RNA–Protein interactions for RNA: YDR063W

AIM7, Transcript of Protein that interacts with Arp2/3 complex, yeast

Gene AIM7, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM7	YDR063W	PSF3	Q12146	194 aa		5.01	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	APC11	Q12157	165 aa		5.01	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	PDR18	P53756	1333 aa		5	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	RRN6	P32786	894 aa		5	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	SMC1	P32908	1225 aa		5	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	YHL050C	P38721	697 aa		5	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	RAD55	P38953	406 aa		5	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	GCV1	P48015	400 aa		5	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	NCS6	P53088	359 aa		5	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	HDA2	Q06629	674 aa		5	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	PIF1	P07271	859 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	TAF1	P46677	1066 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	PIP2	P52960	996 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	MRPS35	P53292	345 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	KAR5	Q04746	504 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	SGD1	Q06132	899 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	NCB2	Q92317	146 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	LAM4	P38800	1345 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	THI80	P35202	319 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	PSY2	P40164	858 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	MLC1	P53141	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	LAP2	Q10740	671 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	COQ1	P18900	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	PBY1	P38254	753 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	PCL8	Q08966	492 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AIM7	YDR063W	CYB2	P00175	591 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	ACE2	P21192	770 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	PUP1	P25043	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	CHS3	P29465	1165 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	ERG7	P38604	731 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	IRC8	P47046	822 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	HDA1	P53973	706 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	YIG1	Q08956	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	KTR2	P33550	425 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	OCT1	P35999	772 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	NKP2	Q06162	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	PRE8	P23639	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	CST26	P38226	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	VID27	P40157	782 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	ULP1	Q02724	621 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	YML037C	Q03703	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	SUE1	Q06524	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	UBX5	Q06682	500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	TRE1	Q08919	783 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	CDC16	P09798	840 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	SRM1	P21827	482 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	MCD4	P36051	919 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	FLR1	P38124	548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	NDT80	P38830	627 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	NET1	P47035	1189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	ALT1	P52893	592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	PNP1	Q05788	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	PSF2	P40359	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	LYS14	P40971	790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	IOC3	P43596	787 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	CTR1	P49573	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	SCS3	P53012	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	DUS4	Q06063	367 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	TAH18	Q12181	623 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	RAD61	Q99359	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	PAH1	P32567	862 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	SHP1	P34223	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	RTS1	P38903	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	AFG3	P39925	761 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	ATG1	P53104	897 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	RIM8	P53179	542 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIM7	YDR063W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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