Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.332e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.122e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 ERGIC3-210ENST00000451605 520 ntTSL 211.65□□□□□ -0.542e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.828e-10■■■□□ 17
PABPC4Q13310 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.418e-10■■■□□ 17
PABPC4Q13310 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.887e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.637e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 RPL23A-209ENST00000582736 595 ntTSL 1 (best)18.25■□□□□ 0.511e-323■■■□□ 17
PABPC4Q13310 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.043e-11■■■□□ 17
PABPC4Q13310 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.021e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 TSN-204ENST00000467324 2843 ntTSL 514.7□□□□□ -0.061e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.111e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.862e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.171e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 SLC35A4-202ENST00000514199 3617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.661e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.422e-13■■■□□ 17
PABPC4Q13310 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.859e-12■■■□□ 17
PABPC4Q13310 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.092e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 ATF6B-216ENST00000494022 320 ntTSL 215.17■□□□□ 0.025e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.035e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.195e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 RPL37-202ENST00000504562 505 ntTSL 213.48□□□□□ -0.251e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.841e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.391e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.133e-8■■■□□ 17
PABPC4Q13310 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.043e-8■■■□□ 17
PABPC4Q13310 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.385e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.594e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 ATXN2-210ENST00000483311 4159 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.314e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.292e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 HGS-203ENST00000570652 523 ntTSL 523.6■■□□□ 1.379e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 SNHG16-203ENST00000586846 582 ntTSL 421.42■■□□□ 1.021e-25■■■□□ 17
PABPC4Q13310 SNHG16-205ENST00000587743 2665 nt17.35■□□□□ 0.371e-25■■■□□ 17
PABPC4Q13310 SNHG16-208ENST00000591956 556 ntTSL 213.57□□□□□ -0.241e-25■■■□□ 17
PABPC4Q13310 SNHG16-204ENST00000586942 568 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.521e-25■■■□□ 17
PABPC4Q13310 AURKAIP1-206ENST00000496905 608 ntTSL 222.31■■□□□ 1.166e-12■■■□□ 17
PABPC4Q13310 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.273e-6■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.212e-7■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.672e-7■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 PSME2-203ENST00000558273 1502 ntTSL 219.06■□□□□ 0.643e-9■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 PSME2-202ENST00000471700 706 ntTSL 316.67■□□□□ 0.263e-9■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.243e-9■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 PSME2-204ENST00000558931 2754 ntTSL 515.82■□□□□ 0.123e-9■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.023e-9■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.093e-9■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 PSME2-209ENST00000559453 1721 ntTSL 511.09□□□□□ -0.633e-9■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.353e-26■■■□□ 16.9
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PABPC4Q13310 RPS24-206ENST00000465692 778 ntTSL 212.82□□□□□ -0.362e-78■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 TOMM7-206ENST00000496129 520 ntTSL 1 (best)6.37□□□□□ -1.393e-26■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.14e-8■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CSNK2A2-205ENST00000566813 1569 ntTSL 510.85□□□□□ -0.674e-8■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CSNK2A2-206ENST00000567730 947 ntTSL 39.71□□□□□ -0.864e-8■■■□□ 16.9
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PABPC4Q13310 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.184e-24■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 PSMB4-205ENST00000493673 1650 ntTSL 518.97■□□□□ 0.631e-6■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.071e-6■■■□□ 16.9
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PABPC4Q13310 PSMB4-203ENST00000474100 755 ntTSL 58.95□□□□□ -0.981e-6■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.738e-7■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.718e-7■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.198e-7■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.018e-7■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 XBP1-206ENST00000484256 2173 ntTSL 213.37□□□□□ -0.278e-7■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 RPS3-215ENST00000530170 531 ntTSL 510.02□□□□□ -0.812e-37■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 MPDU1-210ENST00000572836 1523 ntTSL 221.59■■□□□ 1.053e-6■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 MPDU1-216ENST00000577088 1645 ntTSL 218.89■□□□□ 0.623e-6■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.423e-6■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 MPDU1-203ENST00000396501 1125 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.053e-6■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 MPDU1-227ENST00000585217 438 ntTSL 314.56□□□□□ -0.083e-6■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 MPDU1-212ENST00000574558 900 ntTSL 311.87□□□□□ -0.513e-6■■■□□ 16.9
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PABPC4Q13310 MPDU1-224ENST00000584378 475 ntTSL 46.08□□□□□ -1.443e-6■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.271e-8■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41e-8■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.031e-8■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.168e-7■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CHCHD3-202ENST00000423635 1310 ntTSL 1 (best)20.81■□□□□ 0.928e-7■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.78e-7■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC15.72■□□□□ 0.118e-7■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CHCHD3-206ENST00000496427 721 ntTSL 58.55□□□□□ -1.048e-7■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CHCHD3-205ENST00000481152 1367 ntTSL 25.87□□□□□ -1.478e-7■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 COX4I1-205ENST00000563774 566 ntTSL 424.11■■□□□ 1.451e-26■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 COX4I1-214ENST00000567266 546 ntTSL 423.88■■□□□ 1.411e-26■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 COX4I1-213ENST00000567241 561 ntTSL 421.89■■□□□ 1.091e-26■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 COX4I1-210ENST00000566115 471 ntTSL 318.07■□□□□ 0.481e-26■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 COX4I1-209ENST00000565078 566 ntTSL 417.18■□□□□ 0.341e-26■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 COX4I1-218ENST00000570123 551 ntTSL 516.28■□□□□ 0.21e-26■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 LAMA5-211ENST00000492698 894 ntTSL 315.88■□□□□ 0.134e-8■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 NDUFB5-206ENST00000473500 689 ntTSL 35.6□□□□□ -1.512e-30■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 VPS25-203ENST00000589520 639 ntTSL 311.5□□□□□ -0.572e-9■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.461e-9■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CNIH4-206ENST00000468318 1525 ntTSL 221.45■■□□□ 1.021e-9■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CNIH4-204ENST00000366860 912 ntTSL 318.16■□□□□ 0.51e-9■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CNIH4-202ENST00000366857 3963 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.761e-9■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CNIH4-205ENST00000465271 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.841e-9■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.41e-9■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.923e-7■■■□□ 16.9
PABPC4Q13310 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.853e-7■■■□□ 16.9
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