Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP4S1Q9Y587 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4S1Q9Y587 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms