RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454278.5

ZNF638-208, Transcript of zinc finger protein 638, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF638, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF638-208ENST00000454278 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.64■■■□□ 2.17
ZNF638-208ENST00000454278 ABCC9O60706 1549 aa26.18■■□□□ 1.78
ZNF638-208ENST00000454278 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.01■■□□□ 1.75
ZNF638-208ENST00000454278 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.85■■□□□ 1.57
ZNF638-208ENST00000454278 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.8■■□□□ 1.56
ZNF638-208ENST00000454278 NACADO15069 1562 aa24.59■■□□□ 1.53
ZNF638-208ENST00000454278 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.37■■□□□ 1.49
ZNF638-208ENST00000454278 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
ZNF638-208ENST00000454278 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.16■■□□□ 1.46
ZNF638-208ENST00000454278 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.16■■□□□ 1.46
ZNF638-208ENST00000454278 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.05■■□□□ 1.44
ZNF638-208ENST00000454278 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.86■■□□□ 1.41
ZNF638-208ENST00000454278 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.72■■□□□ 1.39
ZNF638-208ENST00000454278 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.7■■□□□ 1.38
ZNF638-208ENST00000454278 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
ZNF638-208ENST00000454278 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.65■■□□□ 1.38
ZNF638-208ENST00000454278 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ZNF638-208ENST00000454278 SCRIBQ14160 1630 aa23.55■■□□□ 1.36
ZNF638-208ENST00000454278 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.09■■□□□ 1.29
ZNF638-208ENST00000454278 CUX2O14529 1486 aa22.81■■□□□ 1.24
ZNF638-208ENST00000454278 NCAPD3P42695 1498 aa22.66■■□□□ 1.22
ZNF638-208ENST00000454278 ERCC6Q03468 1493 aa22.65■■□□□ 1.22
ZNF638-208ENST00000454278 HMGXB3Q12766 1538 aa22.54■■□□□ 1.2
ZNF638-208ENST00000454278 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.52■■□□□ 1.2
ZNF638-208ENST00000454278 SMARCA2P51531 1590 aa22.49■■□□□ 1.19
ZNF638-208ENST00000454278 SMARCA4P51532 1647 aa22.47■■□□□ 1.19
ZNF638-208ENST00000454278 NESP48681 1621 aa22.39■■□□□ 1.18
ZNF638-208ENST00000454278 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ZNF638-208ENST00000454278 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.29■■□□□ 1.16
ZNF638-208ENST00000454278 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ZNF638-208ENST00000454278 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ZNF638-208ENST00000454278 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.27■■□□□ 1.16
ZNF638-208ENST00000454278 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.2■■□□□ 1.15
ZNF638-208ENST00000454278 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.06■■□□□ 1.12
ZNF638-208ENST00000454278 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.04■■□□□ 1.12
ZNF638-208ENST00000454278 WDR62O43379 1518 aa21.96■■□□□ 1.11
ZNF638-208ENST00000454278 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.94■■□□□ 1.1
ZNF638-208ENST00000454278 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.89■■□□□ 1.1
ZNF638-208ENST00000454278 TRIM41Q8WV44 630 aa21.85■■□□□ 1.09
ZNF638-208ENST00000454278 WIZO95785 1651 aa21.79■■□□□ 1.08
ZNF638-208ENST00000454278 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.77■■□□□ 1.08
ZNF638-208ENST00000454278 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.68■■□□□ 1.06
ZNF638-208ENST00000454278 CFTRP13569 1480 aa21.62■■□□□ 1.05
ZNF638-208ENST00000454278 PRDM2Q13029 1718 aa21.55■■□□□ 1.04
ZNF638-208ENST00000454278 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ZNF638-208ENST00000454278 OSCARQ8IYS5 282 aa21.53■■□□□ 1.04
ZNF638-208ENST00000454278 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ZNF638-208ENST00000454278 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.47■■□□□ 1.03
ZNF638-208ENST00000454278 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.47■■□□□ 1.03
ZNF638-208ENST00000454278 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.47■■□□□ 1.03
ZNF638-208ENST00000454278 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
ZNF638-208ENST00000454278 ARHGEF11O15085 1522 aa21.34■■□□□ 1.01
ZNF638-208ENST00000454278 IFT140Q96RY7 1462 aa21.34■■□□□ 1.01
ZNF638-208ENST00000454278 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
ZNF638-208ENST00000454278 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
ZNF638-208ENST00000454278 TOPBP1Q92547 1522 aa21.25■□□□□ 0.99
ZNF638-208ENST00000454278 CHD1O14646 1710 aa21.21■□□□□ 0.99
ZNF638-208ENST00000454278 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.19■□□□□ 0.98
ZNF638-208ENST00000454278 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.18■□□□□ 0.98
ZNF638-208ENST00000454278 ABCC8Q09428 1581 aa21.18■□□□□ 0.98
ZNF638-208ENST00000454278 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
ZNF638-208ENST00000454278 ARAP1Q96P48 1450 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF638-208ENST00000454278 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.03■□□□□ 0.96
ZNF638-208ENST00000454278 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.02■□□□□ 0.961e-12■■■■■ 26.8
ZNF638-208ENST00000454278 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
ZNF638-208ENST00000454278 WDR97A6NE52 1622 aa20.97■□□□□ 0.95
ZNF638-208ENST00000454278 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF638-208ENST00000454278 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
ZNF638-208ENST00000454278 SYNJ1O43426 1573 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF638-208ENST00000454278 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF638-208ENST00000454278 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.88■□□□□ 0.93
ZNF638-208ENST00000454278 FBLN2P98095 1184 aa20.86■□□□□ 0.93
ZNF638-208ENST00000454278 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
ZNF638-208ENST00000454278 SOGA1O94964 1423 aa20.83■□□□□ 0.93
ZNF638-208ENST00000454278 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.81■□□□□ 0.92
ZNF638-208ENST00000454278 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
ZNF638-208ENST00000454278 PBRM1Q86U86 1689 aa20.77■□□□□ 0.91
ZNF638-208ENST00000454278 SYNJ2O15056 1496 aa20.75■□□□□ 0.91
ZNF638-208ENST00000454278 GRIN2BQ13224 1484 aa20.75■□□□□ 0.91
ZNF638-208ENST00000454278 CUX1P39880 1505 aa20.74■□□□□ 0.91
ZNF638-208ENST00000454278 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
ZNF638-208ENST00000454278 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.66■□□□□ 0.9
ZNF638-208ENST00000454278 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.66■□□□□ 0.9
ZNF638-208ENST00000454278 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.58■□□□□ 0.89
ZNF638-208ENST00000454278 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ZNF638-208ENST00000454278 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.53■□□□□ 0.88
ZNF638-208ENST00000454278 ADAMTS12P58397 1594 aa20.51■□□□□ 0.87
ZNF638-208ENST00000454278 GRIN2AQ12879 1464 aa20.51■□□□□ 0.87
ZNF638-208ENST00000454278 SHROOM2Q13796 1616 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF638-208ENST00000454278 CEP170Q5SW79 1584 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF638-208ENST00000454278 NUP160Q12769 1436 aa20.45■□□□□ 0.86
ZNF638-208ENST00000454278 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.43■□□□□ 0.86
ZNF638-208ENST00000454278 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF638-208ENST00000454278 TOP2BQ02880 1626 aa20.35■□□□□ 0.85
ZNF638-208ENST00000454278 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
ZNF638-208ENST00000454278 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF638-208ENST00000454278 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.33■□□□□ 0.85
ZNF638-208ENST00000454278 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF638-208ENST00000454278 MAPKBP1O60336 1514 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF638-208ENST00000454278 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms