RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527938.5

TOLLIP-208, Transcript of toll interacting protein, human

TSL 4 BASIC

Gene TOLLIP, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOLLIP-208	ENST00000527938	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.21	■■■■■ 6.59
TOLLIP-208	ENST00000527938	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.4	■■■■■ 5.66
TOLLIP-208	ENST00000527938	ABCC9	O60706	1549 aa		50.08	■■■■■ 5.61
TOLLIP-208	ENST00000527938	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.84	■■■■■ 5.25
TOLLIP-208	ENST00000527938	NACAD	O15069	1562 aa		47.58	■■■■■ 5.21
TOLLIP-208	ENST00000527938	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.23	■■■■■ 5.15
TOLLIP-208	ENST00000527938	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.04	■■■■■ 5.12
TOLLIP-208	ENST00000527938	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.69	■■■■■ 5.06
TOLLIP-208	ENST00000527938	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.68	■■■■■ 5.06
TOLLIP-208	ENST00000527938	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	46.66	■■■■■ 5.06
TOLLIP-208	ENST00000527938	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.6	■■■■■ 5.05
TOLLIP-208	ENST00000527938	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.5	■■■■■ 5.03
TOLLIP-208	ENST00000527938	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.39	■■■■■ 5.02
TOLLIP-208	ENST00000527938	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.93	■■■■■ 4.94
TOLLIP-208	ENST00000527938	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.88	■■■■■ 4.93
TOLLIP-208	ENST00000527938	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.27	■■■■■ 4.84
TOLLIP-208	ENST00000527938	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.26	■■■■■ 4.84
TOLLIP-208	ENST00000527938	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.11	■■■■■ 4.81
TOLLIP-208	ENST00000527938	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.89	■■■■■ 4.62
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TOLLIP-208	ENST00000527938	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.77	■■■■■ 4.6
TOLLIP-208	ENST00000527938	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.71	■■■■■ 4.59
TOLLIP-208	ENST00000527938	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.66	■■■■■ 4.58
TOLLIP-208	ENST00000527938	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.63	■■■■■ 4.57
TOLLIP-208	ENST00000527938	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.41	■■■■■ 4.54
TOLLIP-208	ENST00000527938	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.38	■■■■■ 4.54
TOLLIP-208	ENST00000527938	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.29	■■■■■ 4.52
TOLLIP-208	ENST00000527938	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.26	■■■■■ 4.52
TOLLIP-208	ENST00000527938	CUX2	O14529	1486 aa		43.14	■■■■■ 4.5
TOLLIP-208	ENST00000527938	NES	P48681	1621 aa		43.08	■■■■■ 4.49
TOLLIP-208	ENST00000527938	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.9	■■■■■ 4.46
TOLLIP-208	ENST00000527938	WIZ	O95785	1651 aa		42.77	■■■■■ 4.44
TOLLIP-208	ENST00000527938	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.77	■■■■■ 4.44
TOLLIP-208	ENST00000527938	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
TOLLIP-208	ENST00000527938	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.63	■■■■■ 4.41
TOLLIP-208	ENST00000527938	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.55	■■■■■ 4.4
TOLLIP-208	ENST00000527938	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.55	■■■■■ 4.4
TOLLIP-208	ENST00000527938	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	42.47	■■■■■ 4.39
TOLLIP-208	ENST00000527938	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.31	■■■■■ 4.36
TOLLIP-208	ENST00000527938	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.24	■■■■■ 4.35
TOLLIP-208	ENST00000527938	WDR62	O43379	1518 aa		42.14	■■■■■ 4.34
TOLLIP-208	ENST00000527938	CFTR	P13569	1480 aa		42.13	■■■■■ 4.34
TOLLIP-208	ENST00000527938	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.13	■■■■■ 4.34
TOLLIP-208	ENST00000527938	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.08	■■■■■ 4.33
TOLLIP-208	ENST00000527938	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		41.77	■■■■■ 4.28
TOLLIP-208	ENST00000527938	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.75	■■■■■ 4.27
TOLLIP-208	ENST00000527938	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.7	■■■■■ 4.27
TOLLIP-208	ENST00000527938	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.31	■■■■■ 4.2
TOLLIP-208	ENST00000527938	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.28	■■■■■ 4.2
TOLLIP-208	ENST00000527938	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.28	■■■■■ 4.2
TOLLIP-208	ENST00000527938	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.2	■■■■■ 4.19
TOLLIP-208	ENST00000527938	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.14	■■■■■ 4.18
TOLLIP-208	ENST00000527938	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	41.13	■■■■■ 4.18
TOLLIP-208	ENST00000527938	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.97	■■■■■ 4.15
TOLLIP-208	ENST00000527938	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.95	■■■■■ 4.15
TOLLIP-208	ENST00000527938	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.93	■■■■■ 4.14
TOLLIP-208	ENST00000527938	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.9	■■■■■ 4.14
TOLLIP-208	ENST00000527938	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.77	■■■■■ 4.12	4e-6	■■■□□ 19
TOLLIP-208	ENST00000527938	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.7	■■■■■ 4.11
TOLLIP-208	ENST00000527938	SOGA1	O94964	1423 aa		40.7	■■■■■ 4.11
TOLLIP-208	ENST00000527938	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	40.7	■■■■■ 4.11
TOLLIP-208	ENST00000527938	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.68	■■■■■ 4.1
TOLLIP-208	ENST00000527938	CUX1	P39880	1505 aa		40.67	■■■■■ 4.1
TOLLIP-208	ENST00000527938	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.61	■■■■■ 4.09
TOLLIP-208	ENST00000527938	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.6	■■■■■ 4.09
TOLLIP-208	ENST00000527938	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.6	■■■■■ 4.09
TOLLIP-208	ENST00000527938	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.6	■■■■■ 4.09
TOLLIP-208	ENST00000527938	CHD1	O14646	1710 aa		40.59	■■■■■ 4.09
TOLLIP-208	ENST00000527938	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.57	■■■■■ 4.08
TOLLIP-208	ENST00000527938	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.52	■■■■■ 4.08
TOLLIP-208	ENST00000527938	FBLN2	P98095	1184 aa		40.44	■■■■■ 4.06
TOLLIP-208	ENST00000527938	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.42	■■■■■ 4.06
TOLLIP-208	ENST00000527938	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.36	■■■■■ 4.05
TOLLIP-208	ENST00000527938	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.36	■■■■■ 4.05
TOLLIP-208	ENST00000527938	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.25	■■■■■ 4.03
TOLLIP-208	ENST00000527938	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.23	■■■■■ 4.03
TOLLIP-208	ENST00000527938	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.21	■■■■■ 4.03
TOLLIP-208	ENST00000527938	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.21	■■■■■ 4.03
TOLLIP-208	ENST00000527938	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.2	■■■■■ 4.03
TOLLIP-208	ENST00000527938	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.18	■■■■■ 4.02
TOLLIP-208	ENST00000527938	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.18	■■■■■ 4.02
TOLLIP-208	ENST00000527938	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		40.16	■■■■■ 4.02
TOLLIP-208	ENST00000527938	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.13	■■■■■ 4.01
TOLLIP-208	ENST00000527938	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.13	■■■■■ 4.01
TOLLIP-208	ENST00000527938	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.13	■■■■■ 4.01
TOLLIP-208	ENST00000527938	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.12	■■■■■ 4.01
TOLLIP-208	ENST00000527938	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.11	■■■■■ 4.01
TOLLIP-208	ENST00000527938	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.86	■■■■□ 3.97
TOLLIP-208	ENST00000527938	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.83	■■■■□ 3.97
TOLLIP-208	ENST00000527938	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.76	■■■■□ 3.96
TOLLIP-208	ENST00000527938	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.74	■■■■□ 3.95
TOLLIP-208	ENST00000527938	NUP160	Q12769	1436 aa		39.7	■■■■□ 3.95
TOLLIP-208	ENST00000527938	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.67	■■■■□ 3.94
TOLLIP-208	ENST00000527938	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	39.61	■■■■□ 3.93
TOLLIP-208	ENST00000527938	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.51	■■■■□ 3.91
TOLLIP-208	ENST00000527938	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.5	■■■■□ 3.91
TOLLIP-208	ENST00000527938	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.33	■■■■□ 3.89
TOLLIP-208	ENST00000527938	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.3	■■■■□ 3.88
TOLLIP-208	ENST00000527938	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	39.26	■■■■□ 3.88
TOLLIP-208	ENST00000527938	CUL7	Q14999	1698 aa		39.25	■■■■□ 3.87

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