Protein–RNA interactions for Protein: Q06682

UBX5, UBX domain-containing protein 5, yeastyeast

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX5Q06682 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.48■■□□□ 1.35
UBX5Q06682 NOP1YDL014W 984 nt22.95■■□□□ 1.26
UBX5Q06682 NSR1YGR159C 1245 nt22.91■■□□□ 1.26
UBX5Q06682 YKL036CYKL036C 393 nt21.6■■□□□ 1.05
UBX5Q06682 YJL027CYJL027C 417 nt20.26■□□□□ 0.83
UBX5Q06682 Q0297Q0297 156 nt20.23■□□□□ 0.83
UBX5Q06682 SRX1YKL086W 384 nt20.06■□□□□ 0.8
UBX5Q06682 MDJ1YFL016C 1536 nt20.02■□□□□ 0.8
UBX5Q06682 SCS3YGL126W 1143 nt19.9■□□□□ 0.78
UBX5Q06682 YCR051WYCR051W 669 nt19.11■□□□□ 0.65
UBX5Q06682 YOL085CYOL085C 342 nt18.71■□□□□ 0.59
UBX5Q06682 PKP1YIL042C 1185 nt18.42■□□□□ 0.54
UBX5Q06682 RPP1BYDL130W 321 nt18.18■□□□□ 0.5
UBX5Q06682 SCJ1YMR214W 1134 nt18.11■□□□□ 0.49
UBX5Q06682 ATS1YAL020C 1002 nt17.91■□□□□ 0.46
UBX5Q06682 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.89■□□□□ 0.45
UBX5Q06682 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.89■□□□□ 0.45
UBX5Q06682 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.89■□□□□ 0.45
UBX5Q06682 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.89■□□□□ 0.45
UBX5Q06682 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.89■□□□□ 0.45
UBX5Q06682 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.89■□□□□ 0.45
UBX5Q06682 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.89■□□□□ 0.45
UBX5Q06682 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.89■□□□□ 0.45
UBX5Q06682 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.89■□□□□ 0.45
UBX5Q06682 DBP2YNL112W 1641 nt17.86■□□□□ 0.45
UBX5Q06682 CCC1YLR220W 969 nt17.77■□□□□ 0.44
UBX5Q06682 PET122YER153C 765 nt17.34■□□□□ 0.37
UBX5Q06682 SCR1SCR1 522 nt17.23■□□□□ 0.35
UBX5Q06682 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.09■□□□□ 0.33
UBX5Q06682 YBR190WYBR190W 312 nt16.9■□□□□ 0.3
UBX5Q06682 RRN5YLR141W 1092 nt16.88■□□□□ 0.29
UBX5Q06682 RVS167YDR388W 1449 nt16.84■□□□□ 0.29
UBX5Q06682 RSB1YOR049C 1065 nt16.66■□□□□ 0.26
UBX5Q06682 RTC3YHR087W 336 nt16.58■□□□□ 0.24
UBX5Q06682 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.55■□□□□ 0.24
UBX5Q06682 PST2YDR032C 597 nt16.52■□□□□ 0.24
UBX5Q06682 YDJ1YNL064C 1230 nt16.49■□□□□ 0.23
UBX5Q06682 SHR5YOL110W 714 nt16.37■□□□□ 0.21
UBX5Q06682 GAR1YHR089C 618 nt16.11■□□□□ 0.17
UBX5Q06682 YKL097CYKL097C 411 nt16.09■□□□□ 0.17
UBX5Q06682 DEP1YAL013W 1218 nt15.83■□□□□ 0.12
UBX5Q06682 SHU1YHL006C 453 nt15.76■□□□□ 0.11
UBX5Q06682 URN1YPR152C 1398 nt15.67■□□□□ 0.1
UBX5Q06682 Q0182Q0182 405 nt15.66■□□□□ 0.1
UBX5Q06682 YNL208WYNL208W 600 nt15.57■□□□□ 0.08
UBX5Q06682 TIR1YER011W 765 nt15.53■□□□□ 0.08
UBX5Q06682 RPN10YHR200W 807 nt15.5■□□□□ 0.07
UBX5Q06682 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.43■□□□□ 0.06
UBX5Q06682 YOR139CYOR139C 393 nt15.38■□□□□ 0.05
UBX5Q06682 OPI9YLR338W 858 nt15.35■□□□□ 0.05
UBX5Q06682 SSA1YAL005C 1929 nt15.27■□□□□ 0.04
UBX5Q06682 SAH1YER043C 1350 nt15.17■□□□□ 0.02
UBX5Q06682 NPL3YDR432W 1245 nt15.14■□□□□ 0.01
UBX5Q06682 SRB2YHR041C 633 nt15.14■□□□□ 0.01
UBX5Q06682 PUT4YOR348C 1884 nt15.06■□□□□ 0
UBX5Q06682 YJR018WYJR018W 363 nt14.98□□□□□ -0.01
UBX5Q06682 MOT3YMR070W 1473 nt14.97□□□□□ -0.01
UBX5Q06682 MNP1YGL068W 585 nt14.96□□□□□ -0.01
UBX5Q06682 WWM1YFL010C 636 nt14.94□□□□□ -0.02
UBX5Q06682 YGR021WYGR021W 873 nt14.93□□□□□ -0.02
UBX5Q06682 HOM6YJR139C 1080 nt14.93□□□□□ -0.02
UBX5Q06682 ARE1YCR048W 1833 nt14.92□□□□□ -0.02
UBX5Q06682 PUN1YLR414C 792 nt14.9□□□□□ -0.02
UBX5Q06682 YJR120WYJR120W 351 nt14.88□□□□□ -0.03
UBX5Q06682 YOL037CYOL037C 354 nt14.82□□□□□ -0.04
UBX5Q06682 RPP2BYDR382W 333 nt14.76□□□□□ -0.05
UBX5Q06682 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.75□□□□□ -0.05
UBX5Q06682 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.75□□□□□ -0.05
UBX5Q06682 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.75□□□□□ -0.05
UBX5Q06682 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.75□□□□□ -0.05
UBX5Q06682 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.75□□□□□ -0.05
UBX5Q06682 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.74□□□□□ -0.05
UBX5Q06682 RKM5YLR137W 1104 nt14.72□□□□□ -0.05
UBX5Q06682 PTC2YER089C 1395 nt14.66□□□□□ -0.06
UBX5Q06682 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.65□□□□□ -0.06
UBX5Q06682 POA1YBR022W 534 nt14.64□□□□□ -0.07
UBX5Q06682 SSA3YBL075C 1950 nt14.58□□□□□ -0.07
UBX5Q06682 BDH2YAL061W 1254 nt14.56□□□□□ -0.08
UBX5Q06682 PUS2YGL063W 1113 nt14.5□□□□□ -0.09
UBX5Q06682 YLR281CYLR281C 468 nt14.47□□□□□ -0.09
UBX5Q06682 BUD23YCR047C 828 nt14.44□□□□□ -0.1
UBX5Q06682 LSM3YLR438C-A 270 nt14.43□□□□□ -0.1
UBX5Q06682 NAB2YGL122C 1578 nt14.39□□□□□ -0.11
UBX5Q06682 WHI5YOR083W 888 nt14.37□□□□□ -0.11
UBX5Q06682 INM2YDR287W 879 nt14.36□□□□□ -0.11
UBX5Q06682 YBL100CYBL100C 315 nt14.32□□□□□ -0.12
UBX5Q06682 FPR4YLR449W 1179 nt14.3□□□□□ -0.12
UBX5Q06682 DAL1YIR027C 1383 nt14.29□□□□□ -0.12
UBX5Q06682 FIS1YIL065C 468 nt14.26□□□□□ -0.13
UBX5Q06682 BSC6YOL137W 1494 nt14.25□□□□□ -0.13
UBX5Q06682 TRM9YML014W 840 nt14.21□□□□□ -0.13
UBX5Q06682 PHO4YFR034C 939 nt14.17□□□□□ -0.14
UBX5Q06682 FUN26YAL022C 1554 nt14.17□□□□□ -0.14
UBX5Q06682 YPR011CYPR011C 981 nt14.15□□□□□ -0.14
UBX5Q06682 FMP45YDL222C 930 nt14.13□□□□□ -0.15
UBX5Q06682 DSK2YMR276W 1122 nt14.11□□□□□ -0.15
UBX5Q06682 YLR236CYLR236C 324 nt14.08□□□□□ -0.16
UBX5Q06682 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.04□□□□□ -0.16
UBX5Q06682 CCT6YDR188W 1641 nt14.03□□□□□ -0.16
UBX5Q06682 YCH1YGR203W 447 nt13.99□□□□□ -0.17
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