RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379359.3

RGCC-201, Transcript of regulator of cell cycle, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RGCC, Length 960 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGCC-201ENST00000379359 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.19■■■■■ 5.46
RGCC-201ENST00000379359 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.93■■■■■ 4.62
RGCC-201ENST00000379359 ABCC9O60706 1549 aa43.62■■■■■ 4.57
RGCC-201ENST00000379359 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.67■■■■■ 4.26
RGCC-201ENST00000379359 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.57■■■■■ 4.25
RGCC-201ENST00000379359 NACADO15069 1562 aa41.46■■■■■ 4.23
RGCC-201ENST00000379359 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.96■■■■■ 4.15
RGCC-201ENST00000379359 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
RGCC-201ENST00000379359 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.71■■■■■ 4.11
RGCC-201ENST00000379359 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.62■■■■■ 4.09
RGCC-201ENST00000379359 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.61■■■■■ 4.09
RGCC-201ENST00000379359 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.44■■■■■ 4.06
RGCC-201ENST00000379359 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.34■■■■■ 4.05
RGCC-201ENST00000379359 SCRIBQ14160 1630 aa40.15■■■■■ 4.02
RGCC-201ENST00000379359 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.88■■■■□ 3.98
RGCC-201ENST00000379359 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.9
RGCC-201ENST00000379359 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.36■■■■□ 3.89
RGCC-201ENST00000379359 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.24■■■■□ 3.87
RGCC-201ENST00000379359 SMARCA4P51532 1647 aa38.28■■■■□ 3.72
RGCC-201ENST00000379359 NCAPD3P42695 1498 aa38.25■■■■□ 3.71
RGCC-201ENST00000379359 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.22■■■■□ 3.71
RGCC-201ENST00000379359 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
RGCC-201ENST00000379359 SMARCA2P51531 1590 aa38.16■■■■□ 3.7
RGCC-201ENST00000379359 HMGXB3Q12766 1538 aa38.02■■■■□ 3.68
RGCC-201ENST00000379359 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
RGCC-201ENST00000379359 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.91■■■■□ 3.66
RGCC-201ENST00000379359 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.85■■■■□ 3.65
RGCC-201ENST00000379359 ERCC6Q03468 1493 aa37.7■■■■□ 3.63
RGCC-201ENST00000379359 NESP48681 1621 aa37.54■■■■□ 3.6
RGCC-201ENST00000379359 WIZO95785 1651 aa37.48■■■■□ 3.59
RGCC-201ENST00000379359 CUX2O14529 1486 aa37.38■■■■□ 3.57
RGCC-201ENST00000379359 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.35■■■■□ 3.57
RGCC-201ENST00000379359 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
RGCC-201ENST00000379359 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.18■■■■□ 3.54
RGCC-201ENST00000379359 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.16■■■■□ 3.54
RGCC-201ENST00000379359 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.05■■■■□ 3.52
RGCC-201ENST00000379359 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
RGCC-201ENST00000379359 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
RGCC-201ENST00000379359 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.86■■■■□ 3.49
RGCC-201ENST00000379359 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.81■■■■□ 3.48
RGCC-201ENST00000379359 CFTRP13569 1480 aa36.78■■■■□ 3.48
RGCC-201ENST00000379359 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.77■■■■□ 3.48
RGCC-201ENST00000379359 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.75■■■■□ 3.47
RGCC-201ENST00000379359 WDR62O43379 1518 aa36.65■■■■□ 3.46
RGCC-201ENST00000379359 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.64■■■■□ 3.46
RGCC-201ENST00000379359 PRDM2Q13029 1718 aa36.43■■■■□ 3.42
RGCC-201ENST00000379359 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
RGCC-201ENST00000379359 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
RGCC-201ENST00000379359 TOPBP1Q92547 1522 aa36.08■■■■□ 3.37
RGCC-201ENST00000379359 ABCC8Q09428 1581 aa36.06■■■■□ 3.36
RGCC-201ENST00000379359 IFT140Q96RY7 1462 aa36■■■■□ 3.35
RGCC-201ENST00000379359 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.99■■■■□ 3.35
RGCC-201ENST00000379359 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
RGCC-201ENST00000379359 OSCARQ8IYS5 282 aa35.81■■■■□ 3.32
RGCC-201ENST00000379359 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
RGCC-201ENST00000379359 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
RGCC-201ENST00000379359 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
RGCC-201ENST00000379359 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.64■■■■□ 3.3
RGCC-201ENST00000379359 SOGA1O94964 1423 aa35.64■■■■□ 3.3
RGCC-201ENST00000379359 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.62■■■■□ 3.29
RGCC-201ENST00000379359 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.6■■■■□ 3.29
RGCC-201ENST00000379359 CUX1P39880 1505 aa35.59■■■■□ 3.29
RGCC-201ENST00000379359 TRIM41Q8WV44 630 aa35.58■■■■□ 3.29
RGCC-201ENST00000379359 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.27
RGCC-201ENST00000379359 FBLN2P98095 1184 aa35.46■■■■□ 3.27
RGCC-201ENST00000379359 WDR97A6NE52 1622 aa35.36■■■■□ 3.25
RGCC-201ENST00000379359 CHD1O14646 1710 aa35.34■■■■□ 3.25
RGCC-201ENST00000379359 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.29■■■■□ 3.24
RGCC-201ENST00000379359 GRIN2BQ13224 1484 aa35.26■■■■□ 3.23
RGCC-201ENST00000379359 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.23■■■■□ 3.23
RGCC-201ENST00000379359 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.22■■■■□ 3.23
RGCC-201ENST00000379359 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.22■■■■□ 3.23
RGCC-201ENST00000379359 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.22■■■■□ 3.23
RGCC-201ENST00000379359 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
RGCC-201ENST00000379359 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
RGCC-201ENST00000379359 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.19■■■■□ 3.22
RGCC-201ENST00000379359 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.19■■■■□ 3.22
RGCC-201ENST00000379359 ARHGEF11O15085 1522 aa35.16■■■■□ 3.22
RGCC-201ENST00000379359 TOP2BQ02880 1626 aa35.14■■■■□ 3.22
RGCC-201ENST00000379359 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.12■■■■□ 3.21
RGCC-201ENST00000379359 SYNJ1O43426 1573 aa35.12■■■■□ 3.21
RGCC-201ENST00000379359 PBRM1Q86U86 1689 aa35.11■■■■□ 3.21
RGCC-201ENST00000379359 SYNJ2O15056 1496 aa35.08■■■■□ 3.21
RGCC-201ENST00000379359 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.07■■■■□ 3.21
RGCC-201ENST00000379359 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.97■■■■□ 3.19
RGCC-201ENST00000379359 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.92■■■■□ 3.18
RGCC-201ENST00000379359 ARAP1Q96P48 1450 aa34.84■■■■□ 3.17
RGCC-201ENST00000379359 ADAMTS12P58397 1594 aa34.81■■■■□ 3.16
RGCC-201ENST00000379359 GRIN2AQ12879 1464 aa34.78■■■■□ 3.16
RGCC-201ENST00000379359 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.76■■■■□ 3.16
RGCC-201ENST00000379359 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.76■■■■□ 3.15
RGCC-201ENST00000379359 CEP170Q5SW79 1584 aa34.62■■■■□ 3.13
RGCC-201ENST00000379359 NUP160Q12769 1436 aa34.61■■■■□ 3.13
RGCC-201ENST00000379359 KIF27Q86VH2 1401 aa34.55■■■■□ 3.12
RGCC-201ENST00000379359 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
RGCC-201ENST00000379359 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.43■■■■□ 3.1
RGCC-201ENST00000379359 IGF1RP08069 1367 aa34.42■■■■□ 3.1
RGCC-201ENST00000379359 SHROOM2Q13796 1616 aa34.38■■■■□ 3.09
RGCC-201ENST00000379359 CUL7Q14999 1698 aa34.36■■■■□ 3.09
RGCC-201ENST00000379359 JPH4Q96JJ6 628 aa34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms