Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMN1Q16637 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMN1Q16637 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMN1Q16637 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMN1Q16637 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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