Protein–RNA interactions for Protein: Q12746

PGA3, Plasma membrane-associated coenzyme Q6 reductase PGA3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PGA3Q12746 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.79■■□□□ 1.4
PGA3Q12746 NSR1YGR159C 1245 nt23.69■■□□□ 1.38
PGA3Q12746 NOP1YDL014W 984 nt23.01■■□□□ 1.27
PGA3Q12746 YKL036CYKL036C 393 nt21.27■■□□□ 1
PGA3Q12746 MDJ1YFL016C 1536 nt21.18■□□□□ 0.98
PGA3Q12746 Q0297Q0297 156 nt20.25■□□□□ 0.83
PGA3Q12746 SRX1YKL086W 384 nt20.21■□□□□ 0.83
PGA3Q12746 YJL027CYJL027C 417 nt19.82■□□□□ 0.76
PGA3Q12746 SCS3YGL126W 1143 nt19.4■□□□□ 0.7
PGA3Q12746 YCR051WYCR051W 669 nt19.12■□□□□ 0.65
PGA3Q12746 DBP2YNL112W 1641 nt18.8■□□□□ 0.6
PGA3Q12746 YOL085CYOL085C 342 nt18.5■□□□□ 0.55
PGA3Q12746 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.35■□□□□ 0.53
PGA3Q12746 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.35■□□□□ 0.53
PGA3Q12746 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.35■□□□□ 0.53
PGA3Q12746 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.35■□□□□ 0.53
PGA3Q12746 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.35■□□□□ 0.53
PGA3Q12746 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.35■□□□□ 0.53
PGA3Q12746 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.35■□□□□ 0.53
PGA3Q12746 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.35■□□□□ 0.53
PGA3Q12746 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.35■□□□□ 0.53
PGA3Q12746 PKP1YIL042C 1185 nt18.23■□□□□ 0.51
PGA3Q12746 RPP1BYDL130W 321 nt18.15■□□□□ 0.5
PGA3Q12746 CCC1YLR220W 969 nt18.11■□□□□ 0.49
PGA3Q12746 YBR190WYBR190W 312 nt17.99■□□□□ 0.47
PGA3Q12746 SCJ1YMR214W 1134 nt17.55■□□□□ 0.4
PGA3Q12746 RTC3YHR087W 336 nt17.52■□□□□ 0.4
PGA3Q12746 PET122YER153C 765 nt17.41■□□□□ 0.38
PGA3Q12746 RVS167YDR388W 1449 nt17.38■□□□□ 0.37
PGA3Q12746 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.33■□□□□ 0.36
PGA3Q12746 ATS1YAL020C 1002 nt17.32■□□□□ 0.36
PGA3Q12746 SCR1SCR1 522 nt17.03■□□□□ 0.32
PGA3Q12746 SHR5YOL110W 714 nt16.89■□□□□ 0.29
PGA3Q12746 RRN5YLR141W 1092 nt16.88■□□□□ 0.29
PGA3Q12746 YDJ1YNL064C 1230 nt16.74■□□□□ 0.27
PGA3Q12746 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.57■□□□□ 0.24
PGA3Q12746 PUT4YOR348C 1884 nt16.48■□□□□ 0.23
PGA3Q12746 DEP1YAL013W 1218 nt16.47■□□□□ 0.23
PGA3Q12746 URN1YPR152C 1398 nt16.46■□□□□ 0.23
PGA3Q12746 RSB1YOR049C 1065 nt16.45■□□□□ 0.22
PGA3Q12746 GAR1YHR089C 618 nt16.38■□□□□ 0.21
PGA3Q12746 OPI9YLR338W 858 nt16.25■□□□□ 0.19
PGA3Q12746 SAH1YER043C 1350 nt16.19■□□□□ 0.18
PGA3Q12746 ARE1YCR048W 1833 nt16.17■□□□□ 0.18
PGA3Q12746 YNL208WYNL208W 600 nt16.13■□□□□ 0.17
PGA3Q12746 PST2YDR032C 597 nt16.1■□□□□ 0.17
PGA3Q12746 RPN10YHR200W 807 nt16.06■□□□□ 0.16
PGA3Q12746 POA1YBR022W 534 nt15.92■□□□□ 0.14
PGA3Q12746 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.9■□□□□ 0.14
PGA3Q12746 TIR1YER011W 765 nt15.83■□□□□ 0.12
PGA3Q12746 SSA1YAL005C 1929 nt15.73■□□□□ 0.11
PGA3Q12746 PUN1YLR414C 792 nt15.7■□□□□ 0.1
PGA3Q12746 YJR018WYJR018W 363 nt15.68■□□□□ 0.1
PGA3Q12746 YJR120WYJR120W 351 nt15.64■□□□□ 0.09
PGA3Q12746 SRB2YHR041C 633 nt15.62■□□□□ 0.09
PGA3Q12746 BSC6YOL137W 1494 nt15.59■□□□□ 0.09
PGA3Q12746 PTC2YER089C 1395 nt15.58■□□□□ 0.08
PGA3Q12746 BUD23YCR047C 828 nt15.47■□□□□ 0.07
PGA3Q12746 SHU1YHL006C 453 nt15.47■□□□□ 0.07
PGA3Q12746 SSA3YBL075C 1950 nt15.47■□□□□ 0.07
PGA3Q12746 NAB2YGL122C 1578 nt15.34■□□□□ 0.05
PGA3Q12746 YKL097CYKL097C 411 nt15.32■□□□□ 0.04
PGA3Q12746 FIS1YIL065C 468 nt15.25■□□□□ 0.03
PGA3Q12746 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.25■□□□□ 0.03
PGA3Q12746 RPP2BYDR382W 333 nt15.24■□□□□ 0.03
PGA3Q12746 WWM1YFL010C 636 nt15.18■□□□□ 0.02
PGA3Q12746 DAL1YIR027C 1383 nt15.14■□□□□ 0.01
PGA3Q12746 INM2YDR287W 879 nt15.09■□□□□ 0.01
PGA3Q12746 FPR4YLR449W 1179 nt15.07■□□□□ 0
PGA3Q12746 PHO4YFR034C 939 nt15.05■□□□□ -0
PGA3Q12746 SPT5YML010W 3192 nt15.05■□□□□ -0
PGA3Q12746 BDH2YAL061W 1254 nt15.04■□□□□ -0
PGA3Q12746 HOM6YJR139C 1080 nt15.02■□□□□ -0
PGA3Q12746 YBL100CYBL100C 315 nt14.97□□□□□ -0.01
PGA3Q12746 MNP1YGL068W 585 nt14.96□□□□□ -0.01
PGA3Q12746 YGR021WYGR021W 873 nt14.94□□□□□ -0.02
PGA3Q12746 YOR139CYOR139C 393 nt14.88□□□□□ -0.03
PGA3Q12746 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.86□□□□□ -0.03
PGA3Q12746 FUN26YAL022C 1554 nt14.82□□□□□ -0.04
PGA3Q12746 LSM3YLR438C-A 270 nt14.81□□□□□ -0.04
PGA3Q12746 YPS1YLR120C 1710 nt14.78□□□□□ -0.04
PGA3Q12746 RKM5YLR137W 1104 nt14.77□□□□□ -0.05
PGA3Q12746 TRM9YML014W 840 nt14.7□□□□□ -0.06
PGA3Q12746 YDR095CYDR095C 411 nt14.69□□□□□ -0.06
PGA3Q12746 CCT6YDR188W 1641 nt14.63□□□□□ -0.07
PGA3Q12746 MEP2YNL142W 1500 nt14.63□□□□□ -0.07
PGA3Q12746 NPL3YDR432W 1245 nt14.57□□□□□ -0.08
PGA3Q12746 YOL037CYOL037C 354 nt14.57□□□□□ -0.08
PGA3Q12746 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.54□□□□□ -0.08
PGA3Q12746 ALF1YNL148C 765 nt14.51□□□□□ -0.09
PGA3Q12746 DCW1YKL046C 1350 nt14.48□□□□□ -0.09
PGA3Q12746 PTP1YDL230W 1008 nt14.47□□□□□ -0.09
PGA3Q12746 SIS1YNL007C 1059 nt14.44□□□□□ -0.1
PGA3Q12746 SSA4YER103W 1929 nt14.4□□□□□ -0.1
PGA3Q12746 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.39□□□□□ -0.11
PGA3Q12746 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.39□□□□□ -0.11
PGA3Q12746 RPP2AYOL039W 321 nt14.38□□□□□ -0.11
PGA3Q12746 CAC2YML102W 1407 nt14.34□□□□□ -0.11
PGA3Q12746 YLR281CYLR281C 468 nt14.33□□□□□ -0.12
PGA3Q12746 WHI5YOR083W 888 nt14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.6 ms