.65
RPP21-222	ENST00000433076	SMARCA4	P51532	1647 aa		44	■■■■■ 4.63
RPP21-222	ENST00000433076	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.99	■■■■■ 4.63
RPP21-222	ENST00000433076	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.88	■■■■■ 4.62
RPP21-222	ENST00000433076	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.88	■■■■■ 4.61
RPP21-222	ENST00000433076	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.77	■■■■■ 4.6
RPP21-222	ENST00000433076	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.58	■■■■■ 4.57
RPP21-222	ENST00000433076	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.58	■■■■■ 4.57
RPP21-222	ENST00000433076	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.56	■■■■■ 4.56
RPP21-222	ENST00000433076	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.37	■■■■■ 4.53
RPP21-222	ENST00000433076	NES	P48681	1621 aa		43.24	■■■■■ 4.51
RPP21-222	ENST00000433076	CUX2	O14529	1486 aa		43.17	■■■■■ 4.5
RPP21-222	ENST00000433076	WIZ	O95785	1651 aa		43.02	■■■■■ 4.48
RPP21-222	ENST00000433076	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		43.01	■■■■■ 4.48
RPP21-222	ENST00000433076	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	42.8	■■■■■ 4.44
RPP21-222	ENST00000433076	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.79	■■■■■ 4.44
RPP21-222	ENST00000433076	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.78	■■■■■ 4.44
RPP21-222	ENST00000433076	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.74	■■■■■ 4.43
RPP21-222	ENST00000433076	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.72	■■■■■ 4.43
RPP21-222	ENST00000433076	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.64	■■■■■ 4.42
RPP21-222	ENST00000433076	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.55	■■■■■ 4.4
RPP21-222	ENST00000433076	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.38	■■■■■ 4.38
RPP21-222	ENST00000433076	CFTR	P13569	1480 aa		42.35	■■■■■ 4.37
RPP21-222	ENST00000433076	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.29	■■■■■ 4.36
RPP21-222	ENST00000433076	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.27	■■■■■ 4.36
RPP21-222	ENST00000433076	WDR62	O43379	1518 aa		42.25	■■■■■ 4.35
RPP21-222	ENST00000433076	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.06	■■■■■ 4.32
RPP21-222	ENST00000433076	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.88	■■■■■ 4.29
RPP21-222	ENST00000433076	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.85	■■■■■ 4.29
RPP21-222	ENST00000433076	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.5	■■■■■ 4.23
RPP21-222	ENST00000433076	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.46	■■■■■ 4.23
RPP21-222	ENST00000433076	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.44	■■■■■ 4.22
RPP21-222	ENST00000433076	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.37	■■■■■ 4.21
RPP21-222	ENST00000433076	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	41.31	■■■■■ 4.2
RPP21-222	ENST00000433076	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.28	■■■■■ 4.2
RPP21-222	ENST00000433076	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	41.19	■■■■■ 4.18
RPP21-222	ENST00000433076	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41.1	■■■■■ 4.17
RPP21-222	ENST00000433076	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	41.08	■■■■■ 4.17
RPP21-222	ENST00000433076	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	41.07	■■■■■ 4.17
RPP21-222	ENST00000433076	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.01	■■■■■ 4.16
RPP21-222	ENST00000433076	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.99	■■■■■ 4.15	5e-7	■■■■□ 19.7
RPP21-222	ENST00000433076	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.94	■■■■■ 4.14
RPP21-222	ENST00000433076	SOGA1	O94964	1423 aa		40.93	■■■■■ 4.14
RPP21-222	ENST00000433076	CUX1	P39880	1505 aa		40.9	■■■■■ 4.14
RPP21-222	ENST00000433076	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.9	■■■■■ 4.14
RPP21-222	ENST00000433076	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.81	■■■■■ 4.12
RPP21-222	ENST00000433076	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.71	■■■■■ 4.11
RPP21-222	ENST00000433076	FBLN2	P98095	1184 aa		40.67	■■■■■ 4.1
RPP21-222	ENST00000433076	CHD1	O14646	1710 aa		40.67	■■■■■ 4.1
RPP21-222	ENST00000433076	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.64	■■■■■ 4.1
RPP21-222	ENST00000433076	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.64	■■■■■ 4.1
RPP21-222	ENST00000433076	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.64	■■■■■ 4.1
RPP21-222	ENST00000433076	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.58	■■■■■ 4.09
RPP21-222	ENST00000433076	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.57	■■■■■ 4.09
RPP21-222	ENST00000433076	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.55	■■■■■ 4.08
RPP21-222	ENST00000433076	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.51	■■■■■ 4.07
RPP21-222	ENST00000433076	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.47	■■■■■ 4.07
RPP21-222	ENST00000433076	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.45	■■■■■ 4.07
RPP21-222	ENST00000433076	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.44	■■■■■ 4.06
RPP21-222	ENST00000433076	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.39	■■■■■ 4.06
RPP21-222	ENST00000433076	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.37	■■■■■ 4.05
RPP21-222	ENST00000433076	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.34	■■■■■ 4.05
RPP21-222	ENST00000433076	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.34	■■■■■ 4.05
RPP21-222	ENST00000433076	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.33	■■■■■ 4.05
RPP21-222	ENST00000433076	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.32	■■■■■ 4.05
RPP21-222	ENST00000433076	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.29	■■■■■ 4.04
RPP21-222	ENST00000433076	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.28	■■■■■ 4.04
RPP21-222	ENST00000433076	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		40.26	■■■■■ 4.04
RPP21-222	ENST00000433076	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.2	■■■■■ 4.03
RPP21-222	ENST00000433076	ADAMTS12	P58397	1594 aa		40.01	■■■■■ 4
RPP21-222	ENST00000433076	GRIN2A	Q12879	1464 aa		40	■■■■□ 3.99
RPP21-222	ENST00000433076	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.96	■■■■□ 3.99
RPP21-222	ENST00000433076	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.96	■■■■□ 3.99
RPP21-222	ENST00000433076	NUP160	Q12769	1436 aa		39.87	■■■■□ 3.97
RPP21-222	ENST00000433076	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.82	■■■■□ 3.97
RPP21-222	ENST00000433076	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	39.72	■■■■□ 3.95
RPP21-222	ENST00000433076	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.64	■■■■□ 3.94
RPP21-222	ENST00000433076	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.62	■■■■□ 3.93
RPP21-222	ENST00000433076	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.61	■■■■□ 3.93
RPP21-222	ENST00000433076	IGF1R	P08069	1367 aa		39.55	■■■■□ 3.92
RPP21-222	ENST00000433076	JPH4	Q96JJ6	628 aa		39.48	■■■■□ 3.91
RPP21-222	ENST00000433076	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	39.46	■■■■□ 3.91

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