RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437658.2

ZNF638-206, Transcript of zinc finger protein 638, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF638, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF638-206ENST00000437658 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.47■■■■■ 4.23
ZNF638-206ENST00000437658 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.06■■■■□ 3.52
ZNF638-206ENST00000437658 ABCC9O60706 1549 aa36.82■■■■□ 3.48
ZNF638-206ENST00000437658 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.16■■■■□ 3.22
ZNF638-206ENST00000437658 NACADO15069 1562 aa34.98■■■■□ 3.19
ZNF638-206ENST00000437658 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.88■■■■□ 3.17
ZNF638-206ENST00000437658 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.6■■■■□ 3.13
ZNF638-206ENST00000437658 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.1
ZNF638-206ENST00000437658 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.32■■■■□ 3.08
ZNF638-206ENST00000437658 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.3■■■■□ 3.08
ZNF638-206ENST00000437658 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.27■■■■□ 3.08
ZNF638-206ENST00000437658 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.27■■■■□ 3.08
ZNF638-206ENST00000437658 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.12■■■■□ 3.05
ZNF638-206ENST00000437658 SCRIBQ14160 1630 aa33.81■■■■□ 3
ZNF638-206ENST00000437658 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.69■■■□□ 2.98
ZNF638-206ENST00000437658 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.26■■■□□ 2.92
ZNF638-206ENST00000437658 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.25■■■□□ 2.91
ZNF638-206ENST00000437658 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.13■■■□□ 2.89
ZNF638-206ENST00000437658 NCAPD3P42695 1498 aa32.3■■■□□ 2.76
ZNF638-206ENST00000437658 SMARCA4P51532 1647 aa32.28■■■□□ 2.76
ZNF638-206ENST00000437658 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.25■■■□□ 2.75
ZNF638-206ENST00000437658 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
ZNF638-206ENST00000437658 SMARCA2P51531 1590 aa32.16■■■□□ 2.74
ZNF638-206ENST00000437658 HMGXB3Q12766 1538 aa32.09■■■□□ 2.73
ZNF638-206ENST00000437658 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.97■■■□□ 2.71
ZNF638-206ENST00000437658 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.97■■■□□ 2.71
ZNF638-206ENST00000437658 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
ZNF638-206ENST00000437658 ERCC6Q03468 1493 aa31.76■■■□□ 2.67
ZNF638-206ENST00000437658 NESP48681 1621 aa31.71■■■□□ 2.67
ZNF638-206ENST00000437658 CUX2O14529 1486 aa31.59■■■□□ 2.65
ZNF638-206ENST00000437658 WIZO95785 1651 aa31.57■■■□□ 2.65
ZNF638-206ENST00000437658 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.52■■■□□ 2.64
ZNF638-206ENST00000437658 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
ZNF638-206ENST00000437658 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.33■■■□□ 2.61
ZNF638-206ENST00000437658 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.33■■■□□ 2.61
ZNF638-206ENST00000437658 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
ZNF638-206ENST00000437658 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.27■■■□□ 2.6
ZNF638-206ENST00000437658 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.24■■■□□ 2.59
ZNF638-206ENST00000437658 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
ZNF638-206ENST00000437658 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.06■■■□□ 2.56
ZNF638-206ENST00000437658 CFTRP13569 1480 aa31.04■■■□□ 2.56
ZNF638-206ENST00000437658 CEP164Q9UPV0 1460 aa31■■■□□ 2.55
ZNF638-206ENST00000437658 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.98■■■□□ 2.55
ZNF638-206ENST00000437658 WDR62O43379 1518 aa30.96■■■□□ 2.55
ZNF638-206ENST00000437658 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.86■■■□□ 2.53
ZNF638-206ENST00000437658 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
ZNF638-206ENST00000437658 PRDM2Q13029 1718 aa30.68■■■□□ 2.5
ZNF638-206ENST00000437658 TOPBP1Q92547 1522 aa30.42■■■□□ 2.46
ZNF638-206ENST00000437658 ABCC8Q09428 1581 aa30.37■■■□□ 2.45
ZNF638-206ENST00000437658 IFT140Q96RY7 1462 aa30.36■■■□□ 2.45
ZNF638-206ENST00000437658 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.34■■■□□ 2.45
ZNF638-206ENST00000437658 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
ZNF638-206ENST00000437658 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
ZNF638-206ENST00000437658 OSCARQ8IYS5 282 aa30.2■■■□□ 2.43
ZNF638-206ENST00000437658 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
ZNF638-206ENST00000437658 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
ZNF638-206ENST00000437658 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
ZNF638-206ENST00000437658 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.05■■■□□ 2.41e-12■■■■■ 26.8
ZNF638-206ENST00000437658 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.02■■■□□ 2.4
ZNF638-206ENST00000437658 CUX1P39880 1505 aa30.01■■■□□ 2.4
ZNF638-206ENST00000437658 TRIM41Q8WV44 630 aa30.01■■■□□ 2.39
ZNF638-206ENST00000437658 SOGA1O94964 1423 aa30.01■■■□□ 2.39
ZNF638-206ENST00000437658 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30■■■□□ 2.39
ZNF638-206ENST00000437658 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
ZNF638-206ENST00000437658 WDR97A6NE52 1622 aa29.83■■■□□ 2.37
ZNF638-206ENST00000437658 CHD1O14646 1710 aa29.81■■■□□ 2.36
ZNF638-206ENST00000437658 FBLN2P98095 1184 aa29.8■■■□□ 2.36
ZNF638-206ENST00000437658 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.77■■■□□ 2.36
ZNF638-206ENST00000437658 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.77■■■□□ 2.36
ZNF638-206ENST00000437658 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.77■■■□□ 2.36
ZNF638-206ENST00000437658 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.75■■■□□ 2.35
ZNF638-206ENST00000437658 ARHGEF11O15085 1522 aa29.73■■■□□ 2.35
ZNF638-206ENST00000437658 GRIN2BQ13224 1484 aa29.72■■■□□ 2.35
ZNF638-206ENST00000437658 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
ZNF638-206ENST00000437658 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.66■■■□□ 2.34
ZNF638-206ENST00000437658 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.64■■■□□ 2.34
ZNF638-206ENST00000437658 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.63■■■□□ 2.33
ZNF638-206ENST00000437658 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
ZNF638-206ENST00000437658 TOP2BQ02880 1626 aa29.6■■■□□ 2.33
ZNF638-206ENST00000437658 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.6■■■□□ 2.33
ZNF638-206ENST00000437658 SYNJ1O43426 1573 aa29.59■■■□□ 2.33
ZNF638-206ENST00000437658 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.59■■■□□ 2.33
ZNF638-206ENST00000437658 SYNJ2O15056 1496 aa29.58■■■□□ 2.33
ZNF638-206ENST00000437658 PBRM1Q86U86 1689 aa29.58■■■□□ 2.33
ZNF638-206ENST00000437658 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.51■■■□□ 2.32
ZNF638-206ENST00000437658 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.48■■■□□ 2.31
ZNF638-206ENST00000437658 ARAP1Q96P48 1450 aa29.46■■■□□ 2.31
ZNF638-206ENST00000437658 ADAMTS12P58397 1594 aa29.35■■■□□ 2.29
ZNF638-206ENST00000437658 GRIN2AQ12879 1464 aa29.34■■■□□ 2.29
ZNF638-206ENST00000437658 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.3■■■□□ 2.28
ZNF638-206ENST00000437658 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.28■■■□□ 2.28
ZNF638-206ENST00000437658 NUP160Q12769 1436 aa29.22■■■□□ 2.27
ZNF638-206ENST00000437658 CEP170Q5SW79 1584 aa29.22■■■□□ 2.27
ZNF638-206ENST00000437658 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.09■■■□□ 2.25
ZNF638-206ENST00000437658 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
ZNF638-206ENST00000437658 SHROOM2Q13796 1616 aa29.04■■■□□ 2.24
ZNF638-206ENST00000437658 KIF27Q86VH2 1401 aa29.03■■■□□ 2.24
ZNF638-206ENST00000437658 IGF1RP08069 1367 aa29■■■□□ 2.23
ZNF638-206ENST00000437658 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.94■■■□□ 2.22
ZNF638-206ENST00000437658 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms