RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539594.5

ESRRA-206, Transcript of estrogen related receptor alpha, humanhuman

TSL 3

Gene ESRRA, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRA-206ENST00000539594 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.32■■■■■ 8.53
ESRRA-206ENST00000539594 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.88■■■■■ 7.34
ESRRA-206ENST00000539594 ABCC9O60706 1549 aa59.59■■■■■ 7.13
ESRRA-206ENST00000539594 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.37■■■■■ 6.77
ESRRA-206ENST00000539594 NACADO15069 1562 aa57.28■■■■■ 6.76
ESRRA-206ENST00000539594 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.08■■■■■ 6.73
ESRRA-206ENST00000539594 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.92■■■■■ 6.7
ESRRA-206ENST00000539594 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.88■■■■■ 6.7
ESRRA-206ENST00000539594 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.6■■■■■ 6.65
ESRRA-206ENST00000539594 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.01■■■■■ 6.56
ESRRA-206ENST00000539594 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.63■■■■■ 6.5
ESRRA-206ENST00000539594 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.55■■■■■ 6.48
ESRRA-206ENST00000539594 SCRIBQ14160 1630 aa55.42■■■■■ 6.46
ESRRA-206ENST00000539594 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.12■■■■■ 6.41
ESRRA-206ENST00000539594 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.77■■■■■ 6.36
ESRRA-206ENST00000539594 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.13■■■■■ 6.26
ESRRA-206ENST00000539594 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.94■■■■■ 6.23
ESRRA-206ENST00000539594 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.61■■■■■ 6.17
ESRRA-206ENST00000539594 SMARCA4P51532 1647 aa53.05■■■■■ 6.08
ESRRA-206ENST00000539594 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.01■■■■■ 6.08
ESRRA-206ENST00000539594 NCAPD3P42695 1498 aa52.82■■■■■ 6.05
ESRRA-206ENST00000539594 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.79■■■■■ 6.04
ESRRA-206ENST00000539594 SMARCA2P51531 1590 aa52.79■■■■■ 6.04
ESRRA-206ENST00000539594 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.59■■■■■ 6.01
ESRRA-206ENST00000539594 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.58■■■■■ 6.01
ESRRA-206ENST00000539594 HMGXB3Q12766 1538 aa52.56■■■■■ 6.01
ESRRA-206ENST00000539594 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.37■■■■■ 5.97
ESRRA-206ENST00000539594 WIZO95785 1651 aa52.03■■■■■ 5.92
ESRRA-206ENST00000539594 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.97■■■■■ 5.91
ESRRA-206ENST00000539594 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.52■■■■■ 5.84
ESRRA-206ENST00000539594 NESP48681 1621 aa51.49■■■■■ 5.83
ESRRA-206ENST00000539594 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.48■■■■■ 5.83
ESRRA-206ENST00000539594 ERCC6Q03468 1493 aa51.45■■■■■ 5.83
ESRRA-206ENST00000539594 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.27■■■■■ 5.8
ESRRA-206ENST00000539594 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.14■■■■■ 5.78
ESRRA-206ENST00000539594 CUX2O14529 1486 aa51.01■■■■■ 5.76
ESRRA-206ENST00000539594 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.95■■■■■ 5.75
ESRRA-206ENST00000539594 CFTRP13569 1480 aa50.93■■■■■ 5.74
ESRRA-206ENST00000539594 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.87■■■■■ 5.73
ESRRA-206ENST00000539594 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.81■■■■■ 5.72
ESRRA-206ENST00000539594 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.66■■■■■ 5.7
ESRRA-206ENST00000539594 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.64■■■■■ 5.7
ESRRA-206ENST00000539594 PRDM2Q13029 1718 aa50.59■■■■■ 5.69
ESRRA-206ENST00000539594 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.59■■■■■ 5.69
ESRRA-206ENST00000539594 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.48■■■■■ 5.67
ESRRA-206ENST00000539594 WDR62O43379 1518 aa50.43■■■■■ 5.66
ESRRA-206ENST00000539594 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.13■■■■■ 5.62
ESRRA-206ENST00000539594 ABCC8Q09428 1581 aa49.92■■■■■ 5.58
ESRRA-206ENST00000539594 TOPBP1Q92547 1522 aa49.83■■■■■ 5.57
ESRRA-206ENST00000539594 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.79■■■■■ 5.56
ESRRA-206ENST00000539594 IFT140Q96RY7 1462 aa49.6■■■■■ 5.53
ESRRA-206ENST00000539594 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.57■■■■■ 5.53
ESRRA-206ENST00000539594 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.39■■■■■ 5.5
ESRRA-206ENST00000539594 CUX1P39880 1505 aa49.37■■■■■ 5.49
ESRRA-206ENST00000539594 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.3■■■■■ 5.48
ESRRA-206ENST00000539594 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.29■■■■■ 5.48
ESRRA-206ENST00000539594 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.24■■■■■ 5.47
ESRRA-206ENST00000539594 SOGA1O94964 1423 aa49.19■■■■■ 5.47
ESRRA-206ENST00000539594 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.14■■■■■ 5.46
ESRRA-206ENST00000539594 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.13■■■■■ 5.46
ESRRA-206ENST00000539594 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.03■■■■■ 5.448e-13■■■■□ 21.5
ESRRA-206ENST00000539594 WDR97A6NE52 1622 aa49.01■■■■■ 5.44
ESRRA-206ENST00000539594 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49■■■■■ 5.444e-7■■■■■ 27.8
ESRRA-206ENST00000539594 TOP2BQ02880 1626 aa48.95■■■■■ 5.43
ESRRA-206ENST00000539594 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.95■■■■■ 5.43
ESRRA-206ENST00000539594 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.9■■■■■ 5.42
ESRRA-206ENST00000539594 SYNJ1O43426 1573 aa48.87■■■■■ 5.41
ESRRA-206ENST00000539594 OSCARQ8IYS5 282 aa48.85■■■■■ 5.41
ESRRA-206ENST00000539594 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.79■■■■■ 5.4
ESRRA-206ENST00000539594 GRIN2BQ13224 1484 aa48.67■■■■■ 5.38
ESRRA-206ENST00000539594 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.64■■■■■ 5.38
ESRRA-206ENST00000539594 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.59■■■■■ 5.37
ESRRA-206ENST00000539594 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.58■■■■■ 5.37
ESRRA-206ENST00000539594 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.57■■■■■ 5.37
ESRRA-206ENST00000539594 CHD1O14646 1710 aa48.55■■■■■ 5.36
ESRRA-206ENST00000539594 PBRM1Q86U86 1689 aa48.55■■■■■ 5.36
ESRRA-206ENST00000539594 FBLN2P98095 1184 aa48.47■■■■■ 5.35
ESRRA-206ENST00000539594 SYNJ2O15056 1496 aa48.37■■■■■ 5.33
ESRRA-206ENST00000539594 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.36■■■■■ 5.33
ESRRA-206ENST00000539594 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.24■■■■■ 5.31
ESRRA-206ENST00000539594 ADAMTS12P58397 1594 aa48.13■■■■■ 5.3
ESRRA-206ENST00000539594 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.09■■■■■ 5.29
ESRRA-206ENST00000539594 KIF27Q86VH2 1401 aa48.06■■■■■ 5.28
ESRRA-206ENST00000539594 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.03■■■■■ 5.28
ESRRA-206ENST00000539594 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.03■■■■■ 5.28
ESRRA-206ENST00000539594 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.03■■■■■ 5.28
ESRRA-206ENST00000539594 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.03■■■■■ 5.28
ESRRA-206ENST00000539594 GRIN2AQ12879 1464 aa48.02■■■■■ 5.28
ESRRA-206ENST00000539594 ARHGEF11O15085 1522 aa48.02■■■■■ 5.28
ESRRA-206ENST00000539594 IGF1RP08069 1367 aa47.83■■■■■ 5.25
ESRRA-206ENST00000539594 NUP160Q12769 1436 aa47.82■■■■■ 5.25
ESRRA-206ENST00000539594 TRIM41Q8WV44 630 aa47.82■■■■■ 5.25
ESRRA-206ENST00000539594 CUL7Q14999 1698 aa47.78■■■■■ 5.24
ESRRA-206ENST00000539594 CEP170Q5SW79 1584 aa47.75■■■■■ 5.23
ESRRA-206ENST00000539594 ARAP1Q96P48 1450 aa47.59■■■■■ 5.21
ESRRA-206ENST00000539594 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.56■■■■■ 5.2
ESRRA-206ENST00000539594 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.56■■■■■ 5.2
ESRRA-206ENST00000539594 SHROOM2Q13796 1616 aa47.48■■■■■ 5.19
ESRRA-206ENST00000539594 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.43■■■■■ 5.18
ESRRA-206ENST00000539594 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa47.35■■■■■ 5.17
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