Protein–RNA interactions for Protein: Q06063

DUS4, tRNA-dihydrouridine(20a/20b) synthase [NAD(P)+], yeastyeast

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DUS4Q06063 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.17■■□□□ 1.3
DUS4Q06063 NOP1YDL014W 984 nt22.66■■□□□ 1.22
DUS4Q06063 NSR1YGR159C 1245 nt22.62■■□□□ 1.21
DUS4Q06063 YKL036CYKL036C 393 nt21.37■■□□□ 1.01
DUS4Q06063 YJL027CYJL027C 417 nt20.04■□□□□ 0.8
DUS4Q06063 Q0297Q0297 156 nt20.03■□□□□ 0.8
DUS4Q06063 SRX1YKL086W 384 nt19.85■□□□□ 0.77
DUS4Q06063 SCS3YGL126W 1143 nt19.72■□□□□ 0.75
DUS4Q06063 MDJ1YFL016C 1536 nt19.7■□□□□ 0.74
DUS4Q06063 YCR051WYCR051W 669 nt18.86■□□□□ 0.61
DUS4Q06063 YOL085CYOL085C 342 nt18.52■□□□□ 0.56
DUS4Q06063 PKP1YIL042C 1185 nt18.2■□□□□ 0.5
DUS4Q06063 SCJ1YMR214W 1134 nt17.99■□□□□ 0.47
DUS4Q06063 RPP1BYDL130W 321 nt17.97■□□□□ 0.47
DUS4Q06063 ATS1YAL020C 1002 nt17.75■□□□□ 0.43
DUS4Q06063 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.7■□□□□ 0.42
DUS4Q06063 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.7■□□□□ 0.42
DUS4Q06063 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.7■□□□□ 0.42
DUS4Q06063 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.7■□□□□ 0.42
DUS4Q06063 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.7■□□□□ 0.42
DUS4Q06063 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.7■□□□□ 0.42
DUS4Q06063 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.7■□□□□ 0.42
DUS4Q06063 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.7■□□□□ 0.42
DUS4Q06063 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.7■□□□□ 0.42
DUS4Q06063 DBP2YNL112W 1641 nt17.64■□□□□ 0.41
DUS4Q06063 CCC1YLR220W 969 nt17.51■□□□□ 0.39
DUS4Q06063 PET122YER153C 765 nt17.14■□□□□ 0.33
DUS4Q06063 SCR1SCR1 522 nt17.03■□□□□ 0.32
DUS4Q06063 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.88■□□□□ 0.29
DUS4Q06063 RRN5YLR141W 1092 nt16.69■□□□□ 0.26
DUS4Q06063 YBR190WYBR190W 312 nt16.64■□□□□ 0.25
DUS4Q06063 RVS167YDR388W 1449 nt16.6■□□□□ 0.25
DUS4Q06063 RSB1YOR049C 1065 nt16.46■□□□□ 0.23
DUS4Q06063 RTC3YHR087W 336 nt16.39■□□□□ 0.21
DUS4Q06063 PST2YDR032C 597 nt16.37■□□□□ 0.21
DUS4Q06063 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.37■□□□□ 0.21
DUS4Q06063 YDJ1YNL064C 1230 nt16.32■□□□□ 0.2
DUS4Q06063 SHR5YOL110W 714 nt16.16■□□□□ 0.18
DUS4Q06063 YKL097CYKL097C 411 nt15.94■□□□□ 0.14
DUS4Q06063 GAR1YHR089C 618 nt15.89■□□□□ 0.13
DUS4Q06063 SHU1YHL006C 453 nt15.61■□□□□ 0.09
DUS4Q06063 DEP1YAL013W 1218 nt15.57■□□□□ 0.08
DUS4Q06063 URN1YPR152C 1398 nt15.44■□□□□ 0.06
DUS4Q06063 YNL208WYNL208W 600 nt15.35■□□□□ 0.05
DUS4Q06063 TIR1YER011W 765 nt15.34■□□□□ 0.05
DUS4Q06063 YOR139CYOR139C 393 nt15.27■□□□□ 0.04
DUS4Q06063 RPN10YHR200W 807 nt15.26■□□□□ 0.03
DUS4Q06063 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.24■□□□□ 0.03
DUS4Q06063 OPI9YLR338W 858 nt15.12■□□□□ 0.01
DUS4Q06063 SSA1YAL005C 1929 nt15.09■□□□□ 0.01
DUS4Q06063 PUT4YOR348C 1884 nt15.08■□□□□ 0
DUS4Q06063 NPL3YDR432W 1245 nt14.97□□□□□ -0.01
DUS4Q06063 SRB2YHR041C 633 nt14.97□□□□□ -0.01
DUS4Q06063 SAH1YER043C 1350 nt14.92□□□□□ -0.02
DUS4Q06063 ARE1YCR048W 1833 nt14.83□□□□□ -0.04
DUS4Q06063 MNP1YGL068W 585 nt14.8□□□□□ -0.04
DUS4Q06063 HOM6YJR139C 1080 nt14.78□□□□□ -0.04
DUS4Q06063 WWM1YFL010C 636 nt14.76□□□□□ -0.05
DUS4Q06063 YGR021WYGR021W 873 nt14.76□□□□□ -0.05
DUS4Q06063 YJR018WYJR018W 363 nt14.75□□□□□ -0.05
DUS4Q06063 YJR120WYJR120W 351 nt14.69□□□□□ -0.06
DUS4Q06063 YOL037CYOL037C 354 nt14.68□□□□□ -0.06
DUS4Q06063 PUN1YLR414C 792 nt14.67□□□□□ -0.06
DUS4Q06063 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.63□□□□□ -0.07
DUS4Q06063 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.63□□□□□ -0.07
DUS4Q06063 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.63□□□□□ -0.07
DUS4Q06063 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.63□□□□□ -0.07
DUS4Q06063 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.63□□□□□ -0.07
DUS4Q06063 POA1YBR022W 534 nt14.6□□□□□ -0.07
DUS4Q06063 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.59□□□□□ -0.07
DUS4Q06063 RKM5YLR137W 1104 nt14.56□□□□□ -0.08
DUS4Q06063 RPP2BYDR382W 333 nt14.54□□□□□ -0.08
DUS4Q06063 SSA3YBL075C 1950 nt14.48□□□□□ -0.09
DUS4Q06063 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.48□□□□□ -0.09
DUS4Q06063 PTC2YER089C 1395 nt14.43□□□□□ -0.1
DUS4Q06063 BDH2YAL061W 1254 nt14.36□□□□□ -0.11
DUS4Q06063 PUS2YGL063W 1113 nt14.34□□□□□ -0.11
DUS4Q06063 YLR281CYLR281C 468 nt14.33□□□□□ -0.12
DUS4Q06063 BSC6YOL137W 1494 nt14.26□□□□□ -0.13
DUS4Q06063 LSM3YLR438C-A 270 nt14.25□□□□□ -0.13
DUS4Q06063 BUD23YCR047C 828 nt14.24□□□□□ -0.13
DUS4Q06063 MOT3YMR070W 1473 nt14.23□□□□□ -0.13
DUS4Q06063 WHI5YOR083W 888 nt14.21□□□□□ -0.13
DUS4Q06063 NAB2YGL122C 1578 nt14.15□□□□□ -0.14
DUS4Q06063 INM2YDR287W 879 nt14.14□□□□□ -0.15
DUS4Q06063 YBL100CYBL100C 315 nt14.1□□□□□ -0.15
DUS4Q06063 DAL1YIR027C 1383 nt14.07□□□□□ -0.16
DUS4Q06063 FIS1YIL065C 468 nt14.05□□□□□ -0.16
DUS4Q06063 FPR4YLR449W 1179 nt14.04□□□□□ -0.16
DUS4Q06063 YPR011CYPR011C 981 nt14.02□□□□□ -0.17
DUS4Q06063 TRM9YML014W 840 nt13.99□□□□□ -0.17
DUS4Q06063 FMP45YDL222C 930 nt13.98□□□□□ -0.17
DUS4Q06063 FUN26YAL022C 1554 nt13.96□□□□□ -0.17
DUS4Q06063 DSK2YMR276W 1122 nt13.96□□□□□ -0.17
DUS4Q06063 PHO4YFR034C 939 nt13.95□□□□□ -0.18
DUS4Q06063 YLR236CYLR236C 324 nt13.95□□□□□ -0.18
DUS4Q06063 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.87□□□□□ -0.19
DUS4Q06063 YCH1YGR203W 447 nt13.85□□□□□ -0.19
DUS4Q06063 IMP2'YIL154C 1041 nt13.85□□□□□ -0.19
DUS4Q06063 CCT6YDR188W 1641 nt13.85□□□□□ -0.19
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