Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
AP4S1Q9Y587 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
AP4S1Q9Y587 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
AP4S1Q9Y587 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
AP4S1Q9Y587 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
AP4S1Q9Y587 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
AP4S1Q9Y587 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
AP4S1Q9Y587 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
AP4S1Q9Y587 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
AP4S1Q9Y587 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
AP4S1Q9Y587 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
AP4S1Q9Y587 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
AP4S1Q9Y587 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
AP4S1Q9Y587 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
AP4S1Q9Y587 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
AP4S1Q9Y587 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
AP4S1Q9Y587 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
AP4S1Q9Y587 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
AP4S1Q9Y587 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
AP4S1Q9Y587 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
AP4S1Q9Y587 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AP4S1Q9Y587 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AP4S1Q9Y587 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AP4S1Q9Y587 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AP4S1Q9Y587 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
AP4S1Q9Y587 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AP4S1Q9Y587 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AP4S1Q9Y587 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AP4S1Q9Y587 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AP4S1Q9Y587 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
AP4S1Q9Y587 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AP4S1Q9Y587 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AP4S1Q9Y587 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AP4S1Q9Y587 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AP4S1Q9Y587 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AP4S1Q9Y587 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AP4S1Q9Y587 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AP4S1Q9Y587 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AP4S1Q9Y587 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AP4S1Q9Y587 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AP4S1Q9Y587 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AP4S1Q9Y587 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AP4S1Q9Y587 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP4S1Q9Y587 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AP4S1Q9Y587 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AP4S1Q9Y587 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AP4S1Q9Y587 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AP4S1Q9Y587 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AP4S1Q9Y587 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AP4S1Q9Y587 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AP4S1Q9Y587 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AP4S1Q9Y587 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AP4S1Q9Y587 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP4S1Q9Y587 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AP4S1Q9Y587 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AP4S1Q9Y587 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AP4S1Q9Y587 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AP4S1Q9Y587 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AP4S1Q9Y587 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AP4S1Q9Y587 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AP4S1Q9Y587 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AP4S1Q9Y587 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AP4S1Q9Y587 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AP4S1Q9Y587 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AP4S1Q9Y587 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AP4S1Q9Y587 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AP4S1Q9Y587 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AP4S1Q9Y587 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AP4S1Q9Y587 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AP4S1Q9Y587 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AP4S1Q9Y587 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AP4S1Q9Y587 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AP4S1Q9Y587 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AP4S1Q9Y587 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AP4S1Q9Y587 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AP4S1Q9Y587 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AP4S1Q9Y587 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AP4S1Q9Y587 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AP4S1Q9Y587 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP4S1Q9Y587 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AP4S1Q9Y587 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AP4S1Q9Y587 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AP4S1Q9Y587 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AP4S1Q9Y587 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP4S1Q9Y587 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AP4S1Q9Y587 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
AP4S1Q9Y587 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AP4S1Q9Y587 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AP4S1Q9Y587 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AP4S1Q9Y587 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
AP4S1Q9Y587 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AP4S1Q9Y587 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AP4S1Q9Y587 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AP4S1Q9Y587 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP4S1Q9Y587 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP4S1Q9Y587 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP4S1Q9Y587 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP4S1Q9Y587 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP4S1Q9Y587 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AP4S1Q9Y587 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms