RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397620.6

MEIS2-204, Transcript of Meis homeobox 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MEIS2, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS2-204ENST00000397620 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.95■■■■■ 5.91
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MEIS2-204ENST00000397620 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.48■■■■■ 4.55
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MEIS2-204ENST00000397620 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.74■■■■■ 4.43
MEIS2-204ENST00000397620 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
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MEIS2-204ENST00000397620 SCRIBQ14160 1630 aa41.55■■■■■ 4.24
MEIS2-204ENST00000397620 NACADO15069 1562 aa41.38■■■■■ 4.21
MEIS2-204ENST00000397620 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.87■■■■■ 4.13
MEIS2-204ENST00000397620 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.83■■■■■ 4.13
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MEIS2-204ENST00000397620 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.31■■■■■ 4.04
MEIS2-204ENST00000397620 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.31■■■■■ 4.04
MEIS2-204ENST00000397620 WIZO95785 1651 aa40.09■■■■■ 4.01
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MEIS2-204ENST00000397620 SMARCA4P51532 1647 aa39.76■■■■□ 3.95
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MEIS2-204ENST00000397620 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.53■■■■□ 3.92
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MEIS2-204ENST00000397620 TRIM41Q8WV44 630 aa39.49■■■■□ 3.91
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MEIS2-204ENST00000397620 SMARCA2P51531 1590 aa39.24■■■■□ 3.87
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MEIS2-204ENST00000397620 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.09■■■■□ 3.85
MEIS2-204ENST00000397620 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.04■■■■□ 3.84
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MEIS2-204ENST00000397620 SOGA1O94964 1423 aa38.31■■■■□ 3.72
MEIS2-204ENST00000397620 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.3■■■■□ 3.72
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MEIS2-204ENST00000397620 HMGXB3Q12766 1538 aa38.24■■■■□ 3.71
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MEIS2-204ENST00000397620 SYNJ1O43426 1573 aa38.21■■■■□ 3.71
MEIS2-204ENST00000397620 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.17■■■■□ 3.7
MEIS2-204ENST00000397620 EEA1Q15075 1411 aa38.09■■■■□ 3.69
MEIS2-204ENST00000397620 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.99■■■■□ 3.67
MEIS2-204ENST00000397620 TOP2BQ02880 1626 aa37.84■■■■□ 3.65
MEIS2-204ENST00000397620 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.83■■■■□ 3.65
MEIS2-204ENST00000397620 CEP162Q5TB80 1403 aa37.82■■■■□ 3.64
MEIS2-204ENST00000397620 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.78■■■■□ 3.64
MEIS2-204ENST00000397620 GOLGA3Q08378 1498 aa37.77■■■■□ 3.64
MEIS2-204ENST00000397620 CFTRP13569 1480 aa37.72■■■■□ 3.63
MEIS2-204ENST00000397620 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
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MEIS2-204ENST00000397620 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.67■■■■□ 3.62
MEIS2-204ENST00000397620 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.64■■■■□ 3.62
MEIS2-204ENST00000397620 CUX1P39880 1505 aa37.6■■■■□ 3.61
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MEIS2-204ENST00000397620 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.38■■■■□ 3.57
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MEIS2-204ENST00000397620 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.19■■■■□ 3.54
MEIS2-204ENST00000397620 KIF27Q86VH2 1401 aa37.18■■■■□ 3.54
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MEIS2-204ENST00000397620 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
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MEIS2-204ENST00000397620 NESP48681 1621 aa36.97■■■■□ 3.51
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MEIS2-204ENST00000397620 ARAP1Q96P48 1450 aa36.82■■■■□ 3.48
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MEIS2-204ENST00000397620 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.19■■■■□ 3.38
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MEIS2-204ENST00000397620 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
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