Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 PSMF1-204ENST00000381898 642 ntTSL 314.48□□□□□ -0.095e-9■■■■■ 45.6
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AGGF1Q8N302 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-13■■■■■ 45.5
AGGF1Q8N302 RIN2-205ENST00000467569 871 ntTSL 513.08□□□□□ -0.322e-13■■■■■ 45.5
AGGF1Q8N302 RIN2-201ENST00000255006 4505 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.562e-13■■■■■ 45.5
AGGF1Q8N302 RIN2-203ENST00000459721 437 ntTSL 511.34□□□□□ -0.592e-13■■■■■ 45.5
AGGF1Q8N302 RIN2-207ENST00000488077 462 ntTSL 57.17□□□□□ -1.262e-13■■■■■ 45.5
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AGGF1Q8N302 RGCC-202ENST00000487837 243 ntTSL 313.58□□□□□ -0.242e-8■■■■■ 45.2
AGGF1Q8N302 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 44.9
AGGF1Q8N302 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.643e-7■■■■■ 44.8
AGGF1Q8N302 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 44.8
AGGF1Q8N302 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 312.37□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 44.8
AGGF1Q8N302 KDM4B-205ENST00000588337 504 ntTSL 525.86■■□□□ 1.736e-8■■■■■ 44.8
AGGF1Q8N302 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.656e-8■■■■■ 44.8
AGGF1Q8N302 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.456e-8■■■■■ 44.8
AGGF1Q8N302 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.386e-8■■■■■ 44.8
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AGGF1Q8N302 PUM2-206ENST00000424110 546 ntTSL 413.3□□□□□ -0.285e-15■■■■■ 44.7
AGGF1Q8N302 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.395e-15■■■■■ 44.7
AGGF1Q8N302 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.475e-15■■■■■ 44.7
AGGF1Q8N302 PUM2-210ENST00000442400 955 ntTSL 58.6□□□□□ -1.035e-15■■■■■ 44.7
AGGF1Q8N302 PUM2-208ENST00000432105 584 ntTSL 56.51□□□□□ -1.375e-15■■■■■ 44.7
AGGF1Q8N302 PUM2-207ENST00000429419 547 ntTSL 55.67□□□□□ -1.55e-15■■■■■ 44.7
AGGF1Q8N302 PUM2-205ENST00000420234 562 ntTSL 55.27□□□□□ -1.575e-15■■■■■ 44.7
AGGF1Q8N302 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.721e-12■■■■■ 44.5
AGGF1Q8N302 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.531e-12■■■■■ 44.5
AGGF1Q8N302 LRRC20-202ENST00000357631 2906 ntTSL 218.37■□□□□ 0.531e-12■■■■■ 44.5
AGGF1Q8N302 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.291e-12■■■■■ 44.5
AGGF1Q8N302 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.051e-12■■■■■ 44.5
AGGF1Q8N302 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-12■■■■■ 44.5
AGGF1Q8N302 LRRC20-207ENST00000446961 663 ntTSL 213.66□□□□□ -0.221e-12■■■■■ 44.5
AGGF1Q8N302 MAPK8IP3-210ENST00000566589 873 ntTSL 515.4■□□□□ 0.062e-9■■■■■ 44.3
AGGF1Q8N302 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 44.2
AGGF1Q8N302 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 44.2
AGGF1Q8N302 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 44.2
AGGF1Q8N302 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.26■□□□□ 0.677e-10■■■■■ 44.1
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AGGF1Q8N302 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC5.98□□□□□ -1.457e-10■■■■■ 44.1
AGGF1Q8N302 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.467e-10■■■■■ 44.1
AGGF1Q8N302 DMAC2-209ENST00000590641 1026 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.852e-11■■■■■ 44
AGGF1Q8N302 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 43.9
AGGF1Q8N302 FRYL-216ENST00000513401 3057 ntTSL 1 (best)3.2□□□□□ -1.92e-8■■■■■ 43.9
AGGF1Q8N302 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 43.8
AGGF1Q8N302 DDR1-244ENST00000482873 2673 ntTSL 516.09■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 43.7
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AGGF1Q8N302 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.325e-7■■■■■ 43.7
AGGF1Q8N302 DDR1-224ENST00000376567 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 43.7
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AGGF1Q8N302 DDR1-227ENST00000376570 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.515e-7■■■■■ 43.7
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AGGF1Q8N302 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 43.7
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AGGF1Q8N302 PSMG3-AS1-206ENST00000533935 542 ntTSL 411.05□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 43.7
AGGF1Q8N302 SH3TC1-214ENST00000508183 1410 ntTSL 1 (best)18.59■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 43.6
AGGF1Q8N302 SH3TC1-223ENST00000513495 600 ntTSL 415.61■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 43.6
AGGF1Q8N302 SH3TC1-220ENST00000511002 1124 ntTSL 515.42■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 43.6
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AGGF1Q8N302 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 43.6
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AGGF1Q8N302 SLC8B1-207ENST00000549181 925 ntTSL 318.28■□□□□ 0.524e-11■■■■■ 43.6
AGGF1Q8N302 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.049e-13■■■■■ 43.5
AGGF1Q8N302 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.239e-13■■■■■ 43.5
AGGF1Q8N302 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.083e-12■■■■■ 43.5
AGGF1Q8N302 FAM189A1-204ENST00000560082 533 ntTSL 411.77□□□□□ -0.533e-12■■■■■ 43.5
AGGF1Q8N302 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.631e-8■■■■■ 43.4
AGGF1Q8N302 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.681e-8■■■■■ 43.4
AGGF1Q8N302 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.861e-8■■■■■ 43.4
AGGF1Q8N302 POLG-204ENST00000526398 512 ntTSL 314.51□□□□□ -0.093e-11■■■■■ 43.1
AGGF1Q8N302 POLG-215ENST00000635986 2351 ntTSL 514.08□□□□□ -0.163e-11■■■■■ 43.1
AGGF1Q8N302 POLG-205ENST00000526573 544 ntTSL 412.91□□□□□ -0.343e-11■■■■■ 43.1
AGGF1Q8N302 POLG-211ENST00000532584 708 ntTSL 312.04□□□□□ -0.483e-11■■■■■ 43.1
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AGGF1Q8N302 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.489e-9■■■■■ 43.1
AGGF1Q8N302 PARVG-201ENST00000356909 1425 ntTSL 517.87■□□□□ 0.459e-9■■■■■ 43.1
AGGF1Q8N302 PARVG-212ENST00000475485 2614 ntTSL 514.98□□□□□ -0.019e-9■■■■■ 43.1
AGGF1Q8N302 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.129e-9■■■■■ 43.1
AGGF1Q8N302 PARVG-209ENST00000468564 5066 ntTSL 513.01□□□□□ -0.339e-9■■■■■ 43.1
AGGF1Q8N302 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 43
AGGF1Q8N302 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 43
AGGF1Q8N302 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.641e-8■■■■■ 43
AGGF1Q8N302 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.721e-8■■■■■ 43
AGGF1Q8N302 PRR5-ARHGAP8-204ENST00000515632 1590 ntTSL 214.3□□□□□ -0.121e-8■■■■■ 43
AGGF1Q8N302 CPT1A-207ENST00000561996 559 ntTSL 417.72■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 43
AGGF1Q8N302 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 43
AGGF1Q8N302 CPT1A-201ENST00000265641 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 43
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