RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590575.5

EML2-223, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 2, human

TSL 3

Gene EML2, Length 543 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML2-223	ENST00000590575	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		52.58	■■■■■ 6.01
EML2-223	ENST00000590575	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		46.93	■■■■■ 5.1
EML2-223	ENST00000590575	ABCC9	O60706	1549 aa		46.54	■■■■■ 5.04
EML2-223	ENST00000590575	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		44.4	■■■■■ 4.7
EML2-223	ENST00000590575	NACAD	O15069	1562 aa		44.22	■■■■■ 4.67
EML2-223	ENST00000590575	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		44.09	■■■■■ 4.65
EML2-223	ENST00000590575	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		43.76	■■■■■ 4.6
EML2-223	ENST00000590575	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	43.71	■■■■■ 4.59
EML2-223	ENST00000590575	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		43.55	■■■■■ 4.56
EML2-223	ENST00000590575	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	43.41	■■■■■ 4.54
EML2-223	ENST00000590575	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		43.4	■■■■■ 4.54
EML2-223	ENST00000590575	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		43.33	■■■■■ 4.53
EML2-223	ENST00000590575	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		43.27	■■■■■ 4.52
EML2-223	ENST00000590575	SCRIB	Q14160	1630 aa		42.89	■■■■■ 4.46
EML2-223	ENST00000590575	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		42.51	■■■■■ 4.4
EML2-223	ENST00000590575	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	42.08	■■■■■ 4.33
EML2-223	ENST00000590575	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		42.06	■■■■■ 4.32
EML2-223	ENST00000590575	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		41.83	■■■■■ 4.29
EML2-223	ENST00000590575	SMARCA4	P51532	1647 aa		40.93	■■■■■ 4.14
EML2-223	ENST00000590575	NCAPD3	P42695	1498 aa		40.86	■■■■■ 4.13
EML2-223	ENST00000590575	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		40.84	■■■■■ 4.13
EML2-223	ENST00000590575	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	40.73	■■■■■ 4.11
EML2-223	ENST00000590575	SMARCA2	P51531	1590 aa		40.67	■■■■■ 4.1
EML2-223	ENST00000590575	HMGXB3	Q12766	1538 aa		40.6	■■■■■ 4.09
EML2-223	ENST00000590575	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		40.6	■■■■■ 4.09
EML2-223	ENST00000590575	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		40.51	■■■■■ 4.08
EML2-223	ENST00000590575	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	40.42	■■■■■ 4.06
EML2-223	ENST00000590575	NES	P48681	1621 aa		40.19	■■■■■ 4.02
EML2-223	ENST00000590575	WIZ	O95785	1651 aa		40.12	■■■■■ 4.01
EML2-223	ENST00000590575	ERCC6	Q03468	1493 aa		40.04	■■■■■ 4
EML2-223	ENST00000590575	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	39.89	■■■■□ 3.98
EML2-223	ENST00000590575	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		39.83	■■■■□ 3.97
EML2-223	ENST00000590575	CUX2	O14529	1486 aa		39.81	■■■■□ 3.96
EML2-223	ENST00000590575	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		39.64	■■■■□ 3.94
EML2-223	ENST00000590575	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	39.64	■■■■□ 3.94
EML2-223	ENST00000590575	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		39.62	■■■■□ 3.93
EML2-223	ENST00000590575	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	39.59	■■■■□ 3.93
EML2-223	ENST00000590575	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		39.52	■■■■□ 3.92
EML2-223	ENST00000590575	CFTR	P13569	1480 aa		39.3	■■■■□ 3.88
EML2-223	ENST00000590575	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		39.27	■■■■□ 3.88
EML2-223	ENST00000590575	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		39.24	■■■■□ 3.87
EML2-223	ENST00000590575	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		39.2	■■■■□ 3.87
EML2-223	ENST00000590575	WDR62	O43379	1518 aa		39.17	■■■■□ 3.86
EML2-223	ENST00000590575	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		39.17	■■■■□ 3.86
EML2-223	ENST00000590575	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		39.16	■■■■□ 3.86
EML2-223	ENST00000590575	PRDM2	Q13029	1718 aa		38.93	■■■■□ 3.82
EML2-223	ENST00000590575	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	38.93	■■■■□ 3.82
EML2-223	ENST00000590575	TOPBP1	Q92547	1522 aa		38.54	■■■■□ 3.76
EML2-223	ENST00000590575	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	38.43	■■■■□ 3.74
EML2-223	ENST00000590575	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		38.41	■■■■□ 3.74
EML2-223	ENST00000590575	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	38.38	■■■■□ 3.74
EML2-223	ENST00000590575	IFT140	Q96RY7	1462 aa		38.35	■■■■□ 3.73
EML2-223	ENST00000590575	ABCC8	Q09428	1581 aa		38.33	■■■■□ 3.73
EML2-223	ENST00000590575	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	38.2	■■■■□ 3.7
EML2-223	ENST00000590575	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	38.19	■■■■□ 3.7
EML2-223	ENST00000590575	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	38.14	■■■■□ 3.7
EML2-223	ENST00000590575	CUX1	P39880	1505 aa		38.1	■■■■□ 3.69
EML2-223	ENST00000590575	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		38.08	■■■■□ 3.69
EML2-223	ENST00000590575	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	38.04	■■■■□ 3.68	2e-14	■■■■■ 59.1
EML2-223	ENST00000590575	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		38.03	■■■■□ 3.68
EML2-223	ENST00000590575	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		38.02	■■■■□ 3.68
EML2-223	ENST00000590575	SOGA1	O94964	1423 aa		37.95	■■■■□ 3.67
EML2-223	ENST00000590575	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	37.88	■■■■□ 3.65
EML2-223	ENST00000590575	CHD1	O14646	1710 aa		37.78	■■■■□ 3.64
EML2-223	ENST00000590575	WDR97	A6NE52	1622 aa		37.76	■■■■□ 3.64
EML2-223	ENST00000590575	TRIM41	Q8WV44	630 aa		37.76	■■■■□ 3.64
EML2-223	ENST00000590575	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		37.66	■■■■□ 3.62
EML2-223	ENST00000590575	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		37.62	■■■■□ 3.61
EML2-223	ENST00000590575	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		37.62	■■■■□ 3.61
EML2-223	ENST00000590575	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		37.62	■■■■□ 3.61
EML2-223	ENST00000590575	SYNJ1	O43426	1573 aa		37.61	■■■■□ 3.61
EML2-223	ENST00000590575	FBLN2	P98095	1184 aa		37.59	■■■■□ 3.61
EML2-223	ENST00000590575	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		37.58	■■■■□ 3.61
EML2-223	ENST00000590575	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		37.58	■■■■□ 3.61
EML2-223	ENST00000590575	GRIN2B	Q13224	1484 aa		37.57	■■■■□ 3.6
EML2-223	ENST00000590575	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	37.56	■■■■□ 3.6
EML2-223	ENST00000590575	TOP2B	Q02880	1626 aa		37.55	■■■■□ 3.6
EML2-223	ENST00000590575	ARHGEF11	O15085	1522 aa		37.54	■■■■□ 3.6
EML2-223	ENST00000590575	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		37.53	■■■■□ 3.6
EML2-223	ENST00000590575	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		37.52	■■■■□ 3.6
EML2-223	ENST00000590575	PBRM1	Q86U86	1689 aa		37.51	■■■■□ 3.6
EML2-223	ENST00000590575	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	37.51	■■■■□ 3.59
EML2-223	ENST00000590575	SYNJ2	O15056	1496 aa		37.39	■■■■□ 3.58
EML2-223	ENST00000590575	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	37.37	■■■■□ 3.57
EML2-223	ENST00000590575	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		37.36	■■■■□ 3.57
EML2-223	ENST00000590575	ARAP1	Q96P48	1450 aa		37.25	■■■■□ 3.55
EML2-223	ENST00000590575	ADAMTS12	P58397	1594 aa		37.2	■■■■□ 3.55
EML2-223	ENST00000590575	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		37.17	■■■■□ 3.54
EML2-223	ENST00000590575	GRIN2A	Q12879	1464 aa		37.12	■■■■□ 3.53
EML2-223	ENST00000590575	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		37.08	■■■■□ 3.53
EML2-223	ENST00000590575	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		37.04	■■■■□ 3.52
EML2-223	ENST00000590575	CEP170	Q5SW79	1584 aa		37.04	■■■■□ 3.52
EML2-223	ENST00000590575	NUP160	Q12769	1436 aa		37	■■■■□ 3.51
EML2-223	ENST00000590575	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		36.91	■■■■□ 3.5
EML2-223	ENST00000590575	SHROOM2	Q13796	1616 aa		36.8	■■■■□ 3.48
EML2-223	ENST00000590575	IGF1R	P08069	1367 aa		36.77	■■■■□ 3.48
EML2-223	ENST00000590575	KIF27	Q86VH2	1401 aa		36.76	■■■■□ 3.47
EML2-223	ENST00000590575	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		36.68	■■■■□ 3.46
EML2-223	ENST00000590575	CUL7	Q14999	1698 aa		36.62	■■■■□ 3.45
EML2-223	ENST00000590575	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	36.57	■■■■□ 3.44

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