RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492698.1

LAMA5-211, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 3

Gene LAMA5, Length 894 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-211ENST00000492698 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.8■■■□□ 2.84
LAMA5-211ENST00000492698 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.37■■■□□ 2.29
LAMA5-211ENST00000492698 ABCC9O60706 1549 aa29.17■■■□□ 2.26
LAMA5-211ENST00000492698 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.8■■■□□ 2.04
LAMA5-211ENST00000492698 NACADO15069 1562 aa27.64■■■□□ 2.01
LAMA5-211ENST00000492698 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.55■■■□□ 2
LAMA5-211ENST00000492698 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.4■■□□□ 1.98
LAMA5-211ENST00000492698 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.28■■□□□ 1.96
LAMA5-211ENST00000492698 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
LAMA5-211ENST00000492698 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.19■■□□□ 1.94
LAMA5-211ENST00000492698 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.94
LAMA5-211ENST00000492698 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.09■■□□□ 1.93
LAMA5-211ENST00000492698 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.05■■□□□ 1.92
LAMA5-211ENST00000492698 SCRIBQ14160 1630 aa26.84■■□□□ 1.89
LAMA5-211ENST00000492698 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.54■■□□□ 1.84
LAMA5-211ENST00000492698 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.38■■□□□ 1.81
LAMA5-211ENST00000492698 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
LAMA5-211ENST00000492698 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.2■■□□□ 1.78
LAMA5-211ENST00000492698 SMARCA4P51532 1647 aa25.59■■□□□ 1.69
LAMA5-211ENST00000492698 NCAPD3P42695 1498 aa25.5■■□□□ 1.67
LAMA5-211ENST00000492698 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.5■■□□□ 1.67
LAMA5-211ENST00000492698 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
LAMA5-211ENST00000492698 SMARCA2P51531 1590 aa25.41■■□□□ 1.66
LAMA5-211ENST00000492698 HMGXB3Q12766 1538 aa25.37■■□□□ 1.65
LAMA5-211ENST00000492698 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.34■■□□□ 1.65
LAMA5-211ENST00000492698 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.28■■□□□ 1.64
LAMA5-211ENST00000492698 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
LAMA5-211ENST00000492698 NESP48681 1621 aa25.17■■□□□ 1.62
LAMA5-211ENST00000492698 WIZO95785 1651 aa25.1■■□□□ 1.61
LAMA5-211ENST00000492698 ERCC6Q03468 1493 aa25.09■■□□□ 1.61
LAMA5-211ENST00000492698 CUX2O14529 1486 aa24.95■■□□□ 1.58
LAMA5-211ENST00000492698 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.93■■□□□ 1.58
LAMA5-211ENST00000492698 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.91■■□□□ 1.58
LAMA5-211ENST00000492698 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
LAMA5-211ENST00000492698 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
LAMA5-211ENST00000492698 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.72■■□□□ 1.55
LAMA5-211ENST00000492698 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
LAMA5-211ENST00000492698 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.69■■□□□ 1.54
LAMA5-211ENST00000492698 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.67■■□□□ 1.54
LAMA5-211ENST00000492698 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.55■■□□□ 1.52
LAMA5-211ENST00000492698 CFTRP13569 1480 aa24.51■■□□□ 1.51
LAMA5-211ENST00000492698 WDR62O43379 1518 aa24.51■■□□□ 1.51
LAMA5-211ENST00000492698 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.5■■□□□ 1.51
LAMA5-211ENST00000492698 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.49■■□□□ 1.51
LAMA5-211ENST00000492698 PRDM2Q13029 1718 aa24.45■■□□□ 1.5
LAMA5-211ENST00000492698 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.42■■□□□ 1.5
LAMA5-211ENST00000492698 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
LAMA5-211ENST00000492698 TOPBP1Q92547 1522 aa24.09■■□□□ 1.45
LAMA5-211ENST00000492698 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
LAMA5-211ENST00000492698 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.01■■□□□ 1.43
LAMA5-211ENST00000492698 IFT140Q96RY7 1462 aa23.96■■□□□ 1.43
LAMA5-211ENST00000492698 ABCC8Q09428 1581 aa23.92■■□□□ 1.42
LAMA5-211ENST00000492698 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
LAMA5-211ENST00000492698 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
LAMA5-211ENST00000492698 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
LAMA5-211ENST00000492698 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
LAMA5-211ENST00000492698 OSCARQ8IYS5 282 aa23.8■■□□□ 1.4
LAMA5-211ENST00000492698 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.8■■□□□ 1.4
LAMA5-211ENST00000492698 CUX1P39880 1505 aa23.79■■□□□ 1.4
LAMA5-211ENST00000492698 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
LAMA5-211ENST00000492698 CHD1O14646 1710 aa23.76■■□□□ 1.39
LAMA5-211ENST00000492698 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.75■■□□□ 1.39
LAMA5-211ENST00000492698 TRIM41Q8WV44 630 aa23.74■■□□□ 1.39
LAMA5-211ENST00000492698 SOGA1O94964 1423 aa23.69■■□□□ 1.38
LAMA5-211ENST00000492698 WDR97A6NE52 1622 aa23.66■■□□□ 1.38
LAMA5-211ENST00000492698 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
LAMA5-211ENST00000492698 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.65■■□□□ 1.38
LAMA5-211ENST00000492698 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.65■■□□□ 1.38
LAMA5-211ENST00000492698 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.65■■□□□ 1.38
LAMA5-211ENST00000492698 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.56■■□□□ 1.36
LAMA5-211ENST00000492698 PBRM1Q86U86 1689 aa23.54■■□□□ 1.36
LAMA5-211ENST00000492698 ARHGEF11O15085 1522 aa23.54■■□□□ 1.36
LAMA5-211ENST00000492698 FBLN2P98095 1184 aa23.52■■□□□ 1.36
LAMA5-211ENST00000492698 SYNJ1O43426 1573 aa23.48■■□□□ 1.35
LAMA5-211ENST00000492698 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.48■■□□□ 1.35
LAMA5-211ENST00000492698 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.47■■□□□ 1.35
LAMA5-211ENST00000492698 GRIN2BQ13224 1484 aa23.46■■□□□ 1.35
LAMA5-211ENST00000492698 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.44■■□□□ 1.34
LAMA5-211ENST00000492698 TOP2BQ02880 1626 aa23.44■■□□□ 1.34
LAMA5-211ENST00000492698 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
LAMA5-211ENST00000492698 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.43■■□□□ 1.34
LAMA5-211ENST00000492698 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
LAMA5-211ENST00000492698 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.39■■□□□ 1.34
LAMA5-211ENST00000492698 SYNJ2O15056 1496 aa23.36■■□□□ 1.33
LAMA5-211ENST00000492698 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
LAMA5-211ENST00000492698 ARAP1Q96P48 1450 aa23.34■■□□□ 1.33
LAMA5-211ENST00000492698 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.29■■□□□ 1.32
LAMA5-211ENST00000492698 ADAMTS12P58397 1594 aa23.27■■□□□ 1.32
LAMA5-211ENST00000492698 GRIN2AQ12879 1464 aa23.19■■□□□ 1.3
LAMA5-211ENST00000492698 CEP170Q5SW79 1584 aa23.18■■□□□ 1.3
LAMA5-211ENST00000492698 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.14■■□□□ 1.3
LAMA5-211ENST00000492698 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.13■■□□□ 1.29
LAMA5-211ENST00000492698 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.11■■□□□ 1.29
LAMA5-211ENST00000492698 NUP160Q12769 1436 aa23.09■■□□□ 1.29
LAMA5-211ENST00000492698 SHROOM2Q13796 1616 aa23.04■■□□□ 1.28
LAMA5-211ENST00000492698 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.94■■□□□ 1.26
LAMA5-211ENST00000492698 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
LAMA5-211ENST00000492698 KIF27Q86VH2 1401 aa22.9■■□□□ 1.26
LAMA5-211ENST00000492698 IGF1RP08069 1367 aa22.89■■□□□ 1.26
LAMA5-211ENST00000492698 CUL7Q14999 1698 aa22.89■■□□□ 1.25
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