Protein–RNA interactions for Protein: Q99359

RAD61, Protein RAD61, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RAD61Q99359 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.9■■□□□ 1.42
RAD61Q99359 NSR1YGR159C 1245 nt23.54■■□□□ 1.36
RAD61Q99359 NOP1YDL014W 984 nt23.27■■□□□ 1.32
RAD61Q99359 YKL036CYKL036C 393 nt21.67■■□□□ 1.06
RAD61Q99359 MDJ1YFL016C 1536 nt20.78■□□□□ 0.92
RAD61Q99359 Q0297Q0297 156 nt20.43■□□□□ 0.86
RAD61Q99359 SRX1YKL086W 384 nt20.35■□□□□ 0.85
RAD61Q99359 YJL027CYJL027C 417 nt20.27■□□□□ 0.84
RAD61Q99359 SCS3YGL126W 1143 nt19.82■□□□□ 0.76
RAD61Q99359 YCR051WYCR051W 669 nt19.36■□□□□ 0.69
RAD61Q99359 YOL085CYOL085C 342 nt18.76■□□□□ 0.59
RAD61Q99359 PKP1YIL042C 1185 nt18.51■□□□□ 0.55
RAD61Q99359 DBP2YNL112W 1641 nt18.44■□□□□ 0.54
RAD61Q99359 RPP1BYDL130W 321 nt18.34■□□□□ 0.53
RAD61Q99359 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.29■□□□□ 0.52
RAD61Q99359 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.29■□□□□ 0.52
RAD61Q99359 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.29■□□□□ 0.52
RAD61Q99359 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.29■□□□□ 0.52
RAD61Q99359 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.29■□□□□ 0.52
RAD61Q99359 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.29■□□□□ 0.52
RAD61Q99359 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.29■□□□□ 0.52
RAD61Q99359 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.29■□□□□ 0.52
RAD61Q99359 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.29■□□□□ 0.52
RAD61Q99359 CCC1YLR220W 969 nt18.15■□□□□ 0.5
RAD61Q99359 ATS1YAL020C 1002 nt17.77■□□□□ 0.44
RAD61Q99359 SCJ1YMR214W 1134 nt17.73■□□□□ 0.43
RAD61Q99359 YBR190WYBR190W 312 nt17.63■□□□□ 0.41
RAD61Q99359 PET122YER153C 765 nt17.53■□□□□ 0.4
RAD61Q99359 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.38■□□□□ 0.37
RAD61Q99359 SCR1SCR1 522 nt17.37■□□□□ 0.37
RAD61Q99359 RVS167YDR388W 1449 nt17.37■□□□□ 0.37
RAD61Q99359 RTC3YHR087W 336 nt17.29■□□□□ 0.36
RAD61Q99359 RRN5YLR141W 1092 nt17.05■□□□□ 0.32
RAD61Q99359 SHR5YOL110W 714 nt16.81■□□□□ 0.28
RAD61Q99359 YDJ1YNL064C 1230 nt16.78■□□□□ 0.28
RAD61Q99359 RSB1YOR049C 1065 nt16.76■□□□□ 0.27
RAD61Q99359 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.7■□□□□ 0.26
RAD61Q99359 GAR1YHR089C 618 nt16.43■□□□□ 0.22
RAD61Q99359 PST2YDR032C 597 nt16.42■□□□□ 0.22
RAD61Q99359 DEP1YAL013W 1218 nt16.33■□□□□ 0.2
RAD61Q99359 URN1YPR152C 1398 nt16.25■□□□□ 0.19
RAD61Q99359 YNL208WYNL208W 600 nt16.04■□□□□ 0.16
RAD61Q99359 RPN10YHR200W 807 nt16.02■□□□□ 0.16
RAD61Q99359 OPI9YLR338W 858 nt15.95■□□□□ 0.14
RAD61Q99359 YKL097CYKL097C 411 nt15.88■□□□□ 0.13
RAD61Q99359 PUT4YOR348C 1884 nt15.86■□□□□ 0.13
RAD61Q99359 TIR1YER011W 765 nt15.85■□□□□ 0.13
RAD61Q99359 SAH1YER043C 1350 nt15.83■□□□□ 0.12
RAD61Q99359 SHU1YHL006C 453 nt15.73■□□□□ 0.11
RAD61Q99359 ARE1YCR048W 1833 nt15.64■□□□□ 0.09
RAD61Q99359 SSA1YAL005C 1929 nt15.62■□□□□ 0.09
RAD61Q99359 YJR018WYJR018W 363 nt15.51■□□□□ 0.07
RAD61Q99359 PUN1YLR414C 792 nt15.48■□□□□ 0.07
RAD61Q99359 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.47■□□□□ 0.07
RAD61Q99359 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.47■□□□□ 0.07
RAD61Q99359 POA1YBR022W 534 nt15.43■□□□□ 0.06
RAD61Q99359 SRB2YHR041C 633 nt15.42■□□□□ 0.06
RAD61Q99359 YJR120WYJR120W 351 nt15.32■□□□□ 0.04
RAD61Q99359 PTC2YER089C 1395 nt15.28■□□□□ 0.04
RAD61Q99359 RPP2BYDR382W 333 nt15.24■□□□□ 0.03
RAD61Q99359 YOR139CYOR139C 393 nt15.22■□□□□ 0.03
RAD61Q99359 WWM1YFL010C 636 nt15.2■□□□□ 0.02
RAD61Q99359 BUD23YCR047C 828 nt15.15■□□□□ 0.02
RAD61Q99359 YGR021WYGR021W 873 nt15.12■□□□□ 0.01
RAD61Q99359 HOM6YJR139C 1080 nt15.1■□□□□ 0.01
RAD61Q99359 MNP1YGL068W 585 nt15.09■□□□□ 0.01
RAD61Q99359 NPL3YDR432W 1245 nt15.05■□□□□ -0
RAD61Q99359 BSC6YOL137W 1494 nt15.04■□□□□ -0
RAD61Q99359 NAB2YGL122C 1578 nt15.03■□□□□ -0
RAD61Q99359 BDH2YAL061W 1254 nt14.96□□□□□ -0.01
RAD61Q99359 INM2YDR287W 879 nt14.91□□□□□ -0.02
RAD61Q99359 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.91□□□□□ -0.02
RAD61Q99359 SSA3YBL075C 1950 nt14.91□□□□□ -0.02
RAD61Q99359 FPR4YLR449W 1179 nt14.9□□□□□ -0.02
RAD61Q99359 DAL1YIR027C 1383 nt14.88□□□□□ -0.03
RAD61Q99359 RKM5YLR137W 1104 nt14.88□□□□□ -0.03
RAD61Q99359 YOL037CYOL037C 354 nt14.86□□□□□ -0.03
RAD61Q99359 FIS1YIL065C 468 nt14.85□□□□□ -0.03
RAD61Q99359 YBL100CYBL100C 315 nt14.82□□□□□ -0.04
RAD61Q99359 LSM3YLR438C-A 270 nt14.79□□□□□ -0.04
RAD61Q99359 PHO4YFR034C 939 nt14.75□□□□□ -0.05
RAD61Q99359 TRM9YML014W 840 nt14.66□□□□□ -0.06
RAD61Q99359 FUN26YAL022C 1554 nt14.64□□□□□ -0.07
RAD61Q99359 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.61□□□□□ -0.07
RAD61Q99359 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.61□□□□□ -0.07
RAD61Q99359 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.61□□□□□ -0.07
RAD61Q99359 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.61□□□□□ -0.07
RAD61Q99359 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.61□□□□□ -0.07
RAD61Q99359 YLR281CYLR281C 468 nt14.51□□□□□ -0.09
RAD61Q99359 PUS2YGL063W 1113 nt14.47□□□□□ -0.09
RAD61Q99359 CCT6YDR188W 1641 nt14.47□□□□□ -0.09
RAD61Q99359 WHI5YOR083W 888 nt14.46□□□□□ -0.09
RAD61Q99359 ALF1YNL148C 765 nt14.41□□□□□ -0.1
RAD61Q99359 YPS1YLR120C 1710 nt14.38□□□□□ -0.11
RAD61Q99359 YDR095CYDR095C 411 nt14.33□□□□□ -0.12
RAD61Q99359 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.33□□□□□ -0.12
RAD61Q99359 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.33□□□□□ -0.12
RAD61Q99359 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.3□□□□□ -0.12
RAD61Q99359 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.24□□□□□ -0.13
RAD61Q99359 DSK2YMR276W 1122 nt14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.6 ms