RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522091.1

CHTF8-208, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 8, human

TSL 2 BASIC

Gene CHTF8, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHTF8-208	ENST00000522091	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.21	■■■■■ 6.59
CHTF8-208	ENST00000522091	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.36	■■■■■ 5.65
CHTF8-208	ENST00000522091	ABCC9	O60706	1549 aa		50.19	■■■■■ 5.62
CHTF8-208	ENST00000522091	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.84	■■■■■ 5.25
CHTF8-208	ENST00000522091	NACAD	O15069	1562 aa		47.55	■■■■■ 5.2
CHTF8-208	ENST00000522091	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.32	■■■■■ 5.17
CHTF8-208	ENST00000522091	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.96	■■■■■ 5.11
CHTF8-208	ENST00000522091	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.95	■■■■■ 5.11
CHTF8-208	ENST00000522091	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.81	■■■■■ 5.08
CHTF8-208	ENST00000522091	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.76	■■■■■ 5.08
CHTF8-208	ENST00000522091	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	46.63	■■■■■ 5.05
CHTF8-208	ENST00000522091	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.48	■■■■■ 5.03
CHTF8-208	ENST00000522091	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.43	■■■■■ 5.02
CHTF8-208	ENST00000522091	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.92	■■■■■ 4.94
CHTF8-208	ENST00000522091	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.82	■■■■■ 4.93
CHTF8-208	ENST00000522091	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.37	■■■■■ 4.85
CHTF8-208	ENST00000522091	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.31	■■■■■ 4.84
CHTF8-208	ENST00000522091	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.19	■■■■■ 4.82
CHTF8-208	ENST00000522091	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.9	■■■■■ 4.62
CHTF8-208	ENST00000522091	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.82	■■■■■ 4.61
CHTF8-208	ENST00000522091	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.81	■■■■■ 4.6
CHTF8-208	ENST00000522091	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.68	■■■■■ 4.58
CHTF8-208	ENST00000522091	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.61	■■■■■ 4.57
CHTF8-208	ENST00000522091	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.6	■■■■■ 4.57
CHTF8-208	ENST00000522091	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.38	■■■■■ 4.54
CHTF8-208	ENST00000522091	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.38	■■■■■ 4.53
CHTF8-208	ENST00000522091	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.33	■■■■■ 4.53
CHTF8-208	ENST00000522091	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.3	■■■■■ 4.52
CHTF8-208	ENST00000522091	NES	P48681	1621 aa		43.19	■■■■■ 4.5
CHTF8-208	ENST00000522091	CUX2	O14529	1486 aa		43.17	■■■■■ 4.5
CHTF8-208	ENST00000522091	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.94	■■■■■ 4.46
CHTF8-208	ENST00000522091	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.89	■■■■■ 4.46
CHTF8-208	ENST00000522091	WIZ	O95785	1651 aa		42.82	■■■■■ 4.45
CHTF8-208	ENST00000522091	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.72	■■■■■ 4.43
CHTF8-208	ENST00000522091	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.63	■■■■■ 4.42
CHTF8-208	ENST00000522091	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.62	■■■■■ 4.41
CHTF8-208	ENST00000522091	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.57	■■■■■ 4.41
CHTF8-208	ENST00000522091	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	42.47	■■■■■ 4.39
CHTF8-208	ENST00000522091	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
CHTF8-208	ENST00000522091	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.26	■■■■■ 4.36
CHTF8-208	ENST00000522091	WDR62	O43379	1518 aa		42.16	■■■■■ 4.34
CHTF8-208	ENST00000522091	CFTR	P13569	1480 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CHTF8-208	ENST00000522091	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.12	■■■■■ 4.33
CHTF8-208	ENST00000522091	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CHTF8-208	ENST00000522091	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		41.8	■■■■■ 4.28
CHTF8-208	ENST00000522091	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.76	■■■■■ 4.28
CHTF8-208	ENST00000522091	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.75	■■■■■ 4.27
CHTF8-208	ENST00000522091	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.33	■■■■■ 4.21
CHTF8-208	ENST00000522091	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.27	■■■■■ 4.2
CHTF8-208	ENST00000522091	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	41.22	■■■■■ 4.19
CHTF8-208	ENST00000522091	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.21	■■■■■ 4.19
CHTF8-208	ENST00000522091	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.21	■■■■■ 4.19
CHTF8-208	ENST00000522091	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.2	■■■■■ 4.19
CHTF8-208	ENST00000522091	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.13	■■■■■ 4.17
CHTF8-208	ENST00000522091	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	41	■■■■■ 4.15
CHTF8-208	ENST00000522091	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.96	■■■■■ 4.15
CHTF8-208	ENST00000522091	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.92	■■■■■ 4.14
CHTF8-208	ENST00000522091	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.86	■■■■■ 4.13
CHTF8-208	ENST00000522091	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.77	■■■■■ 4.12
CHTF8-208	ENST00000522091	SOGA1	O94964	1423 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CHTF8-208	ENST00000522091	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.71	■■■■■ 4.11
CHTF8-208	ENST00000522091	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.71	■■■■■ 4.11
CHTF8-208	ENST00000522091	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.71	■■■■■ 4.11
CHTF8-208	ENST00000522091	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	40.7	■■■■■ 4.11
CHTF8-208	ENST00000522091	CUX1	P39880	1505 aa		40.7	■■■■■ 4.11
CHTF8-208	ENST00000522091	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.69	■■■■■ 4.1
CHTF8-208	ENST00000522091	CHD1	O14646	1710 aa		40.67	■■■■■ 4.1
CHTF8-208	ENST00000522091	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
CHTF8-208	ENST00000522091	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.58	■■■■■ 4.09
CHTF8-208	ENST00000522091	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.53	■■■■■ 4.08
CHTF8-208	ENST00000522091	FBLN2	P98095	1184 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CHTF8-208	ENST00000522091	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.45	■■■■■ 4.07
CHTF8-208	ENST00000522091	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.35	■■■■■ 4.05
CHTF8-208	ENST00000522091	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.33	■■■■■ 4.05
CHTF8-208	ENST00000522091	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.25	■■■■■ 4.03
CHTF8-208	ENST00000522091	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.25	■■■■■ 4.03
CHTF8-208	ENST00000522091	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.24	■■■■■ 4.03
CHTF8-208	ENST00000522091	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.23	■■■■■ 4.03
CHTF8-208	ENST00000522091	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.23	■■■■■ 4.03
CHTF8-208	ENST00000522091	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.21	■■■■■ 4.03
CHTF8-208	ENST00000522091	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		40.21	■■■■■ 4.03
CHTF8-208	ENST00000522091	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.2	■■■■■ 4.03
CHTF8-208	ENST00000522091	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.18	■■■■■ 4.02
CHTF8-208	ENST00000522091	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.17	■■■■■ 4.02
CHTF8-208	ENST00000522091	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.09	■■■■■ 4.01
CHTF8-208	ENST00000522091	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.09	■■■■■ 4.01
CHTF8-208	ENST00000522091	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.08	■■■■■ 4.01
CHTF8-208	ENST00000522091	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.86	■■■■□ 3.97
CHTF8-208	ENST00000522091	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.84	■■■■□ 3.97
CHTF8-208	ENST00000522091	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.73	■■■■□ 3.95
CHTF8-208	ENST00000522091	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.73	■■■■□ 3.95
CHTF8-208	ENST00000522091	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	39.72	■■■■□ 3.95
CHTF8-208	ENST00000522091	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.72	■■■■□ 3.95
CHTF8-208	ENST00000522091	NUP160	Q12769	1436 aa		39.7	■■■■□ 3.95
CHTF8-208	ENST00000522091	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.61	■■■■□ 3.93
CHTF8-208	ENST00000522091	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.53	■■■■□ 3.92
CHTF8-208	ENST00000522091	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.3	■■■■□ 3.88
CHTF8-208	ENST00000522091	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	39.3	■■■■□ 3.88
CHTF8-208	ENST00000522091	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.27	■■■■□ 3.88
CHTF8-208	ENST00000522091	JPH4	Q96JJ6	628 aa		39.27	■■■■□ 3.88

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