Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMN1Q16637 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMN1Q16637 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMN1Q16637 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMN1Q16637 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMN1Q16637 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMN1Q16637 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMN1Q16637 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMN1Q16637 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SMN1Q16637 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMN1Q16637 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMN1Q16637 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMN1Q16637 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMN1Q16637 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMN1Q16637 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMN1Q16637 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMN1Q16637 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMN1Q16637 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMN1Q16637 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMN1Q16637 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMN1Q16637 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMN1Q16637 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMN1Q16637 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMN1Q16637 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMN1Q16637 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMN1Q16637 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMN1Q16637 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMN1Q16637 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMN1Q16637 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMN1Q16637 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMN1Q16637 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMN1Q16637 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMN1Q16637 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMN1Q16637 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMN1Q16637 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMN1Q16637 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMN1Q16637 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMN1Q16637 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMN1Q16637 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMN1Q16637 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMN1Q16637 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMN1Q16637 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMN1Q16637 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMN1Q16637 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SMN1Q16637 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMN1Q16637 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMN1Q16637 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMN1Q16637 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMN1Q16637 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMN1Q16637 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMN1Q16637 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMN1Q16637 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMN1Q16637 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMN1Q16637 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMN1Q16637 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMN1Q16637 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMN1Q16637 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMN1Q16637 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMN1Q16637 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMN1Q16637 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMN1Q16637 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMN1Q16637 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMN1Q16637 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMN1Q16637 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMN1Q16637 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMN1Q16637 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMN1Q16637 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMN1Q16637 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMN1Q16637 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMN1Q16637 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMN1Q16637 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMN1Q16637 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMN1Q16637 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMN1Q16637 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMN1Q16637 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMN1Q16637 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMN1Q16637 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMN1Q16637 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMN1Q16637 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMN1Q16637 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMN1Q16637 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMN1Q16637 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMN1Q16637 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMN1Q16637 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMN1Q16637 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMN1Q16637 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMN1Q16637 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMN1Q16637 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMN1Q16637 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMN1Q16637 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMN1Q16637 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMN1Q16637 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMN1Q16637 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMN1Q16637 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMN1Q16637 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMN1Q16637 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMN1Q16637 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMN1Q16637 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMN1Q16637 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMN1Q16637 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
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