RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378272.9

EBPL-204, Transcript of EBP like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene EBPL, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBPL-204ENST00000378272 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.62■■■■■ 6.49
EBPL-204ENST00000378272 ABCC9O60706 1549 aa50.03■■■■■ 5.6
EBPL-204ENST00000378272 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.9■■■■■ 5.58
EBPL-204ENST00000378272 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.58■■■■■ 5.21
EBPL-204ENST00000378272 NACADO15069 1562 aa47.26■■■■■ 5.16
EBPL-204ENST00000378272 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.1■■■■■ 5.13
EBPL-204ENST00000378272 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47■■■■■ 5.11
EBPL-204ENST00000378272 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.62■■■■■ 5.05
EBPL-204ENST00000378272 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.6■■■■■ 5.05
EBPL-204ENST00000378272 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.42■■■■■ 5.02
EBPL-204ENST00000378272 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.2■■■■■ 4.99
EBPL-204ENST00000378272 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.06■■■■■ 4.96
EBPL-204ENST00000378272 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.97■■■■■ 4.95
EBPL-204ENST00000378272 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.62■■■■■ 4.89
EBPL-204ENST00000378272 SCRIBQ14160 1630 aa45.44■■■■■ 4.86
EBPL-204ENST00000378272 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.18■■■■■ 4.82
EBPL-204ENST00000378272 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.1■■■■■ 4.81
EBPL-204ENST00000378272 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.81
EBPL-204ENST00000378272 NCAPD3P42695 1498 aa43.68■■■■■ 4.58
EBPL-204ENST00000378272 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.49■■■■■ 4.55
EBPL-204ENST00000378272 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.37■■■■■ 4.53
EBPL-204ENST00000378272 SMARCA4P51532 1647 aa43.37■■■■■ 4.53
EBPL-204ENST00000378272 SMARCA2P51531 1590 aa43.35■■■■■ 4.53
EBPL-204ENST00000378272 HMGXB3Q12766 1538 aa43.28■■■■■ 4.52
EBPL-204ENST00000378272 ERCC6Q03468 1493 aa43.21■■■■■ 4.51
EBPL-204ENST00000378272 CUX2O14529 1486 aa43.2■■■■■ 4.51
EBPL-204ENST00000378272 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
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EBPL-204ENST00000378272 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.99■■■■■ 4.47
EBPL-204ENST00000378272 NESP48681 1621 aa42.95■■■■■ 4.47
EBPL-204ENST00000378272 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.83■■■■■ 4.45
EBPL-204ENST00000378272 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.65■■■■■ 4.42
EBPL-204ENST00000378272 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
EBPL-204ENST00000378272 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.45■■■■■ 4.39
EBPL-204ENST00000378272 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.34■■■■■ 4.37
EBPL-204ENST00000378272 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.33■■■■■ 4.37
EBPL-204ENST00000378272 WIZO95785 1651 aa42.28■■■■■ 4.36
EBPL-204ENST00000378272 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.05■■■■■ 4.32
EBPL-204ENST00000378272 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
EBPL-204ENST00000378272 WDR62O43379 1518 aa41.95■■■■■ 4.31
EBPL-204ENST00000378272 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.85■■■■■ 4.29
EBPL-204ENST00000378272 CFTRP13569 1480 aa41.82■■■■■ 4.29
EBPL-204ENST00000378272 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.8■■■■■ 4.28
EBPL-204ENST00000378272 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
EBPL-204ENST00000378272 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
EBPL-204ENST00000378272 TRIM41Q8WV44 630 aa41.34■■■■■ 4.21
EBPL-204ENST00000378272 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.33■■■■■ 4.21
EBPL-204ENST00000378272 OSCARQ8IYS5 282 aa41.27■■■■■ 4.2
EBPL-204ENST00000378272 PRDM2Q13029 1718 aa41.27■■■■■ 4.2
EBPL-204ENST00000378272 IFT140Q96RY7 1462 aa41.05■■■■■ 4.16
EBPL-204ENST00000378272 TOPBP1Q92547 1522 aa41■■■■■ 4.15
EBPL-204ENST00000378272 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
EBPL-204ENST00000378272 ABCC8Q09428 1581 aa40.95■■■■■ 4.15
EBPL-204ENST00000378272 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.82■■■■■ 4.13
EBPL-204ENST00000378272 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
EBPL-204ENST00000378272 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.64■■■■■ 4.1
EBPL-204ENST00000378272 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.64■■■■■ 4.1
EBPL-204ENST00000378272 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.64■■■■■ 4.1
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EBPL-204ENST00000378272 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.61■■■■■ 4.09
EBPL-204ENST00000378272 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
EBPL-204ENST00000378272 ARHGEF11O15085 1522 aa40.52■■■■■ 4.08
EBPL-204ENST00000378272 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.43■■■■■ 4.06
EBPL-204ENST00000378272 SOGA1O94964 1423 aa40.42■■■■■ 4.06
EBPL-204ENST00000378272 CHD1O14646 1710 aa40.39■■■■■ 4.06
EBPL-204ENST00000378272 FBLN2P98095 1184 aa40.36■■■■■ 4.05
EBPL-204ENST00000378272 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
EBPL-204ENST00000378272 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.3■■■■■ 4.04
EBPL-204ENST00000378272 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.28■■■■■ 4.04
EBPL-204ENST00000378272 CUX1P39880 1505 aa40.25■■■■■ 4.03
EBPL-204ENST00000378272 WDR97A6NE52 1622 aa40.23■■■■■ 4.03
EBPL-204ENST00000378272 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.16■■■■■ 4.02
EBPL-204ENST00000378272 ARAP1Q96P48 1450 aa40.13■■■■■ 4.01
EBPL-204ENST00000378272 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
EBPL-204ENST00000378272 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
EBPL-204ENST00000378272 GRIN2BQ13224 1484 aa40.07■■■■■ 4
EBPL-204ENST00000378272 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.99■■■■□ 3.99
EBPL-204ENST00000378272 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
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EBPL-204ENST00000378272 SYNJ1O43426 1573 aa39.94■■■■□ 3.98
EBPL-204ENST00000378272 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.91■■■■□ 3.98
EBPL-204ENST00000378272 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.86■■■■□ 3.97
EBPL-204ENST00000378272 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
EBPL-204ENST00000378272 PBRM1Q86U86 1689 aa39.81■■■■□ 3.96
EBPL-204ENST00000378272 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.76■■■■□ 3.95
EBPL-204ENST00000378272 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.7■■■■□ 3.95
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EBPL-204ENST00000378272 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.54■■■■□ 3.92
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EBPL-204ENST00000378272 CEP170Q5SW79 1584 aa39.38■■■■□ 3.89
EBPL-204ENST00000378272 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.35■■■■□ 3.89
EBPL-204ENST00000378272 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.33■■■■□ 3.89
EBPL-204ENST00000378272 SHROOM2Q13796 1616 aa39.24■■■■□ 3.87
EBPL-204ENST00000378272 JPH4Q96JJ6 628 aa39.07■■■■□ 3.85
EBPL-204ENST00000378272 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
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EBPL-204ENST00000378272 IGF1RP08069 1367 aa38.88■■■■□ 3.81
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