Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2E3

DHX30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30Q7L2E3 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 32.6
DHX30Q7L2E3 F11-AS1-203ENST00000508287 669 ntTSL 36.63□□□□□ -1.354e-7■■■■■ 32.6
DHX30Q7L2E3 SUZ12P1-204ENST00000579526 563 ntTSL 225.39■■□□□ 1.662e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.652e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ESRRA-206ENST00000539594 747 ntTSL 332.88■■■□□ 2.852e-7■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ATP6AP1-205ENST00000446552 571 ntTSL 429.18■■■□□ 2.269e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ATP6AP1-203ENST00000429585 769 ntTSL 529.18■■■□□ 2.269e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.122e-7■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ATP6AP1-206ENST00000449556 720 ntTSL 527.08■■□□□ 1.939e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ATP6AP1-204ENST00000439372 604 ntTSL 426.72■■□□□ 1.879e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CYHR1-207ENST00000528558 907 ntTSL 225.92■■□□□ 1.749e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.684e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.652e-7■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ATP6AP1-202ENST00000422890 867 ntTSL 523.28■■□□□ 1.329e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 STARD7-202ENST00000443962 742 ntTSL 522.65■■□□□ 1.229e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.29e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.22e-7■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ASPSCR1-210ENST00000581608 2387 ntTSL 221.81■■□□□ 1.089e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.029e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ASPSCR1-221ENST00000585274 984 ntTSL 521.33■■□□□ 1.019e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.619e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.619e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.569e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 FURIN-203ENST00000559353 587 ntTSL 318.53■□□□□ 0.569e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 FURIN-205ENST00000560824 580 ntTSL 317.91■□□□□ 0.469e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.419e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.49e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 TRIM11-203ENST00000475775 693 ntTSL 217.52■□□□□ 0.49e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 TRIM11-205ENST00000602308 586 ntTSL 317.41■□□□□ 0.389e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CLPTM1L-214ENST00000513250 567 ntTSL 317.22■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.319e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 TRIM11-206ENST00000602582 682 ntTSL 316.96■□□□□ 0.319e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.274e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.259e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-224ENST00000534254 1019 ntTSL 516.07■□□□□ 0.169e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.169e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CLPTM1L-203ENST00000503151 627 ntTSL 315.89■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ATP6AP1-207ENST00000455205 4515 ntTSL 215.69■□□□□ 0.19e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-219ENST00000531859 834 ntTSL 515.29■□□□□ 0.049e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CLPTM1L-210ENST00000508765 631 ntTSL 315.14■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.139e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ASPSCR1-205ENST00000578236 3277 ntTSL 214.19□□□□□ -0.149e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.149e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 BRD1-204ENST00000438393 3051 ntTSL 214.13□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.249e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.259e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.269e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-207ENST00000524832 878 ntTSL 212.8□□□□□ -0.369e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.369e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CLPTM1L-202ENST00000503042 3540 ntTSL 212.75□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 TBCD-205ENST00000571618 775 ntTSL 312.67□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 GAK-210ENST00000507991 328 ntTSL 512.26□□□□□ -0.459e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 BRD1-203ENST00000404760 4550 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 CHID1-210ENST00000526714 976 ntTSL 512.1□□□□□ -0.479e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.719e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.729e-8■■■■■ 32.5
DHX30Q7L2E3 ALB-218ENST00000515133 665 ntTSL 210.52□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 32.4
DHX30Q7L2E3 ALB-215ENST00000510166 532 ntTSL 310.52□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 32.4
DHX30Q7L2E3 DHRS3-201ENST00000430996 826 ntTSL 321.97■■□□□ 1.113e-7■■■■■ 32.3
DHX30Q7L2E3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.063e-7■■■■■ 32.3
DHX30Q7L2E3 DHRS3-203ENST00000482265 1036 ntTSL 317.76■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 32.3
DHX30Q7L2E3 DHRS3-202ENST00000464917 539 ntTSL 315.73■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 32.3
DHX30Q7L2E3 AHDC1-205ENST00000490295 511 ntTSL 518.8■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 32.3
DHX30Q7L2E3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 32.3
DHX30Q7L2E3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 32.3
DHX30Q7L2E3 CXXC5-210ENST00000509238 542 ntTSL 219.41■□□□□ 0.71e-9■■■■■ 32.3
DHX30Q7L2E3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.953e-6■■■■■ 32.2
DHX30Q7L2E3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 32.2
DHX30Q7L2E3 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 32.2
DHX30Q7L2E3 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 32.2
DHX30Q7L2E3 PCMTD2-209ENST00000609818 551 ntTSL 47.93□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 32.2
DHX30Q7L2E3 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 32.2
DHX30Q7L2E3 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 231.54■■■□□ 2.641e-6■■■■■ 32.1
DHX30Q7L2E3 CAPN15-207ENST00000568988 911 ntTSL 331.54■■■□□ 2.641e-6■■■■■ 32.1
DHX30Q7L2E3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.512e-6■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-222ENST00000607805 969 ntTSL 525.19■■□□□ 1.625e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-211ENST00000485399 1373 ntTSL 224.9■■□□□ 1.585e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-215ENST00000494174 859 ntTSL 523.2■■□□□ 1.35e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.285e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-213ENST00000488489 2142 ntTSL 222.34■■□□□ 1.175e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-220ENST00000606699 1022 ntTSL 222.15■■□□□ 1.145e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.015e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-214ENST00000493590 625 ntTSL 519.91■□□□□ 0.785e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-203ENST00000439478 925 ntTSL 517.03■□□□□ 0.325e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 NECAB3-219ENST00000606690 900 ntTSL 517.03■□□□□ 0.325e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 GAK-204ENST00000504435 4346 ntTSL 212.14□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 32
DHX30Q7L2E3 RAI1-204ENST00000489697 1570 ntTSL 318.34■□□□□ 0.536e-7■■■■■ 31.8
DHX30Q7L2E3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.56e-7■■■■■ 31.8
DHX30Q7L2E3 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 31.8
DHX30Q7L2E3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.682e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 USF2-215ENST00000602164 582 ntTSL 331.43■■■□□ 2.623e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.843e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.783e-6■■■■■ 31.5
DHX30Q7L2E3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.743e-6■■■■■ 31.5
Retrieved 100 of 5,617 protein–RNA pairs in 66.7 ms