RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222329.8

ERF-201, Transcript of ETS2 repressor factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ERF, Length 2,698 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERF-201ENST00000222329 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.78■■■■■ 5.24
ERF-201ENST00000222329 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.97■■■■■ 4.15
ERF-201ENST00000222329 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.55■■■■■ 4.08
ERF-201ENST00000222329 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
ERF-201ENST00000222329 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.25■■■■■ 4.03
ERF-201ENST00000222329 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
ERF-201ENST00000222329 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.98■■■■□ 3.83
ERF-201ENST00000222329 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.59■■■■□ 3.77
ERF-201ENST00000222329 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.36■■■■□ 3.73
ERF-201ENST00000222329 SCRIBQ14160 1630 aa38.31■■■■□ 3.72
ERF-201ENST00000222329 ABCC9O60706 1549 aa38.27■■■■□ 3.72
ERF-201ENST00000222329 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
ERF-201ENST00000222329 NACADO15069 1562 aa37.65■■■■□ 3.62
ERF-201ENST00000222329 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.64■■■■□ 3.62
ERF-201ENST00000222329 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.47■■■■□ 3.59
ERF-201ENST00000222329 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.36■■■■□ 3.57
ERF-201ENST00000222329 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.24■■■■□ 3.55
ERF-201ENST00000222329 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.23■■■■□ 3.55
ERF-201ENST00000222329 TRIM41Q8WV44 630 aa37.17■■■■□ 3.54
ERF-201ENST00000222329 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
ERF-201ENST00000222329 WIZO95785 1651 aa37.04■■■■□ 3.52
ERF-201ENST00000222329 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.96■■■■□ 3.51
ERF-201ENST00000222329 HRCP23327 699 aa36.81■■■■□ 3.48
ERF-201ENST00000222329 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.71■■■■□ 3.472e-13■□□□□ 10.6
ERF-201ENST00000222329 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
ERF-201ENST00000222329 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.65■■■■□ 3.46
ERF-201ENST00000222329 SMARCA4P51532 1647 aa36.44■■■■□ 3.42
ERF-201ENST00000222329 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
ERF-201ENST00000222329 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
ERF-201ENST00000222329 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
ERF-201ENST00000222329 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.28■■■■□ 3.4
ERF-201ENST00000222329 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.22■■■■□ 3.39
ERF-201ENST00000222329 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
ERF-201ENST00000222329 ABCC8Q09428 1581 aa36.18■■■■□ 3.38
ERF-201ENST00000222329 SMARCA2P51531 1590 aa36.14■■■■□ 3.38
ERF-201ENST00000222329 SOGA1O94964 1423 aa35.8■■■■□ 3.32
ERF-201ENST00000222329 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.67■■■■□ 3.3
ERF-201ENST00000222329 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.63■■■■□ 3.3
ERF-201ENST00000222329 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
ERF-201ENST00000222329 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.6■■■■□ 3.29
ERF-201ENST00000222329 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
ERF-201ENST00000222329 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.54■■■■□ 3.28
ERF-201ENST00000222329 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
ERF-201ENST00000222329 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.5■■■■□ 3.271e-7■■■■□ 20.9
ERF-201ENST00000222329 CEP162Q5TB80 1403 aa35.4■■■■□ 3.26
ERF-201ENST00000222329 SYNJ1O43426 1573 aa35.34■■■■□ 3.25
ERF-201ENST00000222329 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
ERF-201ENST00000222329 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.28■■■■□ 3.24
ERF-201ENST00000222329 EEA1Q15075 1411 aa35.25■■■■□ 3.23
ERF-201ENST00000222329 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
ERF-201ENST00000222329 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
ERF-201ENST00000222329 GOLGA3Q08378 1498 aa35.13■■■■□ 3.21
ERF-201ENST00000222329 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
ERF-201ENST00000222329 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.94■■■■□ 3.18
ERF-201ENST00000222329 NCAPD3P42695 1498 aa34.91■■■■□ 3.18
ERF-201ENST00000222329 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.88■■■■□ 3.17
ERF-201ENST00000222329 TOP2BQ02880 1626 aa34.81■■■■□ 3.16
ERF-201ENST00000222329 CLIP1P30622 1438 aa34.81■■■■□ 3.16
ERF-201ENST00000222329 KIF21BO75037 1637 aa34.81■■■■□ 3.16
ERF-201ENST00000222329 HMGXB3Q12766 1538 aa34.79■■■■□ 3.16
ERF-201ENST00000222329 CUX1P39880 1505 aa34.66■■■■□ 3.14
ERF-201ENST00000222329 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.63■■■■□ 3.13
ERF-201ENST00000222329 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
ERF-201ENST00000222329 CFTRP13569 1480 aa34.58■■■■□ 3.13
ERF-201ENST00000222329 APLP2Q06481 763 aa34.57■■■■□ 3.12
ERF-201ENST00000222329 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.54■■■■□ 3.12
ERF-201ENST00000222329 PRXQ9BXM0 1461 aa34.44■■■■□ 3.1
ERF-201ENST00000222329 KIF27Q86VH2 1401 aa34.41■■■■□ 3.1
ERF-201ENST00000222329 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.33■■■■□ 3.09
ERF-201ENST00000222329 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.3■■■■□ 3.08
ERF-201ENST00000222329 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.29■■■■□ 3.08
ERF-201ENST00000222329 ARAP1Q96P48 1450 aa34.25■■■■□ 3.07
ERF-201ENST00000222329 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
ERF-201ENST00000222329 CUX2O14529 1486 aa34.23■■■■□ 3.07
ERF-201ENST00000222329 IGF1RP08069 1367 aa34.13■■■■□ 3.05
ERF-201ENST00000222329 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.11■■■■□ 3.05
ERF-201ENST00000222329 PRDM2Q13029 1718 aa34.11■■■■□ 3.05
ERF-201ENST00000222329 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
ERF-201ENST00000222329 NESP48681 1621 aa34.02■■■■□ 3.04
ERF-201ENST00000222329 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.02■■■■□ 3.04
ERF-201ENST00000222329 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.02■■■■□ 3.04
ERF-201ENST00000222329 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.99■■■■□ 3.03
ERF-201ENST00000222329 P3H3Q8IVL6 736 aa33.94■■■■□ 3.02
ERF-201ENST00000222329 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.92■■■■□ 3.02
ERF-201ENST00000222329 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.91■■■■□ 3.02
ERF-201ENST00000222329 ITGAEP38570 1179 aa33.9■■■■□ 3.02
ERF-201ENST00000222329 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
ERF-201ENST00000222329 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
ERF-201ENST00000222329 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
ERF-201ENST00000222329 TOPBP1Q92547 1522 aa33.73■■■□□ 2.99
ERF-201ENST00000222329 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
ERF-201ENST00000222329 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.68■■■□□ 2.98
ERF-201ENST00000222329 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
ERF-201ENST00000222329 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.64■■■□□ 2.98
ERF-201ENST00000222329 NEUROD1Q13562 356 aa33.64■■■□□ 2.98
ERF-201ENST00000222329 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
ERF-201ENST00000222329 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.59■■■□□ 2.97
ERF-201ENST00000222329 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
ERF-201ENST00000222329 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.55■■■□□ 2.96
ERF-201ENST00000222329 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms