Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCW9

PROKR1, Prokineticin receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROKR1Q8TCW9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PROKR1Q8TCW9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PROKR1Q8TCW9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PROKR1Q8TCW9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROKR1Q8TCW9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROKR1Q8TCW9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROKR1Q8TCW9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROKR1Q8TCW9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROKR1Q8TCW9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms