RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447221.1

SNHG7-204, Transcript of small nucleolar RNA host gene 7, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG7, Length 2,157 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG7-204ENST00000447221 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.24■■■■■ 6.11
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SNHG7-204ENST00000447221 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.81■■■■■ 4.76
SNHG7-204ENST00000447221 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.31■■■■■ 4.68
SNHG7-204ENST00000447221 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.24■■■■■ 4.67
SNHG7-204ENST00000447221 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.8■■■■■ 4.6
SNHG7-204ENST00000447221 ABCC9O60706 1549 aa43.3■■■■■ 4.52
SNHG7-204ENST00000447221 MYO15BQ96JP2 1530 aa43■■■■■ 4.47
SNHG7-204ENST00000447221 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
SNHG7-204ENST00000447221 NACADO15069 1562 aa42.69■■■■■ 4.42
SNHG7-204ENST00000447221 SCRIBQ14160 1630 aa42.67■■■■■ 4.42
SNHG7-204ENST00000447221 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.23■■■■■ 4.35
SNHG7-204ENST00000447221 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
SNHG7-204ENST00000447221 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.52■■■■■ 4.24
SNHG7-204ENST00000447221 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.51■■■■■ 4.23
SNHG7-204ENST00000447221 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.27■■■■■ 4.2
SNHG7-204ENST00000447221 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.26■■■■■ 4.2
SNHG7-204ENST00000447221 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.1■■■■■ 4.17
SNHG7-204ENST00000447221 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.05■■■■■ 4.16
SNHG7-204ENST00000447221 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.15
SNHG7-204ENST00000447221 WIZO95785 1651 aa40.99■■■■■ 4.15
SNHG7-204ENST00000447221 SMARCA4P51532 1647 aa40.79■■■■■ 4.12
SNHG7-204ENST00000447221 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
SNHG7-204ENST00000447221 TRIM41Q8WV44 630 aa40.16■■■■■ 4.02
SNHG7-204ENST00000447221 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.15■■■■■ 4.02
SNHG7-204ENST00000447221 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.13■■■■■ 4.01
SNHG7-204ENST00000447221 SMARCA2P51531 1590 aa40.12■■■■■ 4.01
SNHG7-204ENST00000447221 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40■■■■□ 3.99
SNHG7-204ENST00000447221 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
SNHG7-204ENST00000447221 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.91■■■■□ 3.98
SNHG7-204ENST00000447221 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.97
SNHG7-204ENST00000447221 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
SNHG7-204ENST00000447221 ABCC8Q09428 1581 aa39.62■■■■□ 3.93
SNHG7-204ENST00000447221 NCAPD3P42695 1498 aa39.47■■■■□ 3.91
SNHG7-204ENST00000447221 HMGXB3Q12766 1538 aa39.4■■■■□ 3.9
SNHG7-204ENST00000447221 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.28■■■■□ 3.88
SNHG7-204ENST00000447221 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.15■■■■□ 3.86
SNHG7-204ENST00000447221 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.06■■■■□ 3.84
SNHG7-204ENST00000447221 SOGA1O94964 1423 aa39.01■■■■□ 3.83
SNHG7-204ENST00000447221 SYNJ1O43426 1573 aa38.99■■■■□ 3.83
SNHG7-204ENST00000447221 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.87■■■■□ 3.81
SNHG7-204ENST00000447221 CFTRP13569 1480 aa38.81■■■■□ 3.8
SNHG7-204ENST00000447221 EEA1Q15075 1411 aa38.74■■■■□ 3.79
SNHG7-204ENST00000447221 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.72■■■■□ 3.79
SNHG7-204ENST00000447221 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.71■■■■□ 3.79
SNHG7-204ENST00000447221 TOP2BQ02880 1626 aa38.67■■■■□ 3.78
SNHG7-204ENST00000447221 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.59■■■■□ 3.77
SNHG7-204ENST00000447221 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.57■■■■□ 3.77
SNHG7-204ENST00000447221 CUX1P39880 1505 aa38.52■■■■□ 3.76
SNHG7-204ENST00000447221 PRDM2Q13029 1718 aa38.51■■■■□ 3.76
SNHG7-204ENST00000447221 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
SNHG7-204ENST00000447221 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.38■■■■□ 3.73
SNHG7-204ENST00000447221 GOLGA3Q08378 1498 aa38.36■■■■□ 3.73
SNHG7-204ENST00000447221 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
SNHG7-204ENST00000447221 CEP162Q5TB80 1403 aa38.3■■■■□ 3.72
SNHG7-204ENST00000447221 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.29■■■■□ 3.72
SNHG7-204ENST00000447221 KIF21BO75037 1637 aa38.25■■■■□ 3.71
SNHG7-204ENST00000447221 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.24■■■■□ 3.71
SNHG7-204ENST00000447221 NESP48681 1621 aa38.23■■■■□ 3.71
SNHG7-204ENST00000447221 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.2■■■■□ 3.71
SNHG7-204ENST00000447221 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.13■■■■□ 3.69
SNHG7-204ENST00000447221 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
SNHG7-204ENST00000447221 KIF27Q86VH2 1401 aa38.07■■■■□ 3.68
SNHG7-204ENST00000447221 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38■■■■□ 3.67
SNHG7-204ENST00000447221 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.99■■■■□ 3.67
SNHG7-204ENST00000447221 PRXQ9BXM0 1461 aa37.95■■■■□ 3.67
SNHG7-204ENST00000447221 HRCP23327 699 aa37.95■■■■□ 3.66
SNHG7-204ENST00000447221 CUX2O14529 1486 aa37.91■■■■□ 3.66
SNHG7-204ENST00000447221 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.87■■■■□ 3.65
SNHG7-204ENST00000447221 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.86■■■■□ 3.65
SNHG7-204ENST00000447221 CLIP1P30622 1438 aa37.85■■■■□ 3.65
SNHG7-204ENST00000447221 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
SNHG7-204ENST00000447221 TOPBP1Q92547 1522 aa37.84■■■■□ 3.65
SNHG7-204ENST00000447221 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.75■■■■□ 3.63
SNHG7-204ENST00000447221 IGF1RP08069 1367 aa37.74■■■■□ 3.63
SNHG7-204ENST00000447221 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.73■■■■□ 3.63
SNHG7-204ENST00000447221 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
SNHG7-204ENST00000447221 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
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SNHG7-204ENST00000447221 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.63■■■■□ 3.62
SNHG7-204ENST00000447221 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.59■■■■□ 3.61
SNHG7-204ENST00000447221 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.56■■■■□ 3.6
SNHG7-204ENST00000447221 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.55■■■■□ 3.6
SNHG7-204ENST00000447221 ARAP1Q96P48 1450 aa37.4■■■■□ 3.58
SNHG7-204ENST00000447221 WDR97A6NE52 1622 aa37.36■■■■□ 3.57
SNHG7-204ENST00000447221 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
SNHG7-204ENST00000447221 APLP2Q06481 763 aa37.31■■■■□ 3.56
SNHG7-204ENST00000447221 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.27■■■■□ 3.56
SNHG7-204ENST00000447221 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.23■■■■□ 3.55
SNHG7-204ENST00000447221 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.21■■■■□ 3.55
SNHG7-204ENST00000447221 CUL7Q14999 1698 aa37.21■■■■□ 3.55
SNHG7-204ENST00000447221 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.2■■■■□ 3.55
SNHG7-204ENST00000447221 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
SNHG7-204ENST00000447221 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
SNHG7-204ENST00000447221 ERCC6Q03468 1493 aa36.99■■■■□ 3.51
SNHG7-204ENST00000447221 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
SNHG7-204ENST00000447221 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
SNHG7-204ENST00000447221 P3H3Q8IVL6 736 aa36.98■■■■□ 3.51
SNHG7-204ENST00000447221 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.98■■■■□ 3.513e-8■■■■■ 34.8
SNHG7-204ENST00000447221 WDR62O43379 1518 aa36.97■■■■□ 3.51
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