Protein–RNA interactions for Protein: P32786

RRN6, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN6, yeastyeast

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN6P32786 NSR1YGR159C 1245 nt21.59■■□□□ 1.05
RRN6P32786 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.58■■□□□ 1.05
RRN6P32786 NOP1YDL014W 984 nt20.92■□□□□ 0.94
RRN6P32786 MDJ1YFL016C 1536 nt19.29■□□□□ 0.68
RRN6P32786 YKL036CYKL036C 393 nt19.21■□□□□ 0.67
RRN6P32786 Q0297Q0297 156 nt18.33■□□□□ 0.52
RRN6P32786 SRX1YKL086W 384 nt18.32■□□□□ 0.52
RRN6P32786 YJL027CYJL027C 417 nt17.89■□□□□ 0.45
RRN6P32786 SCS3YGL126W 1143 nt17.45■□□□□ 0.38
RRN6P32786 YCR051WYCR051W 669 nt17.32■□□□□ 0.36
RRN6P32786 DBP2YNL112W 1641 nt17.09■□□□□ 0.33
RRN6P32786 YOL085CYOL085C 342 nt16.68■□□□□ 0.26
RRN6P32786 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.66■□□□□ 0.26
RRN6P32786 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.66■□□□□ 0.26
RRN6P32786 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.66■□□□□ 0.26
RRN6P32786 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.66■□□□□ 0.26
RRN6P32786 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.66■□□□□ 0.26
RRN6P32786 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.66■□□□□ 0.26
RRN6P32786 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.66■□□□□ 0.26
RRN6P32786 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.66■□□□□ 0.26
RRN6P32786 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.66■□□□□ 0.26
RRN6P32786 Q0182Q0182 405 nt16.62■□□□□ 0.25
RRN6P32786 YBR190WYBR190W 312 nt16.48■□□□□ 0.23
RRN6P32786 RPP1BYDL130W 321 nt16.43■□□□□ 0.22
RRN6P32786 CCC1YLR220W 969 nt16.42■□□□□ 0.22
RRN6P32786 PKP1YIL042C 1185 nt16.4■□□□□ 0.22
RRN6P32786 MOT3YMR070W 1473 nt16.13■□□□□ 0.17
RRN6P32786 RTC3YHR087W 336 nt16.04■□□□□ 0.16
RRN6P32786 RVS167YDR388W 1449 nt15.91■□□□□ 0.14
RRN6P32786 SCJ1YMR214W 1134 nt15.9■□□□□ 0.14
RRN6P32786 PET122YER153C 765 nt15.72■□□□□ 0.11
RRN6P32786 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.71■□□□□ 0.11
RRN6P32786 ATS1YAL020C 1002 nt15.57■□□□□ 0.08
RRN6P32786 SCR1SCR1 522 nt15.46■□□□□ 0.07
RRN6P32786 SHR5YOL110W 714 nt15.38■□□□□ 0.05
RRN6P32786 RRN5YLR141W 1092 nt15.25■□□□□ 0.03
RRN6P32786 YDJ1YNL064C 1230 nt15.19■□□□□ 0.02
RRN6P32786 PUT4YOR348C 1884 nt15.11■□□□□ 0.01
RRN6P32786 URN1YPR152C 1398 nt15.01□□□□□ -0.01
RRN6P32786 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.96□□□□□ -0.01
RRN6P32786 DEP1YAL013W 1218 nt14.96□□□□□ -0.01
RRN6P32786 RSB1YOR049C 1065 nt14.86□□□□□ -0.03
RRN6P32786 GAR1YHR089C 618 nt14.85□□□□□ -0.03
RRN6P32786 OPI9YLR338W 858 nt14.85□□□□□ -0.03
RRN6P32786 ARE1YCR048W 1833 nt14.8□□□□□ -0.04
RRN6P32786 SAH1YER043C 1350 nt14.78□□□□□ -0.04
RRN6P32786 RPN10YHR200W 807 nt14.72□□□□□ -0.05
RRN6P32786 YNL208WYNL208W 600 nt14.72□□□□□ -0.05
RRN6P32786 POA1YBR022W 534 nt14.58□□□□□ -0.08
RRN6P32786 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.55□□□□□ -0.08
RRN6P32786 PST2YDR032C 597 nt14.47□□□□□ -0.09
RRN6P32786 PUN1YLR414C 792 nt14.39□□□□□ -0.11
RRN6P32786 SSA3YBL075C 1950 nt14.37□□□□□ -0.11
RRN6P32786 TIR1YER011W 765 nt14.37□□□□□ -0.11
RRN6P32786 YJR018WYJR018W 363 nt14.31□□□□□ -0.12
RRN6P32786 BSC6YOL137W 1494 nt14.29□□□□□ -0.12
RRN6P32786 SSA1YAL005C 1929 nt14.26□□□□□ -0.13
RRN6P32786 PTC2YER089C 1395 nt14.23□□□□□ -0.13
RRN6P32786 BUD23YCR047C 828 nt14.16□□□□□ -0.14
RRN6P32786 YJR120WYJR120W 351 nt14.16□□□□□ -0.14
RRN6P32786 NAB2YGL122C 1578 nt14.08□□□□□ -0.16
RRN6P32786 SRB2YHR041C 633 nt14.05□□□□□ -0.16
RRN6P32786 RPP2BYDR382W 333 nt13.94□□□□□ -0.18
RRN6P32786 FIS1YIL065C 468 nt13.91□□□□□ -0.18
RRN6P32786 SHU1YHL006C 453 nt13.9□□□□□ -0.18
RRN6P32786 DAL1YIR027C 1383 nt13.87□□□□□ -0.19
RRN6P32786 SPT5YML010W 3192 nt13.85□□□□□ -0.19
RRN6P32786 INM2YDR287W 879 nt13.81□□□□□ -0.2
RRN6P32786 YKL097CYKL097C 411 nt13.77□□□□□ -0.21
RRN6P32786 FPR4YLR449W 1179 nt13.77□□□□□ -0.21
RRN6P32786 PHO4YFR034C 939 nt13.74□□□□□ -0.21
RRN6P32786 WWM1YFL010C 636 nt13.72□□□□□ -0.21
RRN6P32786 BDH2YAL061W 1254 nt13.71□□□□□ -0.21
RRN6P32786 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.7□□□□□ -0.22
RRN6P32786 YBL100CYBL100C 315 nt13.66□□□□□ -0.22
RRN6P32786 YGR021WYGR021W 873 nt13.58□□□□□ -0.24
RRN6P32786 HOM6YJR139C 1080 nt13.58□□□□□ -0.24
RRN6P32786 YPS1YLR120C 1710 nt13.55□□□□□ -0.24
RRN6P32786 FUN26YAL022C 1554 nt13.52□□□□□ -0.25
RRN6P32786 LSM3YLR438C-A 270 nt13.51□□□□□ -0.25
RRN6P32786 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.5□□□□□ -0.25
RRN6P32786 MNP1YGL068W 585 nt13.47□□□□□ -0.25
RRN6P32786 MEP2YNL142W 1500 nt13.44□□□□□ -0.26
RRN6P32786 YDR095CYDR095C 411 nt13.43□□□□□ -0.26
RRN6P32786 TRM9YML014W 840 nt13.43□□□□□ -0.26
RRN6P32786 CCT6YDR188W 1641 nt13.36□□□□□ -0.27
RRN6P32786 RKM5YLR137W 1104 nt13.36□□□□□ -0.27
RRN6P32786 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.33□□□□□ -0.28
RRN6P32786 YOR139CYOR139C 393 nt13.31□□□□□ -0.28
RRN6P32786 SSA4YER103W 1929 nt13.29□□□□□ -0.28
RRN6P32786 ALF1YNL148C 765 nt13.28□□□□□ -0.28
RRN6P32786 DCW1YKL046C 1350 nt13.24□□□□□ -0.29
RRN6P32786 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.19□□□□□ -0.3
RRN6P32786 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.19□□□□□ -0.3
RRN6P32786 PTP1YDL230W 1008 nt13.18□□□□□ -0.3
RRN6P32786 SIS1YNL007C 1059 nt13.18□□□□□ -0.3
RRN6P32786 YOL037CYOL037C 354 nt13.18□□□□□ -0.3
RRN6P32786 RPP2AYOL039W 321 nt13.17□□□□□ -0.3
RRN6P32786 NPL3YDR432W 1245 nt13.14□□□□□ -0.31
RRN6P32786 CAC2YML102W 1407 nt13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.3 ms