RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489697.1

RAI1-204, Transcript of retinoic acid induced 1, humanhuman

TSL 3

Gene RAI1, Length 1,570 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI1-204ENST00000489697 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.79■■■■□ 3.64
RAI1-204ENST00000489697 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.33■■■□□ 2.93
RAI1-204ENST00000489697 ABCC9O60706 1549 aa32.29■■■□□ 2.76
RAI1-204ENST00000489697 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
RAI1-204ENST00000489697 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.5■■■□□ 2.63
RAI1-204ENST00000489697 NACADO15069 1562 aa31.27■■■□□ 2.6
RAI1-204ENST00000489697 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.25■■■□□ 2.59
RAI1-204ENST00000489697 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.2■■■□□ 2.59
RAI1-204ENST00000489697 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.2■■■□□ 2.59
RAI1-204ENST00000489697 SCRIBQ14160 1630 aa30.53■■■□□ 2.48
RAI1-204ENST00000489697 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.48■■■□□ 2.47
RAI1-204ENST00000489697 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.29■■■□□ 2.44
RAI1-204ENST00000489697 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.25■■■□□ 2.43
RAI1-204ENST00000489697 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.22■■■□□ 2.43
RAI1-204ENST00000489697 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.42■■■□□ 2.3
RAI1-204ENST00000489697 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
RAI1-204ENST00000489697 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.26■■■□□ 2.28
RAI1-204ENST00000489697 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
RAI1-204ENST00000489697 SMARCA4P51532 1647 aa29.21■■■□□ 2.27
RAI1-204ENST00000489697 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.19■■■□□ 2.26
RAI1-204ENST00000489697 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.15■■■□□ 2.26
RAI1-204ENST00000489697 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
RAI1-204ENST00000489697 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.97■■■□□ 2.23
RAI1-204ENST00000489697 SMARCA2P51531 1590 aa28.93■■■□□ 2.22
RAI1-204ENST00000489697 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.9■■■□□ 2.22
RAI1-204ENST00000489697 NCAPD3P42695 1498 aa28.87■■■□□ 2.21
RAI1-204ENST00000489697 WIZO95785 1651 aa28.85■■■□□ 2.21
RAI1-204ENST00000489697 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
RAI1-204ENST00000489697 HMGXB3Q12766 1538 aa28.74■■■□□ 2.19
RAI1-204ENST00000489697 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
RAI1-204ENST00000489697 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
RAI1-204ENST00000489697 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.26■■■□□ 2.11
RAI1-204ENST00000489697 NESP48681 1621 aa28.07■■■□□ 2.08
RAI1-204ENST00000489697 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.07■■■□□ 2.08
RAI1-204ENST00000489697 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.02■■■□□ 2.08
RAI1-204ENST00000489697 CFTRP13569 1480 aa27.98■■■□□ 2.07
RAI1-204ENST00000489697 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.84■■■□□ 2.05
RAI1-204ENST00000489697 ERCC6Q03468 1493 aa27.79■■■□□ 2.04
RAI1-204ENST00000489697 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.75■■■□□ 2.03
RAI1-204ENST00000489697 PRDM2Q13029 1718 aa27.75■■■□□ 2.03
RAI1-204ENST00000489697 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.71■■■□□ 2.03
RAI1-204ENST00000489697 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.66■■■□□ 2.02
RAI1-204ENST00000489697 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.52■■■□□ 2
RAI1-204ENST00000489697 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
RAI1-204ENST00000489697 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
RAI1-204ENST00000489697 WDR62O43379 1518 aa27.4■■□□□ 1.98
RAI1-204ENST00000489697 ABCC8Q09428 1581 aa27.37■■□□□ 1.97
RAI1-204ENST00000489697 TOPBP1Q92547 1522 aa27.35■■□□□ 1.97
RAI1-204ENST00000489697 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.34■■□□□ 1.97
RAI1-204ENST00000489697 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
RAI1-204ENST00000489697 CUX1P39880 1505 aa27.31■■□□□ 1.96
RAI1-204ENST00000489697 CUX2O14529 1486 aa27.28■■□□□ 1.96
RAI1-204ENST00000489697 SYNJ1O43426 1573 aa27.21■■□□□ 1.95
RAI1-204ENST00000489697 TOP2BQ02880 1626 aa27.18■■□□□ 1.94
RAI1-204ENST00000489697 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.16■■□□□ 1.94
RAI1-204ENST00000489697 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.15■■□□□ 1.94
RAI1-204ENST00000489697 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
RAI1-204ENST00000489697 SOGA1O94964 1423 aa27.07■■□□□ 1.92
RAI1-204ENST00000489697 IFT140Q96RY7 1462 aa27.06■■□□□ 1.92
RAI1-204ENST00000489697 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.06■■□□□ 1.92
RAI1-204ENST00000489697 TRIM41Q8WV44 630 aa27.03■■□□□ 1.92
RAI1-204ENST00000489697 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.01■■□□□ 1.91
RAI1-204ENST00000489697 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
RAI1-204ENST00000489697 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
RAI1-204ENST00000489697 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.9■■□□□ 1.9
RAI1-204ENST00000489697 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
RAI1-204ENST00000489697 WDR97A6NE52 1622 aa26.85■■□□□ 1.89
RAI1-204ENST00000489697 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
RAI1-204ENST00000489697 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
RAI1-204ENST00000489697 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.74■■□□□ 1.87
RAI1-204ENST00000489697 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.73■■□□□ 1.87
RAI1-204ENST00000489697 KIF27Q86VH2 1401 aa26.71■■□□□ 1.87
RAI1-204ENST00000489697 GRIN2BQ13224 1484 aa26.67■■□□□ 1.86
RAI1-204ENST00000489697 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.64■■□□□ 1.86
RAI1-204ENST00000489697 PBRM1Q86U86 1689 aa26.62■■□□□ 1.85
RAI1-204ENST00000489697 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.58■■□□□ 1.85
RAI1-204ENST00000489697 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.57■■□□□ 1.84
RAI1-204ENST00000489697 IGF1RP08069 1367 aa26.57■■□□□ 1.84
RAI1-204ENST00000489697 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
RAI1-204ENST00000489697 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
RAI1-204ENST00000489697 FBLN2P98095 1184 aa26.48■■□□□ 1.83
RAI1-204ENST00000489697 EEA1Q15075 1411 aa26.47■■□□□ 1.83
RAI1-204ENST00000489697 ADAMTS12P58397 1594 aa26.46■■□□□ 1.83
RAI1-204ENST00000489697 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.45■■□□□ 1.83
RAI1-204ENST00000489697 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
RAI1-204ENST00000489697 SYNJ2O15056 1496 aa26.44■■□□□ 1.82
RAI1-204ENST00000489697 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.44■■□□□ 1.82
RAI1-204ENST00000489697 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.42■■□□□ 1.82
RAI1-204ENST00000489697 CUL7Q14999 1698 aa26.4■■□□□ 1.82
RAI1-204ENST00000489697 CHD1O14646 1710 aa26.37■■□□□ 1.81
RAI1-204ENST00000489697 GRIN2AQ12879 1464 aa26.33■■□□□ 1.81
RAI1-204ENST00000489697 PRXQ9BXM0 1461 aa26.3■■□□□ 1.8
RAI1-204ENST00000489697 OSCARQ8IYS5 282 aa26.29■■□□□ 1.8
RAI1-204ENST00000489697 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.29■■□□□ 1.8
RAI1-204ENST00000489697 NUP160Q12769 1436 aa26.19■■□□□ 1.78
RAI1-204ENST00000489697 CEP170Q5SW79 1584 aa26.18■■□□□ 1.78
RAI1-204ENST00000489697 KIF21BO75037 1637 aa26.16■■□□□ 1.78
RAI1-204ENST00000489697 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.15■■□□□ 1.78
RAI1-204ENST00000489697 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.1■■□□□ 1.77
RAI1-204ENST00000489697 GOLGA3Q08378 1498 aa26.07■■□□□ 1.76
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