Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.134e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 NPTN-210ENST00000567198 571 ntTSL 414.18□□□□□ -0.144e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.164e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.174e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 FLCN-207ENST00000466317 2684 ntTSL 213.79□□□□□ -0.24e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.254e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 PIGS-214ENST00000584080 584 ntTSL 413.34□□□□□ -0.274e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.344e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.374e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.414e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.454e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.494e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.514e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 VPS52-220ENST00000493674 878 ntTSL 211.77□□□□□ -0.534e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 PIGS-211ENST00000582615 699 ntTSL 211.31□□□□□ -0.64e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 PIGS-204ENST00000465444 578 ntTSL 511.25□□□□□ -0.614e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 PIGS-209ENST00000577620 608 ntTSL 411.25□□□□□ -0.614e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 VPS52-217ENST00000478934 2602 ntTSL 210.22□□□□□ -0.774e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 PIGS-210ENST00000580968 372 ntTSL 39.34□□□□□ -0.914e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 VPS52-216ENST00000471309 505 ntTSL 28.62□□□□□ -1.034e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 VDAC3-206ENST00000521158 949 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.114e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 ARL5A-203ENST00000446896 1268 ntTSL 26.19□□□□□ -1.424e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.434e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 VPS52-222ENST00000495981 743 ntTSL 1 (best)4.69□□□□□ -1.664e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 VDAC3-212ENST00000524291 533 ntTSL 24.5□□□□□ -1.694e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 CDCA2-205ENST00000523454 922 ntTSL 54.27□□□□□ -1.734e-7■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 ZNF638-206ENST00000437658 931 ntTSL 216.9■□□□□ 0.33e-6■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 ZNF638-205ENST00000417778 760 ntTSL 312.97□□□□□ -0.333e-6■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 ZNF638-209ENST00000455226 585 ntTSL 411.74□□□□□ -0.533e-6■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 ZNF638-207ENST00000454122 731 ntTSL 311.64□□□□□ -0.553e-6■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 ZNF638-208ENST00000454278 595 ntTSL 411.63□□□□□ -0.553e-6■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 ZNF638-220ENST00000487707 592 ntTSL 311.1□□□□□ -0.633e-6■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 RICTOR-210ENST00000515846 677 ntTSL 57.25□□□□□ -1.253e-6■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 RICTOR-205ENST00000509567 638 ntTSL 35.89□□□□□ -1.473e-6■■□□□ 12.9
TARDBPQ13148 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.751e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 LEF1-212ENST00000506680 1280 ntTSL 1 (best)19.55■□□□□ 0.721e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-223ENST00000591736 573 ntTSL 418.4■□□□□ 0.541e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-210ENST00000587463 461 ntTSL 518.4■□□□□ 0.541e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-215ENST00000588879 535 ntTSL 518.4■□□□□ 0.541e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.51e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.461e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-227ENST00000592266 589 ntTSL 417.51■□□□□ 0.391e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-224ENST00000591881 575 ntTSL 517.51■□□□□ 0.391e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 MRPL3-209ENST00000511168 1377 ntTSL 217.24■□□□□ 0.351e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.241e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.191e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-222ENST00000591333 557 ntTSL 416.18■□□□□ 0.181e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-211ENST00000587479 547 ntTSL 415.87■□□□□ 0.131e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-208ENST00000587263 579 ntTSL 515.48■□□□□ 0.071e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-221ENST00000591124 575 ntTSL 415.37■□□□□ 0.051e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-217ENST00000589886 472 ntTSL 414.94□□□□□ -0.021e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.021e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.051e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-213ENST00000587956 512 ntTSL 514.19□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-229ENST00000592771 1937 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.271e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-225ENST00000592133 562 ntTSL 412.9□□□□□ -0.341e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-228ENST00000592621 818 ntTSL 511.4□□□□□ -0.581e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-205ENST00000586117 524 ntTSL 411.24□□□□□ -0.611e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-203ENST00000439268 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.661e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-207ENST00000587159 554 ntTSL 510.78□□□□□ -0.681e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-202ENST00000340578 3233 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.691e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 SRCAP-202ENST00000395059 9126 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.721e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 LEF1-209ENST00000505297 873 ntTSL 310.43□□□□□ -0.741e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 SRCAP-205ENST00000483083 5937 ntTSL 210.37□□□□□ -0.751e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 SERINC1-201ENST00000339697 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.852e-9■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-219ENST00000590953 571 ntTSL 39.61□□□□□ -0.871e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 LEF1-219ENST00000512407 564 ntTSL 39.32□□□□□ -0.921e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-216ENST00000589353 490 ntTSL 59.21□□□□□ -0.941e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-204ENST00000585339 566 ntTSL 47.93□□□□□ -1.141e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.161e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.181e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-218ENST00000590623 786 ntTSL 57.54□□□□□ -1.21e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 LEF1-211ENST00000505379 1084 ntTSL 27.02□□□□□ -1.291e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 LEF1-215ENST00000510135 1376 ntTSL 26.71□□□□□ -1.331e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 LEF1-204ENST00000503879 1492 ntTSL 36.02□□□□□ -1.441e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 LEF1-205ENST00000504426 1479 ntTSL 35.89□□□□□ -1.471e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 LEF1-214ENST00000509428 1090 ntTSL 55.85□□□□□ -1.471e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 LEF1-206ENST00000504775 860 ntTSL 55.5□□□□□ -1.531e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 MRPL3-206ENST00000510043 640 ntTSL 24.85□□□□□ -1.631e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 RANBP3-214ENST00000588010 568 ntTSL 54.65□□□□□ -1.671e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 LEF1-220ENST00000514444 916 ntTSL 34.28□□□□□ -1.721e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 LEF1-210ENST00000505328 527 ntTSL 23.35□□□□□ -1.871e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 GOLGA4-207ENST00000437131 6947 ntTSL 1 (best)2.37□□□□□ -2.031e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.769e-9■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.289e-9■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.089e-9■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 CBFB-206ENST00000565389 846 ntTSL 1 (best)9.16□□□□□ -0.949e-9■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 CBFB-207ENST00000566281 484 ntTSL 25.24□□□□□ -1.579e-9■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 ANP32A-208ENST00000495420 707 ntTSL 217.79■□□□□ 0.443e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 516.06■□□□□ 0.163e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.083e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.163e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 BRD8-219ENST00000472478 745 ntTSL 310.12□□□□□ -0.792e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.12e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.172e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.182e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.252e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 BRD8-224ENST00000512140 2876 ntTSL 26.97□□□□□ -1.292e-6■■□□□ 12.8
TARDBPQ13148 BRD8-214ENST00000454473 3005 ntTSL 56.78□□□□□ -1.322e-6■■□□□ 12.8
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 387.4 ms