Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 ARMC1-206ENST00000528721 887 ntTSL 217.83■□□□□ 0.448e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.438e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 SPCS2-208ENST00000532972 839 ntTSL 217.53■□□□□ 0.41e-11■■■■■ 45.5
RPS3P23396 TUBA1A-206ENST00000550254 696 ntTSL 217.47■□□□□ 0.398e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.348e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 PTK2B-215ENST00000522245 762 ntTSL 216.91■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ARMC1-203ENST00000518908 1050 ntTSL 316.85■□□□□ 0.298e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.298e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.278e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.261e-11■■■■■ 45.5
RPS3P23396 JPT2-211ENST00000567717 857 ntTSL 316.58■□□□□ 0.248e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 SPCS2-204ENST00000527225 321 ntTSL 516.56■□□□□ 0.241e-11■■■■■ 45.5
RPS3P23396 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.181e-11■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.178e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 METTL13-207ENST00000485629 759 ntTSL 515.91■□□□□ 0.148e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ELP5-205ENST00000570322 1083 ntTSL 315.87■□□□□ 0.138e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.121e-11■■■■■ 45.5
RPS3P23396 RPUSD3-209ENST00000451405 817 ntTSL 515.78■□□□□ 0.128e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ISYNA1-208ENST00000581800 627 ntTSL 415.23■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 RPUSD3-217ENST00000485705 630 ntTSL 315.21■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 GPN3-206ENST00000549963 497 ntTSL 314.65□□□□□ -0.068e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.18e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 POLDIP3-206ENST00000454057 579 ntTSL 414.42□□□□□ -0.18e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.128e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 SPCS2-205ENST00000527290 265 ntTSL 214.27□□□□□ -0.131e-11■■■■■ 45.5
RPS3P23396 RPUSD3-208ENST00000433972 1178 ntTSL 214.25□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 COA7-202ENST00000486918 908 ntTSL 314.23□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.178e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ELP5-209ENST00000573513 827 ntTSL 513.94□□□□□ -0.188e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ELP5-206ENST00000570500 473 ntTSL 213.94□□□□□ -0.188e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.198e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.28e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.218e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 PTK2B-207ENST00000482543 499 ntTSL 513.33□□□□□ -0.288e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 TUBA1A-209ENST00000552924 628 ntTSL 213.14□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.338e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.338e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ELP5-207ENST00000571146 890 ntTSL 312.97□□□□□ -0.338e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.428e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-11■■■■■ 45.5
RPS3P23396 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.468e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.498e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.528e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.528e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ACO2-203ENST00000466237 747 ntTSL 311.76□□□□□ -0.538e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 TUBA1A-207ENST00000550767 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.538e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 S100A1-204ENST00000436839 236 ntTSL 311.71□□□□□ -0.533e-10■■■■■ 45.5
RPS3P23396 POLDIP3-207ENST00000463133 563 ntTSL 411.39□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 C1orf186-201ENST00000331555 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.68e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ARMC1-201ENST00000276569 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.638e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 PTK2B-203ENST00000397501 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 POLDIP3-201ENST00000252115 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.688e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 POLDIP3-205ENST00000451060 3491 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.78e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 POLDIP3-203ENST00000348657 3323 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 TNFRSF10A-202ENST00000519862 342 ntTSL 310.51□□□□□ -0.738e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 C1orf186-203ENST00000582070 1145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.788e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 POLDIP3-208ENST00000491021 1028 ntTSL 510.17□□□□□ -0.788e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 TUBA1A-204ENST00000547939 946 ntTSL 310.13□□□□□ -0.798e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 GPN3-208ENST00000550974 564 ntTSL 510.1□□□□□ -0.798e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 PTK2B-210ENST00000517339 3914 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.838e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 COA7-201ENST00000371538 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.878e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 TUBA1A-208ENST00000550811 650 ntTSL 49.39□□□□□ -0.918e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 LINC01847-203ENST00000641163 1490 ntBASIC9.26□□□□□ -0.938e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 POLDIP3-204ENST00000445215 3337 ntTSL 1 (best)9.21□□□□□ -0.938e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 PTK2B-201ENST00000346049 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.988e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 PTK2B-205ENST00000420218 3941 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.988e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 SH3BGRL-204ENST00000481106 928 ntTSL 1 (best)8.87□□□□□ -0.998e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 SH3BGRL-202ENST00000463546 755 ntTSL 28.8□□□□□ -18e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 C1orf186-209ENST00000603488 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -18e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 TUBA1A-202ENST00000301071 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.018e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 C1orf186-208ENST00000603378 614 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.038e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 TUBA1A-205ENST00000548363 673 ntTSL 28.18□□□□□ -1.18e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.288e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 SRP68-209ENST00000590833 582 ntTSL 26.78□□□□□ -1.328e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 SPCS2-206ENST00000528265 577 ntTSL 56.77□□□□□ -1.331e-11■■■■■ 45.5
RPS3P23396 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.498e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 MRPL15-203ENST00000522521 853 ntTSL 55.54□□□□□ -1.528e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.628e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 ACTL6A-211ENST00000487978 916 ntTSL 54.84□□□□□ -1.638e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 JPT2-212ENST00000568376 297 ntTSL 34.68□□□□□ -1.668e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.688e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.718e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 LAMTOR3-203ENST00000515100 961 ntTSL 1 (best)3.34□□□□□ -1.878e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 TTK-205ENST00000504040 569 ntTSL 21.5□□□□□ -2.178e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 SH3BGRL-203ENST00000474113 739 ntTSL 31.33□□□□□ -2.28e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 SPCS2-203ENST00000526883 498 ntTSL 21.32□□□□□ -2.28e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 TTK-203ENST00000430061 580 ntTSL 41.08□□□□□ -2.248e-7■■■■■ 45.5
RPS3P23396 CLIC2-203ENST00000465553 902 ntTSL 34.9□□□□□ -1.635e-7■■■■■ 45.4
RPS3P23396 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.835e-7■■■■■ 45.4
RPS3P23396 BET1-201ENST00000222547 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.334e-8■■■■■ 45.4
RPS3P23396 BET1-204ENST00000425626 601 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.664e-8■■■■■ 45.4
RPS3P23396 BET1-205ENST00000433727 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.674e-8■■■■■ 45.4
RPS3P23396 BET1-202ENST00000357520 3586 ntTSL 1 (best)6.71□□□□□ -1.344e-8■■■■■ 45.4
RPS3P23396 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.291e-8■■■■■ 45.2
RPS3P23396 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 45.2
RPS3P23396 UBE2O-202ENST00000586409 3579 ntTSL 215.47■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 45.2
RPS3P23396 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.61e-8■■■■■ 45.2
RPS3P23396 F7-202ENST00000375581 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.671e-8■■■■■ 45.2
RPS3P23396 UBE2O-204ENST00000587127 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.46□□□□□ -0.731e-8■■■■■ 45.2
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