Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.412e-6■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.182e-6■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 GUK1-230ENST00000485838 774 ntTSL 320.28■□□□□ 0.842e-6■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.652e-6■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 GUK1-222ENST00000477206 589 ntTSL 219.11■□□□□ 0.652e-6■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.612e-6■■□□□ 12.2
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PCBP1Q15365 GUK1-232ENST00000486668 738 ntTSL 314.22□□□□□ -0.132e-6■■□□□ 12.2
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PCBP1Q15365 EIF1-201ENST00000310837 1120 ntTSL 1 (best)9.88□□□□□ -0.835e-12■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC8.18□□□□□ -1.15e-12■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.285e-12■■□□□ 12.2
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PCBP1Q15365 PABPC1-223ENST00000523636 818 ntTSL 55.5□□□□□ -1.532e-18■■□□□ 12.2
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PCBP1Q15365 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.459e-27■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.469e-27■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 SEC31A-228ENST00000509142 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.599e-27■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 SEC31A-227ENST00000508502 3801 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.819e-27■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 SEC31A-241ENST00000515749 829 ntTSL 28.16□□□□□ -1.19e-27■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.169e-27■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 SEC31A-213ENST00000503937 1564 ntTSL 1 (best)7.37□□□□□ -1.239e-27■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.489e-27■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 SEC31A-232ENST00000511338 657 ntTSL 55.76□□□□□ -1.499e-27■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.519e-27■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.551e-16■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.629e-27■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.639e-27■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.79e-27■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.789e-27■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.095e-7■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 ATN1-204ENST00000541029 855 ntTSL 222.24■■□□□ 1.151e-8■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 PLXNB1-209ENST00000466353 626 ntTSL 320.73■□□□□ 0.918e-9■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 56.03□□□□□ -1.444e-7■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.712e-11■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CPOX-204ENST00000513674 826 ntTSL 525.67■■□□□ 1.73e-11■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 SNRNP70-204ENST00000595231 1673 ntTSL 1 (best)24.83■■□□□ 1.572e-11■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 PSMD3-202ENST00000415039 1598 ntTSL 223.14■■□□□ 1.293e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.23e-11■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.763e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 PSMD3-204ENST00000540504 458 ntTSL 318.67■□□□□ 0.583e-6■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-11■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 PDAP1-204ENST00000496335 302 ntTSL 316.03■□□□□ 0.163e-11■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 SNRNP70-203ENST00000544278 3221 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.142e-11■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 SMC4-217ENST00000485867 629 ntTSL 37.26□□□□□ -1.256e-13■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 AL355987.4-202ENST00000459985 1900 ntTSL 224.61■■□□□ 1.531e-7■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.881e-7■■□□□ 12.1
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PCBP1Q15365 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.461e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 SHANK3-202ENST00000414786 7394 ntTSL 517.84■□□□□ 0.451e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.221e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.111e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 PRRC2B-209ENST00000489593 797 ntTSL 214.79□□□□□ -0.041e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 DDRGK1-203ENST00000470203 480 ntTSL 312.7□□□□□ -0.381e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 INPPL1-211ENST00000541544 530 ntTSL 225.84■■□□□ 1.733e-10■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 INPPL1-208ENST00000540329 741 ntTSL 317.29■□□□□ 0.363e-10■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 SERPINE1-201ENST00000223095 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.75e-20■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.933e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.693e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.183e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CDKN1C-205ENST00000471157 944 ntTSL 227.39■■□□□ 1.983e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 P4HB-205ENST00000467086 785 ntTSL 526.2■■□□□ 1.782e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 P4HB-206ENST00000471535 579 ntTSL 426.06■■□□□ 1.762e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 FOXJ3-207ENST00000445886 1326 ntTSL 1 (best)25.98■■□□□ 1.753e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 RGL2-244ENST00000485077 1020 ntTSL 224.44■■□□□ 1.59e-9■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 EML2-212ENST00000588000 1542 ntTSL 224.15■■□□□ 1.463e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.453e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.43e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CSNK1D-221ENST00000582844 957 ntTSL 523.65■■□□□ 1.383e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CSNK1D-215ENST00000580784 1081 ntTSL 1 (best)23.65■■□□□ 1.383e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CSNK1D-216ENST00000581108 607 ntTSL 223.65■■□□□ 1.383e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 MARS-226ENST00000551892 748 ntTSL 323.6■■□□□ 1.372e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 EML2-223ENST00000590575 543 ntTSL 323.41■■□□□ 1.343e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.333e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 P4HB-216ENST00000571617 505 ntTSL 323.34■■□□□ 1.332e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 P4HB-219ENST00000574914 571 ntTSL 423.34■■□□□ 1.332e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 P4HB-204ENST00000466567 872 ntTSL 223.34■■□□□ 1.332e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 P4HB-224ENST00000576541 571 ntTSL 523.34■■□□□ 1.332e-7■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.33e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 EML2-218ENST00000588610 1087 ntTSL 1 (best)22.95■■□□□ 1.263e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 PIEZO1-209ENST00000490756 446 ntTSL 322.82■■□□□ 1.243e-6■■□□□ 12.1
PCBP1Q15365 P4HB-222ENST00000576380 943 ntTSL 322.44■■□□□ 1.182e-7■■□□□ 12.1
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