RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368100.1

VSIG8-201, Transcript of V-set and immunoglobulin domain containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VSIG8, Length 1,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8-201ENST00000368100 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.48■■■■■ 6.63
VSIG8-201ENST00000368100 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.19■■■■■ 5.46
VSIG8-201ENST00000368100 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.43■■■■■ 5.18
VSIG8-201ENST00000368100 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.75■■■■■ 5.07
VSIG8-201ENST00000368100 ABCC9O60706 1549 aa46.72■■■■■ 5.07
VSIG8-201ENST00000368100 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.65■■■■■ 5.06
VSIG8-201ENST00000368100 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.12■■■■■ 4.97
VSIG8-201ENST00000368100 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.11■■■■■ 4.97
VSIG8-201ENST00000368100 NACADO15069 1562 aa45.87■■■■■ 4.93
VSIG8-201ENST00000368100 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.49■■■■■ 4.87
VSIG8-201ENST00000368100 SCRIBQ14160 1630 aa45.33■■■■■ 4.85
VSIG8-201ENST00000368100 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.59■■■■■ 4.73
VSIG8-201ENST00000368100 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.33■■■■■ 4.69
VSIG8-201ENST00000368100 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.2■■■■■ 4.67
VSIG8-201ENST00000368100 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.1■■■■■ 4.65
VSIG8-201ENST00000368100 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.96■■■■■ 4.63
VSIG8-201ENST00000368100 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
VSIG8-201ENST00000368100 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.68■■■■■ 4.58
VSIG8-201ENST00000368100 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
VSIG8-201ENST00000368100 SMARCA4P51532 1647 aa43.42■■■■■ 4.54
VSIG8-201ENST00000368100 WIZO95785 1651 aa43.29■■■■■ 4.52
VSIG8-201ENST00000368100 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.87■■■■■ 4.45
VSIG8-201ENST00000368100 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.85■■■■■ 4.45
VSIG8-201ENST00000368100 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
VSIG8-201ENST00000368100 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.76■■■■■ 4.44
VSIG8-201ENST00000368100 SMARCA2P51531 1590 aa42.67■■■■■ 4.42
VSIG8-201ENST00000368100 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
VSIG8-201ENST00000368100 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.42■■■■■ 4.38
VSIG8-201ENST00000368100 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.39■■■■■ 4.38
VSIG8-201ENST00000368100 NCAPD3P42695 1498 aa42.38■■■■■ 4.38
VSIG8-201ENST00000368100 HMGXB3Q12766 1538 aa42.28■■■■■ 4.36
VSIG8-201ENST00000368100 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.24■■■■■ 4.35
VSIG8-201ENST00000368100 TRIM41Q8WV44 630 aa41.64■■■■■ 4.26
VSIG8-201ENST00000368100 ABCC8Q09428 1581 aa41.52■■■■■ 4.24
VSIG8-201ENST00000368100 CFTRP13569 1480 aa41.43■■■■■ 4.22
VSIG8-201ENST00000368100 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.37■■■■■ 4.21
VSIG8-201ENST00000368100 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.31■■■■■ 4.2
VSIG8-201ENST00000368100 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.23■■■■■ 4.19
VSIG8-201ENST00000368100 PRDM2Q13029 1718 aa41.1■■■■■ 4.17
VSIG8-201ENST00000368100 SYNJ1O43426 1573 aa41.08■■■■■ 4.17
VSIG8-201ENST00000368100 NESP48681 1621 aa41.02■■■■■ 4.16
VSIG8-201ENST00000368100 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
VSIG8-201ENST00000368100 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.91■■■■■ 4.14
VSIG8-201ENST00000368100 TOP2BQ02880 1626 aa40.88■■■■■ 4.13
VSIG8-201ENST00000368100 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.85■■■■■ 4.13
VSIG8-201ENST00000368100 CUX1P39880 1505 aa40.83■■■■■ 4.13
VSIG8-201ENST00000368100 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.82■■■■■ 4.12
VSIG8-201ENST00000368100 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.81■■■■■ 4.12
VSIG8-201ENST00000368100 SOGA1O94964 1423 aa40.75■■■■■ 4.11
VSIG8-201ENST00000368100 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.62■■■■■ 4.09
VSIG8-201ENST00000368100 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.61■■■■■ 4.09
VSIG8-201ENST00000368100 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.58■■■■■ 4.09
VSIG8-201ENST00000368100 EEA1Q15075 1411 aa40.53■■■■■ 4.08
VSIG8-201ENST00000368100 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.44■■■■■ 4.06
VSIG8-201ENST00000368100 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.43■■■■■ 4.06
VSIG8-201ENST00000368100 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.41■■■■■ 4.06
VSIG8-201ENST00000368100 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.41■■■■■ 4.06
VSIG8-201ENST00000368100 TOPBP1Q92547 1522 aa40.4■■■■■ 4.06
VSIG8-201ENST00000368100 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.38■■■■■ 4.06
VSIG8-201ENST00000368100 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
VSIG8-201ENST00000368100 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
VSIG8-201ENST00000368100 KIF27Q86VH2 1401 aa40.17■■■■■ 4.02
VSIG8-201ENST00000368100 CUX2O14529 1486 aa40.12■■■■■ 4.01
VSIG8-201ENST00000368100 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.11■■■■■ 4.01
VSIG8-201ENST00000368100 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.11■■■■■ 4.01
VSIG8-201ENST00000368100 KIF21BO75037 1637 aa40.03■■■■■ 4
VSIG8-201ENST00000368100 ERCC6Q03468 1493 aa40.02■■■■■ 4
VSIG8-201ENST00000368100 GOLGA3Q08378 1498 aa40.01■■■■■ 4
VSIG8-201ENST00000368100 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.01■■■■□ 3.99
VSIG8-201ENST00000368100 PRXQ9BXM0 1461 aa39.91■■■■□ 3.98
VSIG8-201ENST00000368100 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.91■■■■□ 3.98
VSIG8-201ENST00000368100 WDR62O43379 1518 aa39.9■■■■□ 3.98
VSIG8-201ENST00000368100 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.89■■■■□ 3.98
VSIG8-201ENST00000368100 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.98
VSIG8-201ENST00000368100 IGF1RP08069 1367 aa39.88■■■■□ 3.97
VSIG8-201ENST00000368100 WDR97A6NE52 1622 aa39.85■■■■□ 3.97
VSIG8-201ENST00000368100 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
VSIG8-201ENST00000368100 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
VSIG8-201ENST00000368100 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.78■■■■□ 3.96
VSIG8-201ENST00000368100 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
VSIG8-201ENST00000368100 CEP162Q5TB80 1403 aa39.69■■■■□ 3.94
VSIG8-201ENST00000368100 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.68■■■■□ 3.94
VSIG8-201ENST00000368100 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.66■■■■□ 3.94
VSIG8-201ENST00000368100 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.62■■■■□ 3.93
VSIG8-201ENST00000368100 IFT140Q96RY7 1462 aa39.61■■■■□ 3.93
VSIG8-201ENST00000368100 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.49■■■■□ 3.91
VSIG8-201ENST00000368100 CUL7Q14999 1698 aa39.48■■■■□ 3.91
VSIG8-201ENST00000368100 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.47■■■■□ 3.91
VSIG8-201ENST00000368100 CLIP1P30622 1438 aa39.4■■■■□ 3.9
VSIG8-201ENST00000368100 PBRM1Q86U86 1689 aa39.35■■■■□ 3.89
VSIG8-201ENST00000368100 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
VSIG8-201ENST00000368100 GRIN2BQ13224 1484 aa39.31■■■■□ 3.88
VSIG8-201ENST00000368100 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
VSIG8-201ENST00000368100 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.19■■■■□ 3.86
VSIG8-201ENST00000368100 ADAMTS12P58397 1594 aa39.16■■■■□ 3.86
VSIG8-201ENST00000368100 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.08■■■■□ 3.85
VSIG8-201ENST00000368100 ARAP1Q96P48 1450 aa39.04■■■■□ 3.84
VSIG8-201ENST00000368100 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.04■■■■□ 3.84
VSIG8-201ENST00000368100 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.02■■■■□ 3.84
VSIG8-201ENST00000368100 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.02■■■■□ 3.84
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