Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2E3

DHX30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30Q7L2E3 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)24.14■■□□□ 1.452e-107■■■■■ 542.7
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DHX30Q7L2E3 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)24.41■■□□□ 1.51e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 221.12■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 220.1■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 406.9
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DHX30Q7L2E3 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 406.9
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DHX30Q7L2E3 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 510.96□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 310.68□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 510.68□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 39.78□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 49.3□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 406.9
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DHX30Q7L2E3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.144e-50■■■■■ 143.6
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DHX30Q7L2E3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.044e-50■■■■■ 143.6
DHX30Q7L2E3 OPA1-214ENST00000482865 567 ntTSL 48.18□□□□□ -1.14e-50■■■■■ 143.6
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DHX30Q7L2E3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 79.9
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DHX30Q7L2E3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 79.9
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DHX30Q7L2E3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.461e-11■■■■■ 78.5
DHX30Q7L2E3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.171e-11■■■■■ 78.5
DHX30Q7L2E3 ADAM23-203ENST00000444281 460 ntTSL 39.16□□□□□ -0.941e-11■■■■■ 78.5
DHX30Q7L2E3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.154e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.734e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.394e-10■■■■■ 77.9
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DHX30Q7L2E3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.014e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.884e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.794e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.734e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 ERICH1-202ENST00000518277 788 ntTSL 219.27■□□□□ 0.684e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.664e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.654e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.654e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 ERICH1-211ENST00000524138 682 ntTSL 318.92■□□□□ 0.624e-10■■■■■ 77.9
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DHX30Q7L2E3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.314e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.084e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.074e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.287e-8■■■■■ 76.6
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